●پلیٹ فارمز:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten اور BGI-DNB-T7
●ترتیب دینے کے طریقے:PE50, PE100, PE150, PE250
●ترتیب سے پہلے لائبریریوں کا کوالٹی کنٹرول
●ترتیب ڈیٹا کی ترسیل اور QC:Q30 ریڈز کو ڈی ملٹی پلیکسنگ اور فلٹر کرنے کے بعد فاسٹ کیو فارمیٹ میں QC رپورٹ اور خام ڈیٹا کی ترسیل۔
●تسلسل کی خدمات کی استعداد:صارف لین، فلو سیل یا ڈیٹا کی مقدار کے حساب سے ترتیب کا انتخاب کر سکتا ہے۔
●پلیٹ فارم کی استعداد:DNB لائبریریوں کو Illumina پلیٹ فارم پر منتقل کیا جا سکتا ہے۔
●ایلومینا سیکوینسنگ پلیٹ فارم پر وسیع تجربہ:مختلف پرجاتیوں کے ساتھ ہزاروں بند منصوبوں کے ساتھ۔
●ترتیب وار QC رپورٹ کی فراہمی:کوالٹی میٹرکس، ڈیٹا کی درستگی اور ترتیب دینے والے پروجیکٹ کی مجموعی کارکردگی کے ساتھ۔
●بالغ ترتیب کا عمل:مختصر موڑ کے ارد گرد وقت کے ساتھ.
●سخت کوالٹی کنٹرول: ہم مسلسل اعلیٰ معیار کے نتائج کی فراہمی کی ضمانت کے لیے سخت QC تقاضوں کو نافذ کرتے ہیں۔
ڈیٹا کی مقدار (X) | ارتکاز (qPCR/nM) | حجم |
X ≤ 50 جی بی | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
پلیٹ فارم | ارتکاز (qPCR/nM) | حجم |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
ارتکاز اور کل رقم کے علاوہ، ایک مناسب چوٹی پیٹرن کی بھی ضرورت ہے۔
لائبریری کے معیار کے بارے میں ایک رپورٹ ترتیب دینے، لائبریری کی رقم کا اندازہ لگانے اور ٹکڑے کرنے سے پہلے فراہم کی جاتی ہے۔
جدول 1۔ ڈیٹا کو ترتیب دینے کے اعدادوشمار۔
نمونہ ID | BMKID | خام پڑھتا ہے۔ | خام ڈیٹا (بی پی) | کلین ریڈز (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
تصویر 1. ہر نمونے میں پڑھنے کے ساتھ معیار کی تقسیم
شکل 2. بنیادی مواد کی تقسیم
شکل 3. ترتیب وار ڈیٹا میں پڑھنے والے مواد کی تقسیم