-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
مېتاگېنومىكا مۇھىت ئەۋرىشكىسىدىن ئېلىنغان ئارىلاشما گېن ماتېرىياللىرىنى ئانالىز قىلىشتا ئىشلىتىلىدىغان مولېكۇلا قورالى بولۇپ ، ئۇ جانلىقلارنىڭ كۆپ خىللىقى ۋە موللىقى ، نوپۇس قۇرۇلمىسى ، فىلوگېنتىك مۇناسىۋەت ، فۇنكسىيە گېنى ۋە مۇھىت ئامىلى بىلەن باغلىنىش تورى قاتارلىق تەپسىلاتلارنى تەمىنلەيدۇ. to metagenomic studies.ئۇنىڭ ئوقۇش ئۇزۇنلۇقىدىكى كۆرۈنەرلىك ئىپادىسى تۆۋەن ئېقىن مېتاگېنومىيىلىك ئانالىزنى كۈچەيتتى ، بولۇپمۇ مېتاگېنوم قۇراشتۇرۇش.ئوقۇش ۋاقتىدىكى ئەۋزەللىكلەردىن پايدىلىنىپ ، نانوپورنى ئاساس قىلغان مېتاگېنومىيىلىك تەتقىقات مىلتىق مېتاگېنومىكىسىغا سېلىشتۇرغاندا تېخىمۇ ئۇدا قۇراشتۇرۇشنى ئەمەلگە ئاشۇرالايدۇ.نانوپورنى ئاساس قىلغان مېتاگېنومىيىلىكنىڭ مىكروبومدىن مۇۋەپپەقىيەتلىك ۋە يېپىق باكتېرىيە گېنلىرىنى مۇۋەپپەقىيەتلىك ھاسىل قىلغانلىقى ئېلان قىلىندى (Moss, EL قاتارلىقلار.Nature Biotech, 2020)
سۇپا ：Nanopore PromethION P48
-
پۈتۈن گېن گۇرۇپپىسى bisul fi te تەرتىپى
سىتوسىننىڭ (5-mC) بەشىنچى ئورۇندا تۇرىدىغان DNA مېتىللىنىشى گېننىڭ ئىپادىلىنىشى ۋە ھۈجەيرە پائالىيىتىگە تۈپتىن تەسىر كۆرسىتىدۇ.بىنورمال مېتىللاشتۇرۇش ئەندىزىسى راكقا ئوخشاش بىر قانچە شارائىت ۋە كېسەللىكلەر بىلەن مۇناسىۋەتلىك.WGBS يەككە ئاساسىي ئېنىقلىقتىكى گېن گۇرۇپپىسىدىكى مېتىللىنىشنى تەتقىق قىلىدىغان ئالتۇن ئۆلچەمگە ئايلاندى.
سۇپا: Illumina NovaSeq6000
-
Transposase-Accessable Chromatin for High Transputing (ATAC-seq)
ATAC-seq بولسا گېننىڭ كەڭ دائىرىدىكى خرومومىننىڭ زىيارەت قىلىنىشچانلىقىنى ئانالىز قىلىشتىكى يۇقىرى ئۈنۈملۈك تەرتىپلەش ئۇسۇلى بولۇپ ، گېن ئىپادىلەشنىڭ يەر شارىنى كونترول قىلىشىدا ئىنتايىن مۇھىم.تەرتىپلىك ماسلاشتۇرغۇچلار يۇقىرى دەرىجىدىكى Tn5 تىرانسپورتى ئارقىلىق ئوچۇق خرومتىن رايونىغا قىستۇرۇلىدۇ.PCR كۈچەيتىلگەندىن كېيىن ، تەرتىپلىك كۇتۇپخانا قۇرۇلدى.بارلىق ئوچۇق خرومتىن رايونلىرىنى مەلۇم بوشلۇق-ۋاقىت شارائىتىدا ئېرىشكىلى بولىدۇ ، پەقەت ترانسكرىپسىيە ئامىلىنىڭ باغلىنىشلىق ئورنى ياكى مەلۇم گىستون ئۆزگەرتىلگەن رايون بىلەنلا چەكلىنىپ قالمايدۇ.
-
16S / 18S / ITS Amplicon تەرتىپلەش- PacBio
16S ۋە 18S rRNA دىكى تارماق گەۋدە ھەم يۇقىرى دەرىجىدە ساقلانغان ۋە يۇقىرى ئۆزگىرىشچان رايونلارنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ.تەرتىپلەش پۇرسىتىدىن پايدىلىنىپ ، بۇ ئامپلونلار ساقلانغان زاپچاسلارغا ئاساسەن نىشانغا ئېلىنىدۇ ھەمدە يۇقىرى ئۆزگىرىشچان رايونلار مىكروبلارنى پەرقلەندۈرۈش ئۈچۈن تولۇق خاراكتېرگە ئىگە بولۇپ ، مىكروبلارنىڭ كۆپ خىللىقىنى ئانالىز قىلىش ، باجشۇناسلىق ، فىلوگېنا قاتارلىقلارنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ. يەككە مولېكۇلا ھەقىقىي ۋاقىت (SMRT) ) PacBio سۇپىسىنىڭ رەت تەرتىپى يۇقىرى ئۇزۇنلۇقتىكى ئوقۇلمىلارنى قوبۇل قىلالايدۇ ، بۇ ئۇزۇنلۇقتىكى ئامپلوننى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ (تەخمىنەن 1.5 Kb).ئىرسىيەت مەيدانىنىڭ كېڭىيىشى باكتېرىيە ياكى زەمبۇرۇغ مەھەللىسىدىكى جانلىقلارنىڭ ئىزاھاتىدىكى ئېنىقلىق دەرىجىسىنى زور دەرىجىدە يۇقىرى كۆتۈردى.
سۇپا ：PacBio Sequel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon تەرتىپلەش- NGS
16S / 18S / ITS ئامپلون تەرتىپى مىكروب توپلىقىدىكى فىلوگېن ، تاكتىكىسى ۋە جانلىقلارنىڭ كۆپلۈكىنى ئاشكارىلاشنى مەقسەت قىلىدۇ ، بۇنىڭ ئىچىدە پاراڭلىشىشچانلىقى يۇقىرى ، ھەم يۇقىرى قان بېسىمى بار بۆلەكلەرنى ئۆز ئىچىگە ئالغان ئائىلە ئاسراش گېن بەلگىسىنىڭ PCR مەھسۇلاتلىرىنى تەكشۈرۈش ئارقىلىق.بۇ مۇكەممەل مولېكۇلا بارماق ئىزىنىڭ Woeses قاتارلىقلار تەرىپىدىن ئوتتۇرىغا قويۇلۇشى ، (1977-يىلى) يەككە-يېگانە مىكروب ئارخىپىنى كۈچەيتىدۇ.16S (باكتېرىيە) ، 18S (زەمبۇرۇغ) ۋە ئىچكى كۆچۈرۈلگەن ئالەم بوشلۇقى (ITS ، زەمبۇرۇغ) نىڭ تەرتىپلىنىشى مول جانلىقلارنى شۇنداقلا ئاز ئۇچرايدىغان ۋە نامەلۇم تۈرلەرنى پەرقلەندۈرۈشكە يول قويىدۇ.بۇ تېخنىكا ئىنسانلارنىڭ ئېغىزى ، ئۈچەي ، تەرەت قاتارلىق ھەر خىل مۇھىتتىكى پەرقلىق مىكروب تەركىبلىرىنى پەرقلەندۈرۈشتە كەڭ قوللىنىلىدىغان ۋە ئاساسلىق قورالغا ئايلاندى.
سۇپا ：Illumina NovaSeq6000
-
باكتېرىيە ۋە زەمبۇرۇغ پۈتۈن گېن گۇرۇپپىسىنىڭ قايتا تەرتىپلىنىشى
باكتېرىيە ۋە زەمبۇرۇغ پۈتۈن گېننى قايتا تەرتىپكە سېلىش مەلۇم باكتېرىيە ۋە زەمبۇرۇغنىڭ گېنلىرىنى تولۇقلاش ، شۇنداقلا كۆپ خىل گېننى سېلىشتۇرۇش ياكى يېڭى جانلىقلارنىڭ گېنلىرىنى سېلىشتۇرۇشتىكى ھالقىلىق قورال.توغرا پايدىلىنىش گېنلىرىنى ھاسىل قىلىش ، مىكروبلارنى پەرقلەندۈرۈش ۋە باشقا سېلىشتۇرما گېن تەتقىقاتىنى قىلىش ئۈچۈن ، باكتېرىيە ۋە زەمبۇرۇغنىڭ پۈتكۈل گېنلىرىنى تەرتىپكە سېلىش تولىمۇ مۇھىم.
سۇپا: Illumina NovaSeq 6000
-
PacBio-Full-Transcriptome (پايدىلانما)
Amplicon (16S / 18S / ITS) سۇپىسى مىكروبلارنىڭ كۆپ خىللىقى تۈرىنى ئانالىز قىلىشتىكى ئۇزۇن يىللىق تەجرىبىسى بىلەن تەرەققىي قىلغان بولۇپ ، ئۇ ئۆلچەملىك ئاساسىي ئانالىز ۋە خاسلاشتۇرۇلغان تەھلىلنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ: ئاساسىي ئانالىز نۆۋەتتىكى مىكروب تەتقىقاتىنىڭ ئاساسىي ئانالىز مەزمۇنىنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ ، تەھلىل مەزمۇنى مول ۋە ئەتراپلىق ، ۋە ئانالىز نەتىجىسى تۈر دوكلاتى شەكلىدە ئوتتۇرىغا قويۇلدى.خاسلاشتۇرۇلغان تەھلىلنىڭ مەزمۇنى كۆپ خىل.ئەۋرىشكەلەرنى تاللىغىلى ۋە پارامېتىرلارنى ئاساسىي ئانالىز دوكلاتى ۋە تەتقىقات مەقسىتىگە ئاساسەن جانلىق قىلىپ ، خاسلاشتۇرۇلغان تەلەپنى ئەمەلگە ئاشۇرغىلى بولىدۇ.Windows مەشغۇلات سىستېمىسى ، ئاددىي ۋە تېز.
-
PacBio-Full-Transcriptome (پايدىلانما)
تىنچ ئوكيان بىئولوگىيىسى (PacBio) Isoform تەرتىپلەش سانلىق مەلۇماتلىرىنى كىرگۈزۈش سۈپىتىدە ئېلىپ ، بۇ ئەپ پۈتۈن ئۇزۇنلۇقتىكى خاتىرىلەش تەرتىپىنى (قۇراشتۇرماي) پەرقلەندۈرەلەيدۇ.پايدىلىنىش گېنلىرىغا قارشى پۈتۈن ئۇزۇنلۇقتىكى تەرتىپلەرنى سىزىش ئارقىلىق ، خاتىرىلەنگەن گېنلار ، خاتىرىلەر ، كودلاش رايونلىرى ئارقىلىق خاتىرىلەشنى ئەلالاشتۇرغىلى بولىدۇ ، بۇ خىل ئەھۋالدا ، mRNA قۇرۇلمىسىنى تېخىمۇ توغرا پەرقلەندۈرۈشكە بولىدۇ ، مەسىلەن باشقا قىستۇرما دېتاللار.NGS ترانسكرىپسىيەلىك تەرتىپلەش سانلىق مەلۇماتلىرى بىلەن بىرلەشمە ئانالىز خاتىرىسىدە ئىپادىلەشتە تېخىمۇ ئەتراپلىق ئىزاھلاش ۋە ئىپادىلەشتە تېخىمۇ توغرا مىقدارلاشتۇرۇشقا ياردەم بېرىدۇ ، بۇ تۆۋەن ئېقىندىكى پەرقلىق ئىپادىلەش ۋە ئىقتىدار ئانالىزىغا پايدىلىق.
-
قىسقارتىلغان ۋەكىللىك Bisulfite تەرتىپى (RRBS)
DNA مېتىللاشتۇرۇش تەتقىقاتى ئەزەلدىن كېسەللىك تەتقىقاتىدىكى قىزىق تېما بولۇپ ، گېننىڭ ئىپادىلىنىشى ۋە فېنو تىپىك ئالاھىدىلىكى بىلەن زىچ مۇناسىۋەتلىك.RRBS DNA مېتىل تەتقىقاتىنىڭ توغرا ، ئۈنۈملۈك ۋە تېجەشلىك ئۇسۇلى.تەشۋىق قىلغۇچى ۋە CpG ئارال رايونلىرىنى فېرمېنتلىق ئايرىش (Msp I) ئارقىلىق بېسۇلفىت تەرتىپى بىلەن بىرلەشتۈرۈپ ، يۇقىرى ئېنىقلىقتىكى DNA مېتىل بايقاش بىلەن تەمىنلەيدۇ.
سۇپا: Illumina NovaSeq 6000
-
Prokaryotic RNA تەرتىپى
Prokaryotic RNA تەرتىپى كېيىنكى ئەۋلاد تەرتىپلەش (NGS) ئارقىلىق ھۈجەيرە خاتىرىسىنىڭ ئۆزگىرىشىنى ئانالىز قىلىش ئارقىلىق ، مەلۇم بىر ۋاقىتتا RNA نىڭ بار-يوقلۇقىنى ئاشكارىلايدۇ.شىركىتىمىزنىڭ پروكارىئوتىك RNA تەرتىپى ، مەخسۇس گېن گېنلىرى بىلەن پروكارىئوتنى نىشانلاپ ، سىزنى خاتىرىلەش ئارخىپى ، گېن قۇرۇلمىسىنى ئانالىز قىلىش بىلەن تەمىنلەيدۇ. ئۇ ئاساسىي پەن تەتقىقاتى ، دورا تەتقىقاتى ۋە تەرەققىياتىغا كەڭ قوللىنىلدى.
سۇپا: Illumina NovaSeq 6000
