Бісульфітне секвенування зі зниженим представленням (RRBS)
Специфікації послуги
Платформа: платформа NovaSeq, PE150
Тип бібліотеки: бібліотека ДНК, оброблена бісульфітом, 200-400 bp
Стратегія секвенування: Paired-End 150 bp
Рекомендований вихід даних: 10 Гб необроблених даних/зразок
Зразок вимог
Кількість ДНК: ≥ 2 мкг
Концентрація ДНК: ≥ 20 нг/мкл.
Чистота: OD260/280 = 1,8-2,0 без деградації або забруднення РНК
Біоінформатичний аналіз
Потік роботи служби
Доставка зразків
Будівництво бібліотеки
Секвенування
Аналіз даних
Післяпродажне обслуговування
a.Довідкова статистика вирівнювання геному
Статистика зчитувань відображення
Sстатистика глибини секвенування та охоплення сайту C
Aнакопичене покриття
Dефективність засвоєння кожного зразка
b.Виявлення сайту метилювання
Список рівнів метилювання в C-сайті
BS перетворення
Mетилований цитозин
Розподіл рівня метилювання
c.Карта метилювання
Genome-wide
Gелемент enome
d.Порівняння рівнів метилювання між зразками
PAirwise Кореляція метилювання CG
PМетилювання CA-CG
Cблиск метилювання CG
d.Диференціальний аналіз метилювання
Sстатистика ДМР
Розподіл довжини DMR
Hїсти карту
DРозподіл MR в цільовому регіоні
