مصنوعات

*یہاں دکھائے گئے ڈیمو نتائج سبھی Biomarker Technologies کے ساتھ شائع شدہ جینوم سے ہیں۔

1.LTR داخل کرنے کے وقت کا تخمینہ: اعداد و شمار نے دیگر پرجاتیوں کے مقابلے، ویننگ رائی جینوم میں LTR-RTs داخل کرنے کے اوقات میں ایک منفرد بائی موڈل تقسیم دکھایا ہے۔سب سے حالیہ چوٹی لگ بھگ 0.5 ملین سال پہلے نمودار ہوئی۔

لی گوانگ وغیرہ،نیچر جینیٹکس، 2021

Chayote (Sechium edule) پر فائیلوجینی اور جین فیملی تجزیہ: جین فیملی میں چایوٹی اور دیگر 13 متعلقہ پرجاتیوں کا تجزیہ کرنے سے، چایوٹے کا سانپ کے لوکی (Trichosanthes anguina) کے ساتھ سب سے زیادہ قریبی تعلق پایا گیا۔27-45 Mya میں سانپ کے لوکی سے حاصل شدہ چایوٹی اور مکمل جینوم ڈپلیکیشن (WGD) 25±4 Mya میں chayote میں دیکھی گئی، جو cucuibitaceae میں WGD کا تیسرا واقعہ ہے۔

فو اے وغیرہ،باغبانی کی تحقیق، 2021

3.Synteny تجزیہ: پھلوں کی نشوونما میں فائٹو ہارمونز سے متعلق کچھ جینز چایوٹے، سانپ لوکی اور اسکواش میں پائے گئے۔chayote اور squash کے درمیان تعلق chayote اور snake gourd کے درمیان نسبت تھوڑا زیادہ ہے۔

فو اے وغیرہ،باغبانی کی تحقیق، 2021

4.جین خاندانی تجزیہ: G.thurberi اور G.davidsonii جینوم میں جین فیملی کی توسیع اور سکڑاؤ پر KEGG افزودگی سے پتہ چلتا ہے کہ سٹیرایڈ بایو سنتھیسس اور براسینوسٹیرائڈ بائیو سنتھیسس سے متعلق جینز کو پھیلایا گیا تھا۔

یانگ زیڈ وغیرہ،بی ایم سی حیاتیات، 2021

5. مکمل جینوم ڈپلیکیشن تجزیہ: 4DTV اور Ks ڈسٹری بیوشن تجزیہ میں مکمل جینوم ڈپلیکیشن کا واقعہ دکھایا گیا ہے۔intraspecies کی چوٹیوں نے نقلی واقعات کو دکھایا۔انواع کی چوٹیوں نے انواع و اقسام کے واقعات دکھائے۔تجزیہ نے اشارہ کیا کہ دیگر تین قریب سے متعلق پرجاتیوں کے ساتھ موازنہ کرتے ہوئے، O. europaea حال ہی میں بڑے پیمانے پر جین کی نقل سے گزرا ہے۔

راؤ جی وغیرہ،باغبانی کی تحقیق، 2021

بی ایم کے کیس

کانٹے کے بغیر گلاب: نمی کے موافقت سے منسلک جینومک بصیرت

شائع شدہ: قومی سائنس کا جائزہ، 2021

ترتیب کی حکمت عملی:

باسی کیکانٹے کے بغیر' (آر.وچورائننجینوم:
تقریبا.93 X PacBio + تقریبا90 ایکس نینو پور + 267 ایکس ایلومینا۔

کلیدی نتائج

1. اعلیٰ معیار کا R.wichuraiana جینوم طویل پڑھی جانے والی ترتیب سازی کی تکنیکوں کا استعمال کرتے ہوئے بنایا گیا تھا، جس سے 530.07 Mb کی اسمبلی حاصل ہوتی ہے (تخمینہ جینوم کا سائز تقریباً 525.9 Mb بہاؤ سائٹومیٹری اور 525.5 بذریعہ جینوم سروے) تقریباً 3.3 فیصد تھا۔BUSCO کا تخمینہ اسکور 93.9% تھا۔"اولڈ بلش" (haploOB) کے ساتھ موازنہ کرتے ہوئے، اس جینوم کے معیار اور مکمل ہونے کی تصدیق بنیادی سنگل بیس درستگی اور LTR اسمبلی انڈیکس (LAI=20.03) سے ہوئی۔R.wichuraiana جینوم میں 32,674 پروٹین کوڈنگ جین ہوتے ہیں۔

2. ملٹی اومکس مشترکہ تجزیہ، جس میں تقابلی جینومکس، ٹرانسکرپٹومکس، جینیاتی آبادی کا QTL تجزیہ شامل ہے، نے R. wichuraiana اور Rosa chinensis کے درمیان اہم قیاس آرائی کا انکشاف کیا۔نیز ، QTL میں متعلقہ جینوں کے اظہار کی مختلف حالتوں کا امکان اسٹیم پرکل پیٹرننگ سے وابستہ تھا۔

Basye؛s Thornless اور Rosa chinensis کے درمیان تقابلی جینومکس کے تجزیے بشمول synteny analysis، gene family cluster، expansion and contraction analysis، نے بڑی تعداد میں تغیرات کا انکشاف کیا، جن کا تعلق گلاب میں اہم خصلتوں سے ہے۔NAC اور FAR1/FRS جین فیملی میں انوکھی توسیع کا بلیک سپاٹ کے خلاف مزاحمت سے وابستہ ہونے کا بہت امکان تھا۔

Zhong، M.، et al."کانٹوں کے بغیر گلاب: نمی کے موافقت سے منسلک جینومک بصیرت"قومی سائنس کا جائزہ، 2021؛، nwab092۔