BMKCloud Log in
条形банер-03

Новини

Секвенування повної довжини транскриптома на основі нанопор

Секвенування нанопор відрізняється від інших платформ секвенування тим, що нуклеотиди зчитуються безпосередньо без синтезу ДНК і генерують довгі зчитування з десятками килобаз.Це дає можливість прямого зчитування повних стенограм і вирішення проблем у транскриптомних дослідженнях.

√ Низьке зміщення, специфічне для послідовності

√ Повнорозмірне зчитування кДНК для вивчення структури генів

√ Потрібно менше даних для охоплення тієї ж кількості стенограм

√ Ідентифікація кількох ізоформ на ген

√ Кількісне визначення експресії на рівні ізоформи

нанопора-1

Типовий конвеєр біоінформатики

Full-length-trans-bix-1024x254

Останні успішні випадки з технологіями біомаркерів

1. Порівняльний аналіз повнорозмірних транскриптомів показує динаміку розвитку стебла Gnetum luofuense

Журнал: Frontiers in Genetics

Опубліковано: березень 2021 р

Ключові слова: MinION |Альтернативний сплайсинг |APA |lncRNA |Диференційно виражені транскрипти

Читати повний текст

2. Односпрямований рух малих РНК від пагонів до коренів у міжвидових гетеротрансплантатах

Журнал: Nature Plants

Опубліковано: січень 2021 р

Ключові слова: Нанопор |Illumina |виявлення повнорозмірної мобільної мРНК

3. Повнорозмірний транскриптомний аналіз коренів спаржі розкриває молекулярний механізм стійкості до солі, індукований арбускулярними мікоризними грибами

Журнал: Екологічна та експериментальна ботаніка

Опубліковано: січень 2021 р

Ключові слова: MinION |Диференційно виражені транскрипти |Фактори транскрипції |Альтернативний сплайсинг

4. Зміни фізіологічних характеристик і повнорозмірний транскриптом коренів і листя троянди (Rosa chinensis) у відповідь на посуховий стрес

Журнал: Фізіологія рослин і клітин

Опубліковано: жовтень 2020 р

Ключові слова: PromethION |Диференційно виражені транскрипти |Функціональне прогнозування |Сплайсовані ізоформи |TF і lncRNA

5. Аналіз та комплексне порівняння PacBio та секвенування РНК на основі нанопор транскриптому Arabidopsis

Журнал: Рослин-метод

Опубліковано: квітень 2020 р

Ключові слова: GridION |PromethION |Продовження PacBio |Illumina NovaSeq |Вирівнювання геному |Розшифровка ідентифікації |Альтернативний сплайсинг |РСР |LncRNA |Кількісне визначення ізоформи

Новини та основні моменти спрямований на обмін останніми успішними випадками з Biomarker Technologies, фіксацію нових наукових досягнень, а також видатних методів, застосованих під час дослідження.


Час публікації: 08 січня 2022 р

Надішліть нам своє повідомлення: