● Великий досвід: понад 200 000 зразків було оброблено в BMK, що охоплюють різні типи зразків, включаючи культуру клітин, тканини, рідини організму тощо, і понад 7 000 закритих проектів mRNA-Seq, що охоплюють різні галузі досліджень.
● Сувора система контролю якості: основні точки контролю якості на всіх етапах, включаючи підготовку зразків, підготовку бібліотеки, секвенування та біоінформатику, знаходяться під ретельним моніторингом для отримання високоякісних результатів.
● Кілька баз даних доступні для анотації функцій і досліджень збагачення для досягнення різноманітних цілей дослідження.
● Післяпродажне обслуговування: післяпродажне обслуговування дійсне протягом 3 місяців після завершення проекту, включаючи супровід проекту, усунення несправностей, запитання та відповіді на результати тощо.
Бібліотека | Стратегія секвенування | Рекомендовані дані | Контроль якості |
Полі А збагачений | Illumina PE150 | 6 Гб | Q30≥85% |
Нуклеотиди:
Конц. (нг/мкл) | Кількість (мкг) | Чистота | Цілісність |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 На гелі виявлено обмежене забруднення білком або ДНК або його відсутність. | Для рослин: RIN≥6,5; Для тварин: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; обмежене підвищення або відсутність базової лінії |
Тканина: Вага (суха):≥1 г
*Для тканини менше 5 мг ми рекомендуємо надсилати швидкозаморожений (у рідкому азоті) зразок тканини.
Суспензія клітин:Кількість клітин = 3×106- 1×107
*Ми рекомендуємо відправляти заморожений лізат клітин.У випадку, якщо число клітинок менше 5×105.
Зразки крові:Об'єм≥1 мл
мікроорганізм:Маса ≥ 1 г
Контейнер: центрифужна пробірка на 2 мл (фольга не рекомендована)
Зразок маркування: Група + копія, наприклад, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Відвантаження:
Біоінформатика
Еукаріотичний Робочий процес аналізу секвенування мРНК
Біоінформатика
ØКонтроль якості необроблених даних
ØВирівнювання еталонного геному
ØАналіз структури транскрипту
ØКількісна оцінка експресії
ØДиференціальний аналіз виразів
ØФункція анотації та збагачення
1.Крива насичення даних мРНК
2.Аналіз диференціального виразу – графік вулкана
3.Анотація KEGG на DEG
4.Класифікація ГО на ДЕГ