-
BSA
Платформа Bulked Segregant Analysis складається з однокрокового стандартного аналізу та розширеного аналізу з індивідуальним налаштуванням параметрів.BSA — це техніка, яка використовується для швидкої ідентифікації генетичних маркерів, пов’язаних з фенотипом.Основний робочий процес BSA містить: 1. вибір двох груп індивідуумів із надзвичайно протилежними фенотипами;2. об'єднання ДНК, РНК або SLAF-seq (розроблено Biomarker) усіх індивідуумів для формування двох мас ДНК;3. Ідентифікація диференціальних послідовностей проти еталонного генома або між ними, 4. Прогнозування потенційних зв’язаних ділянок за допомогою алгоритму ED та SNP-index;5. Функціональний аналіз і збагачення генів у регіонах-кандидатах тощо. Також доступні більш просунуті аналізи даних, включаючи скринінг генетичних маркерів і дизайн праймерів.
-
Амплікон (16S/18S/ITS)
Платформа Amplicon (16S/18S/ITS) розроблена на основі багаторічного досвіду в аналізі проектів мікробного різноманіття, який містить стандартизований базовий аналіз і персоналізований аналіз: базовий аналіз охоплює основний вміст аналізу поточних мікробних досліджень, вміст аналізу багатий і вичерпний, а результати аналізу представлені у вигляді проектних звітів;Зміст персоналізованого аналізу різноманітний.Зразки можна відбирати, а параметри можна гнучко встановлювати відповідно до звіту про базовий аналіз і мети дослідження, щоб реалізувати персоналізовані вимоги.Операційна система Windows, проста і швидка.
-
Еволюційна генетика
Еволюційна генетика — це пакетний сервіс секвенування, розроблений для надання комплексної інтерпретації еволюційної інформації даних матеріалів на основі генетичних варіацій, включаючи SNP, InDels, SV і CNV.Він надає весь фундаментальний аналіз, необхідний для опису еволюційних змін і генетичних особливостей популяцій, таких як структура популяції, генетичне різноманіття, філогенічні зв’язки тощо. Він також містить дослідження генного потоку, що дає змогу оцінити ефективний розмір популяції, час дивергенції.
-
Порівняльна геноміка
Порівняльна геноміка буквально означає порівняння повних геномних послідовностей і структур різних видів.Ця дисципліна спрямована на виявлення еволюції видів, функції генів, механізму регуляції генів на рівні геному шляхом ідентифікації структур послідовності та елементів, які збереглися або диференціювалися між різними видами.Типове порівняльне дослідження геноміки включає аналіз сімейства генів, еволюційного розвитку, дуплікації всього геному, селективного тиску тощо.
-
Еволюційна генетика
Платформа популяційного та еволюційного генетичного аналізу створена на основі величезного досвіду, накопиченого командою BMK R&D протягом багатьох років.Це зручний інструмент, особливо для дослідників, які не займаються біоінформатикою.Ця платформа дає змогу базового аналізу, пов’язаного з еволюційною генетикою, включаючи побудову філогенетичного дерева, аналіз нерівноваги зв’язків, оцінку генетичного різноманіття, селективний аналіз, аналіз спорідненості, PCA, аналіз структури популяції тощо.
-
Збірка геному на основі Hi-C
Hi-C — це метод, призначений для визначення конфігурації хромосом шляхом поєднання взаємодії на основі зондування на основі близькості та високопродуктивного секвенування.Вважається, що інтенсивність цих взаємодій негативно корелює з фізичною відстанню в хромосомах.Таким чином, дані Hi-C можуть керувати кластеризацією, упорядкуванням і орієнтацією зібраних послідовностей у проекті генома та закріпленням їх на певній кількості хромосом.Ця технологія дає змогу складати геном на рівні хромосоми за відсутності популяційної генетичної карти.Кожен окремий геном потребує Hi-C.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Секвенування генома рослин/тварин De Novo
Де Новосеквенування відноситься до побудови цілого геному виду з використанням технологій секвенування, наприклад PacBio, Nanopore, NGS тощо, за відсутності еталонного геному.Значне покращення довжини зчитування технологій секвенування третього покоління принесло нові можливості для збирання складних геномів, таких як геноми з високою гетерозиготністю, високим відношенням повторюваних областей, поліплоїди тощо. З довжиною зчитування на рівні десятків кілобаз ці зчитування секвенування дозволяють розділення повторюваних елементів, областей з ненормальним вмістом GC та інших дуже складних областей.
Платформа: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Платформа Illumina NovaSeq
-
Секвенування всього екзому людини
Секвенування повного екзома (WES) вважається економічно ефективною стратегією секвенування для виявлення хвороботворних мутацій.Хоча екзони займають лише приблизно 1,7% усього геному, це безпосередньо відображає профіль загальних функцій білка.Повідомлялося, що в геномі людини понад 85% пов’язаних із захворюваннями мутацій відбуваються в області кодування білка.
BMKGENE пропонує комплексні та гнучкі послуги секвенування цілого екзома людини з різними стратегіями захоплення екзонів, доступними для досягнення різноманітних цілей дослідження.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq
-
Специфічний локус ампліфікованого секвенування фрагментів (SLAF-Seq)
Високопродуктивне генотипування, особливо у великомасштабній популяції, є фундаментальним кроком у дослідженнях генетичних асоціацій, що забезпечує генетичну основу для виявлення функціональних генів, еволюційного аналізу тощо. Замість глибокого повторного секвенування цілого геному, секвенування геному зі зменшеним представленням (RRGS ) введено, щоб мінімізувати вартість секвенування зразка, зберігаючи прийнятну ефективність виявлення генетичних маркерів.Зазвичай це досягається шляхом вилучення фрагмента обмеження в заданому діапазоні розмірів, який називається бібліотекою скороченого представлення (RRL).Секвенування ампліфікованих фрагментів специфічного локусу (SLAF-Seq) — це власно розроблена стратегія для генотипування SNP з еталонним геномом або без нього.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq -
Illumina та BGI
Технологія секвенування Illumina, заснована на секвенуванні шляхом синтезу (SBS), є всесвітньо прийнятою інновацією NGS, яка відповідає за генерацію понад 90% даних секвенування у світі.Принцип SBS включає візуалізацію флуоресцентно мічених оборотних термінаторів у міру додавання кожного dNTP і подальшого розщеплення для включення наступної основи.З усіма чотирма оборотними зв’язаними з термінатором dNTP, присутніми в кожному циклі секвенування, природна конкуренція мінімізує зміщення включення.Ця універсальна технологія підтримує бібліотеки як для одного читання, так і для парних бібліотек, обслуговуючи низку геномних програм.Висока пропускна здатність і точність секвенування Illumina робить його наріжним каменем у геномних дослідженнях, надаючи вченим змогу розгадувати тонкощі геномів із неперевершеною деталізацією та ефективністю.
DNBSEQ, розроблена компанією BGI, є ще однією інноваційною технологією NGS, якій вдалося ще більше знизити витрати на секвенування та збільшити пропускну здатність.Підготовка бібліотек DNBSEQ включає фрагментацію ДНК, підготовку оцДНК та ампліфікацію обертового кола для отримання нанокульок ДНК (DNB).Потім їх завантажують на тверду поверхню, а потім секвенують за допомогою комбінаторного синтезу зонда-якоря (cPAS).
Наша готова служба секвенування бібліотек допомагає клієнтам підготувати свої бібліотеки секвенування з різноманітних джерел (між іншим, мРНК, цілий геном, амплікон).Згодом ці бібліотеки можна відправити до наших центрів секвенування для контролю якості та секвенування на платформах Illumina або BGI.
