BMKGENE надала послуги просторового секвенування транскриптомів для дослідження «STEEL enables high-resolution delineation of spatiotemporal transcryptomic data», яке було опубліковано в Briefings in Bioinformatics.
У цьому дослідженні запропоновано неконтрольований алгоритм, заснований на різноманітному навчанні, кластеризація клітинного типу просторової транскриптоми (STEEL), яка ідентифікує домени з просторового транскриптому за допомогою кластеризації кульок, що демонструють як дуже подібні профілі експресії генів, так і близьку просторову відстань у вигляді графіків.
Комплексна оцінка STEEL на просторових транскриптомних наборах даних з платформи 10X Visium демонструє, що він не тільки забезпечує високу роздільну здатність для характеристики тонких структур мозку миші, але також дозволяє інтегрувати кілька слайдів тканини, окремо проаналізованих, у більший.
З розвитком технологій просторової транскриптоми наш метод матиме велике застосування в ідентифікації домену та реконструкції атласу експресії генів.
Натиснітьтутщоб дізнатися більше про це дослідження.
Час публікації: 20 жовтня 2023 р