-
Секвенування одноядерної РНК
Прогрес у захопленні однієї клітини та техніці побудови індивідуальної бібліотеки в поєднанні з високопродуктивним секвенуванням дозволяє досліджувати експресію генів на основі кожної клітини.Він дає змогу проводити більш глибокий і повний системний аналіз складних клітинних популяцій, у якому значною мірою уникає маскування їх гетерогенності, беручи середнє значення всіх клітин.
Однак деякі клітини непридатні для виготовлення одноклітинної суспензії, тому потрібні інші методи підготовки зразків – екстракція ядра з тканин, тобто ядро витягується безпосередньо з тканин або клітини та готується до одноядерної суспензії для одноклітинної суспензії. секвенування клітин.
BMK надає послугу секвенування одноклітинної РНК 10× Genomics ChromiumTM.Ця послуга широко використовується в дослідженнях, пов’язаних із захворюваннями, такими як диференціювання імунних клітин, гетерогенність пухлин, розвиток тканин тощо.
Просторовий транскриптомний чіп: 10× Genomics
Платформа: платформа Illumina NovaSeq
-
Просторовий транскриптом BMKMANU S1000
Просторова транскриптоміка стоїть на передньому краї наукових інновацій, надаючи дослідникам можливість досліджувати складні моделі експресії генів у тканинах, зберігаючи їх просторовий контекст.Серед різних платформ BMKGene розробила чіп просторової транскрипції BMKManu S1000, який може похвалитисяпокращена роздільна здатність5 мкМ, досягаючи субклітинного діапазону та активуючиналаштування багаторівневої роздільної здатності.Чіп S1000, що містить приблизно 2 мільйони точок, використовує мікролунки, шаровані кульками, завантаженими зондами захоплення з просторовим штрих-кодом.Бібліотека кДНК, збагачена просторовими штрих-кодами, готується з чіпа S1000 і згодом секвенується на платформі Illumina NovaSeq.Поєднання зразків із просторовим штрих-кодом та UMI забезпечує точність і точність згенерованих даних.Унікальна характеристика чіпа BMKManu S1000 полягає в його універсальності, пропонуючи багаторівневі налаштування роздільної здатності, які можна точно налаштувати для різних тканин і рівнів деталізації.Ця адаптивність позиціонує чіп як видатний вибір для різноманітних досліджень просторової транскриптоміки, забезпечуючи точне просторове кластеризування з мінімальним шумом.
Використовуючи чіп BMKManu S1000 та інші технології просторової транскриптоміки, дослідники можуть отримати краще розуміння просторової організації клітин і складних молекулярних взаємодій, які відбуваються всередині тканин, надаючи безцінне розуміння механізмів, що лежать в основі біологічних процесів у широкому спектрі областей, у тому числі онкологія, нейронаука, біологія розвитку, імунологія та ботанічні дослідження.
Платформа: чіп BMKManu S1000 і Illumina NovaSeq
-
10x просторовий транскриптом Genomics Visium
Просторова транскриптоміка – це передова технологія, яка дозволяє дослідникам досліджувати моделі експресії генів у тканинах, зберігаючи їх просторовий контекст.Однією з потужних платформ у цій сфері є 10x Genomics Visium у поєднанні з секвенуванням Illumina.Принцип роботи 10X Visium полягає в спеціальному чіпі з виділеною зоною захоплення, де розміщуються зрізи тканин.Ця область захоплення містить плями зі штрих-кодом, кожна з яких відповідає унікальному просторовому розташуванню в тканині.Захоплені молекули РНК із тканини потім позначаються унікальними молекулярними ідентифікаторами (UMI) під час процесу зворотної транскрипції.Ці плями зі штрих-кодом і UMI дозволяють точне просторове відображення та кількісну оцінку експресії генів із роздільною здатністю однієї клітини.Поєднання зразків із просторовим штрих-кодом та UMI забезпечує точність і точність згенерованих даних.Використовуючи цю технологію Spatial Transcriptomics, дослідники можуть отримати глибше розуміння просторової організації клітин і складних молекулярних взаємодій, що відбуваються всередині тканин, пропонуючи безцінне розуміння механізмів, що лежать в основі біологічних процесів у багатьох областях, включаючи онкологію, нейронауку, біологію розвитку, імунологію , і ботанічні дослідження.
Платформа: 10X Genomics Visium і Illumina NovaSeq
