МІКРОБНІ
Бактеріальна сумісність та іммобілізація за допомогою біовугілля покращує деградацію тебуконазолу, склад мікробіому ґрунту та функціонування
Повнорозмірне секвенування ампліконів 16S |PacBio HiFi |Альфа-різноманіття |Бета-різноманіття
У цьому дослідженні повнорозмірне секвенування амплікону 16S за допомогою PacBio та біоінформаційний аналіз були надані Biomarker Technologies.
Основні моменти
Імобілізовані біовугіллям бактерії, що розкладають тебуконазол, Alcaligenes faecalis WZ-2, вивчали ефективність біорозкладання та вплив на забруднений тебуконазолом ґрунт у порівнянні зі штамом WZ-2, що вільно розкладається.
1. Іммобілізований біовугіллям WZ-2 продемонстрував ефективнішу деградацію тебуконазолу порівняно з вільним WZ-2 за рахунок скорочення періоду напіввиведення тебуконазолу в ґрунті з 18,7 днів до 13,3 днів.
2. Іммобілізоване біовугіллям WZ-2 вдалося відновити активність природних мікробних ферментів ґрунту, включаючи уреазу, дегідрогеназу та інвертазу тощо.
3. Мікробний профіль в іммобілізованому біовугіллям ґрунті, обробленому WZ-2, визначений за допомогою повнорозмірного секвенування 16S, підтверджує, що ця система може відновити здоров’я ґрунту шляхом покращення структури бактеріального співтовариства в умовах забруднення тебуконазолом.
Експеримент (пов'язаний із секвенуванням)
Групування: CK: природний ґрунт;Т: Грунт, збагачений тебуконазолом;S: ґрунт, що містить тебуконазол із вільним штамом WZ-2;BC: тебуконазол містив ґрунт із біовугіллям;BCS: ґрунт, що містить тебуконазол, з іммобілізованим біовугіллям WZ-2.
Відбір проб: загальна екстракція ДНК ґрунту, ампліфікована праймерами 16S рДНК
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) і 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),представляє повнорозмірну 16S рДНК
Платформа секвенування: PacBio RS II
Стратегія секвенування: CCS HIFI читає
Аналіз даних:BMKCloudБіоінформаційна платформа робить золоту рибку чудовою системою генетичної моделі для фізіології та еволюції риб.
Результат
Структуру ґрунтового мікробного співтовариства визначали шляхом секвенування 16S рДНК.Багатство OTU та індекс альфа-різноманіття, включаючи індекси Chao1, Ace, Shannon та Simpson, були оцінені, щоб виявити різноманітність видів у кожній системі.Після 60 днів інкубації всі показники показали однакову тенденцію, тобто тебуконазол міг спричинити зменшення видового багатства та різноманітності ґрунту.Однак, додавши штам WZ-2, спільнота ґрунтових бактерій була частково відновлена з точки зору багатства та різноманітності.Між BC, BCS і CK спостерігалася обмежена різниця, що вказує на те, що біовугілля та іммобілізований біовугіллям WZ-2 можуть ефективно відновлювати біологічне здоров’я ґрунту.
У цьому дослідженні було застосовано незважений парно-груповий метод із середніми арифметичними значеннями (UPGMA), щоб показати бета-розмаїття між групами.Як показано на наступному малюнку, BC, BSC і CK мають більш подібну картину мікробного складу порівняно з групами T і S, що додатково вказує на те, що введення біовугілля в забруднений тебуконазолом грунт може значною мірою сприяти відновленню мікробної спільноти в грунті.
малюнок.UPGMA кластеризація бактеріального співтовариства на рівні типу за різної обробки
довідка
Сун, Тонг та ін.«Бактеріальна сумісність та іммобілізація за допомогою біовугілля покращили деградацію тебуконазолу, склад мікробіому ґрунту та функціонування».Журнал небезпечних матеріалів398 (2020): 122941.
Новини та основні моменти спрямований на обмін останніми успішними випадками з Biomarker Technologies, фіксацію нових наукових досягнень, а також видатних методів, застосованих під час дослідження.
Час публікації: 08 січня 2022 р