Продукти

Секвенування одноядерної РНК

Прогрес у захопленні однієї клітини та техніці побудови індивідуальної бібліотеки в поєднанні з високопродуктивним секвенуванням дозволяє досліджувати експресію генів на основі кожної клітини.Він дає змогу проводити більш глибокий і повний системний аналіз складних клітинних популяцій, у якому значною мірою уникає маскування їх гетерогенності, беручи середнє значення всіх клітин.

Однак деякі клітини непридатні для виготовлення одноклітинної суспензії, тому потрібні інші методи підготовки зразків – екстракція ядра з тканин, тобто ядро витягується безпосередньо з тканин або клітини та готується до одноядерної суспензії для одноклітинної суспензії. секвенування клітин.

BMK надає послугу секвенування одноклітинної РНК 10× Genomics ChromiumTM.Ця послуга широко використовується в дослідженнях, пов’язаних із захворюваннями, такими як диференціювання імунних клітин, гетерогенність пухлин, розвиток тканин тощо.

Просторовий транскриптомний чіп: 10× Genomics

Платформа: платформа Illumina NovaSeq

Зв'яжіться з нами

Деталі послуги

Біоінформатика

Демонстраційні результати

Технічний принцип

Ізоляція ядер досягається за допомогою 10× Genomics ChromiumTM, яка складається з восьмиканальної мікрофлюїдної системи з подвійним перетином.У цій системі гелеві кульки зі штрих-кодами та праймером, ферменти та одне ядро інкапсульовані в краплю олії розміром з нанолітр, утворюючи гель-кульку в емульсії (GEM).Після того як GEM сформований, лізис клітин і вивільнення штрих-кодів виконуються в кожному GEM.мРНК зворотно транскрибується в молекули кДНК зі штрих-кодами 10 × і UMI, які далі підлягають стандартній конструкції бібліотеки секвенування.

Тканина не підходить для приготування одноклітинної суспензії

Клітина / Тканина	Причина
Несвіжо заморожена тканина	Не вдалося отримати свіжі або давно збережені організації
М’язова клітина, мегакаріоцит, жир…	Діаметр комірки занадто великий, щоб потрапити в прилад
Печінка…	Надто крихкий, щоб зламати, нездатний розрізняти окремі клітини
Нейронна клітина, мозок…	Більш чутливий, легко піддається стресу, змінить результати секвенування
Підшлункова залоза, щитовидна залоза…	Багатий ендогенними ферментами, що впливають на виробництво одноклітинної суспензії

Одноядерний проти одноклітинного

Одноядерні	Одноклітинний
Необмежений діаметр клітини	Діаметр клітини: 10-40 мкм
Матеріалом може бути заморожена тканина	Матеріал повинен бути свіжою тканиною
Низький стрес заморожених клітин	Ферментна обробка може викликати стресову реакцію клітин
Червоні кров’яні тільця видаляти не потрібно	Необхідно видалити еритроцити
Ядро виражає біоінформацію	Вся клітина виражає біоінформацію

Специфікації послуги

Бібліотека

Стратегія секвенування

Обсяг даних

Зразок вимог

Тканина

10 × одноядерна бібліотека Genomics

10x Genomics -Illumina PE150

Приблизно 100 000 читань на комірку.100-200 Гб

Номер клітини: >2×10⁵

Комірка конц.при 700-1200 клітин/мкл

≥ 200 мг

Щоб отримати докладніші відомості про інструкції з підготовки зразків і робочий процес обслуговування, будь ласка, не соромтеся поговорити з aЕксперт BMKGENE