Хоча секвенування мРНК на основі NGS служить універсальним інструментом для кількісного визначення експресії генів, його залежність від коротких зчитувань обмежує його ефективність у складних транскриптомних аналізах.Секвенування PacBio (Iso-Seq), з іншого боку, використовує технологію тривалого зчитування, що дозволяє секвенувати повнорозмірні стенограми мРНК.Цей підхід полегшує комплексне дослідження альтернативного сплайсингу, злиття генів і поліаденілування, хоча він не є основним вибором для кількісного визначення експресії генів.Комбінація 2+3 заповнює розрив між Illumina та PacBio, покладаючись на зчитування PacBio HiFi для ідентифікації повного набору ізоформ транскриптів і секвенування NGS для кількісного визначення тих самих ізоформ.
Платформи: PacBio Sequel II і Illumina NovaSeq