مصنوعات

*یہاں دکھائے گئے ڈیمو نتائج سبھی BMKGENE کے ساتھ شائع شدہ جینوم سے ہیں۔

1. ارتقاء کے تجزیے میں جینیاتی تغیرات کی بنیاد پر فائیلوجنیٹک درخت، آبادی کی ساخت اور PCA کی تعمیر شامل ہے۔

فائیلوجنیٹک درخت مشترکہ آباؤ اجداد کے ساتھ پرجاتیوں کے درمیان درجہ بندی اور ارتقائی تعلقات کی نمائندگی کرتا ہے۔
PCA کا مقصد ذیلی آبادیوں کے درمیان قربت کا تصور کرنا ہے۔
آبادی کا ڈھانچہ ایلیل تعدد کے لحاظ سے جینیاتی طور پر الگ ذیلی آبادی کی موجودگی کو ظاہر کرتا ہے۔

چن، وغیرہ.al.پی این اے ایس، 2020

2. انتخابی جھاڑو

سلیکٹیو سویپ سے مراد ایک ایسا عمل ہے جس کے ذریعے ایک فائدہ مند سائٹ کا انتخاب کیا جاتا ہے اور منسلک نیوٹرل سائٹس کی فریکوئنسی بڑھائی جاتی ہے اور غیر لنک شدہ سائٹس کی تعدد کو کم کیا جاتا ہے، جس کے نتیجے میں علاقائی کمی واقع ہوتی ہے۔

انتخابی جھاڑو والے علاقوں میں جینوم وسیع پتہ لگانے کے لیے مخصوص قدم (10 Kb) پر ایک سلائیڈنگ ونڈو (100 Kb) کے اندر تمام SNPs کی آبادی کے جینیاتی انڈیکس（π，Fst، Tajima's D) کا حساب لگا کر کارروائی کی جاتی ہے۔

نیوکلیوٹائڈ تنوع (π)

تاجیما کی ڈی

فکسیشن انڈیکس (Fst)

وو، وغیرہ۔al.مالیکیولر پلانٹ، 2018

3. جین کا بہاؤ

وو، وغیرہ۔al.مالیکیولر پلانٹ، 2018

4. آبادیاتی تاریخ

ژانگ، وغیرہ.al.فطرت ماحولیات اور ارتقاء، 2021

5. انحراف کا وقت

ژانگ، وغیرہ.al.فطرت ماحولیات اور ارتقاء، 2021

بی ایم کے کیس

جینومک تغیر کا نقشہ بہار چینی گوبھی (براسیکا ریپا ایس ایس پی. پیکینینس) کے انتخاب کی جینیاتی بنیاد پر بصیرت فراہم کرتا ہے۔

شائع شدہ: مالیکیولر پلانٹ، 2018

ترتیب کی حکمت عملی:

ریسیونسینگ: گہرائی کی ترتیب: 10×

کلیدی نتائج

اس تحقیق میں، 194 چینی گوبھیوں کو 10× کی اوسط گہرائی کے ساتھ دوبارہ ترتیب دینے کے لیے پروسیس کیا گیا، جس سے 1,208,499 SNPs اور 416,070 InDels حاصل ہوئے۔ان 194 لائنوں پر فائیلوجنیٹک تجزیہ سے پتہ چلتا ہے کہ ان لائنوں کو تین ایکوٹائپس، بہار، موسم گرما اور خزاں میں تقسیم کیا جا سکتا ہے۔اس کے علاوہ، آبادی کے ڈھانچے اور پی سی اے کے تجزیے نے اشارہ کیا کہ موسم بہار کی چینی گوبھی چین کے شہر شیڈونگ میں خزاں کی گوبھی سے پیدا ہوئی تھی۔یہ بعد میں کوریا اور جاپان میں متعارف کرائے گئے، مقامی لائنوں کے ساتھ کراس کیے گئے اور ان میں سے کچھ دیر سے بولٹ کرنے والی قسمیں واپس چین میں متعارف کرائی گئیں اور آخر کار اسپرنگ چینی گوبھی بن گئیں۔

انتخاب پر موسم بہار کی چینی گوبھیوں اور خزاں کی گوبھیوں پر جینوم وسیع اسکیننگ سے 23 جینومک لوکی کا انکشاف ہوا جو مضبوط انتخاب سے گزرے ہیں، جن میں سے دو QTL-میپنگ کی بنیاد پر بولٹنگ ٹائم کنٹرولنگ ریجن کے ساتھ اوورلیپ تھے۔ان دونوں خطوں میں کلیدی جینز پائے گئے جو پھولوں کو منظم کرتے ہیں، BrVIN3.1 اور BrFLC1۔ٹرانسکرپٹوم اسٹڈی اور ٹرانسجینک تجربات کے ذریعہ ان دونوں جینوں کے بولٹنگ ٹائم میں شامل ہونے کی مزید تصدیق ہوگئی۔

چینی گوبھیوں پر آبادی کی ساخت کا تجزیہ

چینی گوبھی کے انتخاب پر جینیاتی معلومات