●Платформи:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten і BGI-DNB-T7
●Режими секвенування:PE50, PE100, PE150, PE250
●Контроль якості бібліотек перед секвенуванням
●Послідовність доставки даних і контролю якості:доставка звіту про контроль якості та необроблених даних у форматі fastq після демультиплексування та фільтрації читань Q30.
●Універсальність послуг секвенування:клієнт може вибрати послідовність за смугою, проточною коміркою або кількістю даних.
●Універсальність платформ:Бібліотеки DNB можна перенести на платформи Illumina
●Великий досвід роботи з платформою секвенування Illumina:з тисячами закритих проектів з різними видами.
●Доставка звіту про секвенування КЯ:з показниками якості, точністю даних і загальною ефективністю проекту секвенування.
●Зрілий процес секвенування:з коротким терміном виконання.
●Суворий контроль якості: ми впроваджуємо суворі вимоги контролю якості, щоб гарантувати стабільно високу якість результатів.
Обсяг даних (X) | Концентрація (кПЦР/нМ) | Обсяг |
X ≤ 50 Гб | ≥ 2 нМ | ≥ 20 мкл |
50 Гб ≤ X < 100 Гб | ≥ 3 нМ | ≥ 20 мкл |
X ≥ 100 Гб | ≥ 4 нМ | ≥ 20 мкл |
Платформа | Концентрація (кПЦР/нМ) | Обсяг |
HiSeq X Ten | ≥ 2 нМ | ≥ 20 мкл |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 нМ | ≥ 25 мкл |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 нМ | ≥ 25 мкл |
NovaSeq X | ≥ 1,5 нМ | ≥ 25 мкл |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 нМ | ≥ 25 мкл |
На додаток до концентрації та загальної кількості також необхідна відповідна схема піків.
Перед секвенуванням, оцінкою кількості бібліотеки та фрагментацією надається звіт про якість бібліотеки.
Таблиця 1. Статистика даних секвенування.
ID зразка | BMKID | Raw читає | Необроблені дані (bp) | Чисте читання (%) | Q20 (%) | Q30(%) | GC (%) |
C_01 | БМК_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | БМК_02 | 14,717,867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Рисунок 1. Розподіл якості вздовж зчитувань у кожному зразку
Рисунок 2. Базовий розподіл вмісту
Рисунок 3. Розподіл зчитаного вмісту в даних секвенування