BMKCloud Log in
条形банер-03

Продукти

Секвенування мРНК еукаріот - Illumina

Секвенування мРНК дає змогу профілювати всі мРНК, транскрибовані з клітин за певних умов.Це потужна технологія для виявлення профілю експресії генів, структур генів і молекулярних механізмів певних біологічних процесів.На сьогоднішній день секвенування мРНК широко використовується у фундаментальних дослідженнях, клінічній діагностиці, розробці ліків тощо.

Платформа: платформа Illumina NovaSeq


Деталі послуги

Біоінформатика

Демонстраційні результати

Переваги

● Великий досвід: понад 200 000 зразків було оброблено в BMK, що охоплюють різні типи зразків, включаючи культуру клітин, тканини, рідини організму тощо, і понад 7 000 закритих проектів mRNA-Seq, що охоплюють різні галузі досліджень.

● Сувора система контролю якості: основні точки контролю якості на всіх етапах, включаючи підготовку зразків, підготовку бібліотеки, секвенування та біоінформатику, знаходяться під ретельним моніторингом для отримання високоякісних результатів.

● Кілька баз даних доступні для анотації функцій і досліджень збагачення для досягнення різноманітних цілей дослідження.

● Післяпродажне обслуговування: післяпродажне обслуговування дійсне протягом 3 місяців після завершення проекту, включаючи супровід проекту, усунення несправностей, запитання та відповіді на результати тощо.

Вимоги до зразків і доставка

Бібліотека Стратегія секвенування Рекомендовані дані Контроль якості
Полі А збагачений Illumina PE150

6 Гб

Q30≥85%

Вимоги до зразків:

Нуклеотиди:

Конц. (нг/мкл)

Кількість (мкг)

Чистота

Цілісність

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

На гелі виявлено обмежене забруднення білком або ДНК або його відсутність.

Для рослин: RIN≥6,5;

Для тварин: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

обмежене підвищення або відсутність базової лінії

Тканина: Вага (суха):≥1 г
*Для тканини менше 5 мг ми рекомендуємо надсилати швидкозаморожений (у рідкому азоті) зразок тканини.

Суспензія клітин:Кількість клітин = 3×106- 1×107
*Ми рекомендуємо відправляти заморожений лізат клітин.У випадку, якщо число клітинок менше 5×105.

Зразки крові:Об'єм≥1 мл

мікроорганізм:Маса ≥ 1 г

Рекомендована доставка зразків

Контейнер: центрифужна пробірка на 2 мл (фольга не рекомендована)

Зразок маркування: Група + копія, наприклад, A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Відвантаження:

  1. Сухий лід: Зразки потрібно упакувати в мішки та закопати в сухий лід.
  2. Пробірки для стабілізації РНК: зразки РНК можна висушити в пробірці для стабілізації РНК (наприклад, RNAstable®) і відправити при кімнатній температурі.

Потік роботи служби

Зразок КЯ

Дизайн експерименту

доставка зразка

Доставка зразків

Пілотний експеримент

екстракція РНК

Підготовка бібліотеки

Будівництво бібліотеки

Секвенування

Секвенування

Аналіз даних

Аналіз даних

Післяпродажне обслуговування

Післяпродажне обслуговування


  • Попередній:
  • далі:

  • Біоінформатика

    wps_doc_10

    Еукаріотичний Робочий процес аналізу секвенування мРНК

    Біоінформатика

    ØКонтроль якості необроблених даних

    ØВирівнювання еталонного геному

    ØАналіз структури транскрипту

    ØКількісна оцінка експресії

    ØДиференціальний аналіз виразів

    ØФункція анотації та збагачення

    1.Крива насичення даних мРНК

    3(1)

    2.Аналіз диференціального виразу – графік вулкана

    4(1)

    3.Анотація KEGG на DEG

    5(1)

    4.Класифікація ГО на ДЕГ

    6(1)

    отримати цитату

    Напишіть своє повідомлення тут і надішліть його нам

    Надішліть нам своє повідомлення: