Основні моменти
На цей двогодинний вебінар ми маємо велику честь запросити шість експертів у сфері геноміки сільськогосподарських культур.Наші спікери дадуть поглиблену інтерпретацію двох геномних досліджень жита, які нещодавно були опубліковані наГенетика природи:
1. Збірка геному в хромосомному масштабі дає уявлення про біологію, еволюцію та агрономічний потенціал жита
2. Високоякісна збірка геному висвітлює геномні характеристики жита та агрономічно важливі гени
Крім того, ми раді, що старший науковий співробітник Biomarker Technologies поділився своїм досвідом зі складання геному de novo.
Порядок денний
09:00 CET
Вітальні слова
Чжен Хун-кун
Засновник і генеральний директор Biomarker Technologies
Ден Сін-ван
Президент Школи передових сільськогосподарських наук Пекінського університету
09:15 ранку
Посилення поліпшення жита, тритикале та пшениці за допомогою використання високоякісної еталонної послідовності геному
На цьому вебінарі професор Ван дав нам загальну інформацію про поточний стан геномних досліджень триціцевих і продемонстрував успіх і досягнення двох видатних робіт з вивчення геному жита, які нещодавно були опубліковані на Nature Genetics і представляють цілі дослідження. групи, які ведуть і беруть участь у роботах.
09:25 ранку
Геноміка злаків @ IPK Gatersleben
Зернові трави племені Triticeae були основним джерелом їжі в регіонах з помірним кліматом, які вже давно вважалися гарячою точкою для поліпшення та розведення сільськогосподарських культур.Серед усіх видів, що культивуються, це плем’я славиться своїми надзвичайно складними геномними особливостями, включаючи великі розміри геному, високий вміст ТЕ, поліплоїдію тощо. На цій сесії професор Нільс Штайн представив нам загальний вступ до IPK Gatersleben та поточного стану зернових. геномні дослідження@IPK Gatersleben.
09:35 ранку
Складання геному в хромосомному масштабі дає змогу зрозуміти біологію, еволюцію та агрономічний потенціал жита
Доктор М. Тімоті Рабанус-Воллес, Інститут генетики рослин і планів досліджень ім. Лейбніца (IPK)Жито (Secale cereale L.) є надзвичайно стійкою до кліматичних умов зерновою культурою, яка широко використовується для отримання покращених сортів пшениці за допомогою інтрогресивної гібридизації та має повний набір генів, необхідних для створення гібридної селекції.Жито є алогамним і лише нещодавно одомашненим, що дає культивованому житу доступ до різноманітного та придатного для використання дикого генофонду.Щоб ще більше підвищити агрономічний потенціал жита, ми виготовили анотовану збірку геному жита розміром 7,9 Mbp у хромосомному масштабі та ретельно перевірили його якість, використовуючи набір молекулярно-генетичних ресурсів.Ми демонструємо застосування цього ресурсу в широкому спектрі досліджень.Ми представляємо висновки про неповну генетичну ізоляцію культурного жита від диких родичів, механізми структурної еволюції геному, резистентність до патогенів, толерантність до низьких температур, системи контролю родючості для гібридної селекції та переваги врожайності інтрогресії жита і пшениці.
10:05 ранку
Високоякісна збірка геному висвітлює геномні характеристики жита та агрономічно важливі гени
Жито — цінна продовольча та кормова культура, важливий генетичний ресурс для поліпшення пшениці та тритикале, незамінний матеріал для ефективних порівняльних досліджень геноміки трав.Тут ми секвенували геном жита Вейнінг, елітного китайського сорту жита.Зібрані контиги (7,74 Гб) становлять 98,47% від оціненого розміру геному (7,86 Гб), при цьому 93,67% контигів (7,25 Гб) віднесені до семи хромосом.Повторювані елементи становили 90,31% зібраного геному.Порівняно з попередньо секвенованими геномами Triticeae, ретротранспозони Daniela, Sumaya та Sumana показали сильну експансію в житі.Подальші аналізи збірки Вейнінга проливають нове світло на геномні дуплікації та їхній вплив на гени біосинтезу крохмалю, фізичну організацію складних локусів проламіну, особливості експресії генів, що лежать в основі ознаки раннього заголовка, і передбачувані хромосомні ділянки та локуси жита, пов’язані з одомашненням.Ця послідовність геному обіцяє прискорити дослідження геноміки та селекції жита та споріднених зернових культур.
10:35 ранку
Виклики, рішення та майбутнє збирання геному de novo
Геном високої якості є основою геномного дослідження.Незважаючи на те, що швидкий розвиток секвенування та алгоритму дозволив значно простішому та ефективнішому збиранню геному, вимоги до точності та повноти збирання також зростають із поглибленням цілей дослідження.У цій доповіді я обговорю поточні популярні технології збирання генома з кількома успішними кейсами та погляну на майбутній розвиток.
Час публікації: 08 січня 2022 р