page_head_bg

خەۋەرلەر

GENOME EVOLUTION

Genome De novo
يىغىلىش | جىنسىيەتنى بېكىتىش پۈتكۈل تەرتىپلىك ئەسەرلەر ۋە قىسمەن بىئولوگىيىلىك ئۇچۇر مۇلازىمىتى Biomarker Techonologies تەرىپىدىن تەمىنلەندى.

قىسقىچە مەزمۇنى

«دېڭىز يىلپىزىنىڭ بەلگە خاراكتېرلىك فېنوت تىپى يوپۇرماققا ئوخشاش قوشۇمچە دېتاللار ، چىشسىز نەيچە ئېغىزى ۋە ئوچۇق ھامىلدار تۇخۇمنىڭ ئوچۇق «تۇغما ياماق» قا يوشۇرۇنغانلىقىنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ.بىز ئورتاق دېڭىز يىلپىزى (Phyllopteryx taeniolatus) ۋە ئۇنىڭ زىچ مۇناسىۋەتلىك تۈرلىرى بولغان ئاللىگاتور تۇرۇبىسى (Syngnathoides biaculeatus) نىڭ ئەر-ئايال گېنلىرىنى رەتلەپ چىقتۇق.تەدرىجىي تەرەققىياتنىڭ يېڭىلىنىشىدىكى يوپۇرماق ئارخىپى ، يوپۇرماققا ئوخشاش قوشۇمچە ماتېرىياللاردا كۆرسىتىلىشىچە ، ئادەتتە ئىنچىكە تەرەققىياتقا قاتناشقان بىر يۈرۈش گېنلار بىرلىشىپ تاللانغان ، شۇنداقلا توقۇلمىلارنى ئەسلىگە كەلتۈرۈش ۋە ئىممۇنىتېت مۇداپىئە گېنى ئۈچۈن تران قوليازمىلىرىنى بېيىتقان.بارلىق بىرىكمە ماددىلاردا يوقاپ كەتكەن scpp5 نىڭ زىبراف ئۆزگىرىشى ، يۇتقۇنچاق چىشىنىڭ كەملىكى ياكى شەكلى ئۆزگىرىپ كەتكەنلىكى بايقالدى ، بۇ scpp5 نىڭ يوقىلىشىنىڭ بىرىكمە ماددىلاردىكى چىشنىڭ يوقىلىشىغا سەۋەبچى بولغان پەرەزنى قوللايدۇ.كۆپ ئۇچرايدىغان جىنسىي مۇناسىۋەت - ئورتاق دېڭىز ساھىلى ۋە ئاللىگاتور تۇرۇبىسى ئورتاق ئىشلىتىدىغان ئەرلەرگە خاس amhr2y گېنىنى كودلاشتۇرىدىغان چېكەتكە بېكىتىلدى. »

ماتېرىيال ۋە ئۇسۇل:

ماتېرىياللار

Fبىزنىڭ ئورتاق دېڭىز ساھىلىمىز (P. taeniolatus) ۋە ئىككى ئاللىگاتور تۇرۇبىسى (S. biaculeatus) ئۈلگە.گېن گۇرۇپپىسىنى تەرتىپكە سېلىشتا كۆپ ئۇچرايدىغان ئىككى دېڭىز ساھىلى (بىر ئەر ۋە بىر ئايال) ۋە ئىككى ئاللىگاتور تۇرۇبىسى (بىر ئەر ۋە بىر ئايال) شەخس گېن گۇرۇپپىسىنى تەرتىپكە سېلىشقا ئىشلىتىلگەن ، باشقا ئىككى ئەر ئورتاق دېڭىز ساھىلى شەخسلىرى گېننى ئەسلىگە كەلتۈرۈشكە ئىشلىتىلگەن.

گېن تەرتىپلەش ئىستراتېگىيىسى

270/350 bp كۇتۇپخانىسى (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (Sequel) ياكى Nanopore 30 Kb (MinION) + Hi-C (NovaSeq 6000).

ترانسكرىپسىيە تەرتىپى

Fياكى كۆپ ئۇچرايدىغان دېڭىز يىلپىزى ، مېڭە ، كۆز ، گىل ، جىگەر ، يۈرەك ، بۆرەك ، مەزى بېزى ، ئۈچەي ، مۇسكۇل ، ئىنچىكە ، تېرە ، يوپۇرماققا ئوخشاش قوشۇمچە ماددىلار ، ئۇرۇقدان ۋە تۇخۇمدان قاتارلىقلار توپلانغان.

Genome de novo قۇراشتۇرۇش ئىستراتېگىيىسى

Canu (تۈزىتىش) + WTDBG2 (مەجلىس) + پىلون (پولشاچە) + لاچىس (Hi-C).

Main Results

Fig.-1.-Key-features-of-the-common-seadragon-P.-taeniolatus-and-the-alligator-pipefish-S

1-رەسىم: ئورتاق دېڭىز ساھىلى (P. taeniolatus) ۋە ئاللىگاتور تۇرۇبىسى (S. biaculeatus) ۋە ئۇلارنىڭ فىلوگېنتىك ئورنىنىڭ مۇھىم ئالاھىدىلىكلىرى.

Fig.-2.-Morphology-and-genetic-makeup-of-the-leaf-like-appendages-in-the-common-seadragon-P

2-رەسىم ، ئورتاق دېڭىز ساھىلىدىكى يوپۇرماققا ئوخشاش قوشۇمچە ماددىلارنىڭ مورفولوگىيىسى ۋە گېن گىرىمى (P. taeniolatus).

Fig.-3.-Putative-sex-determination-gene-in-the-common-seadragon-P.-taeniolatus-and-the-alligator-pipefish-S.-biaculeatus

3-رەسىم ، ئورتاق دېڭىز ساھىلى (P. taeniolatus) ۋە ئاللىگېر تۇرۇبىسى (S. biaculeatus) دىكى جىنسىي مۇناسىۋەتنى ئېنىقلاش گېنى.

Fig.-4

4-رەسىم.

پايدىلانما

كۇ م ، ليۇ ي ، جاڭ ي قاتارلىقلار.Seadragon گېن ئانالىزى ئۇنىڭ فېنوت تىپى ۋە جىنسىي بەلگىلەش ئورنى ھەققىدە چۈشەنچە بېرىدۇ.Sci Adv.2021 ؛ 7 (34): eabg5196.2021-يىلى 18-ئاۋغۇست ئېلان قىلىنغان doi: 10.1126 / sciadv.abg5196
يوللانغان ۋاقتى: 1-ئاينىڭ 08-كۈنىدىن 22-كۈنىگىچە

ئۇچۇرىڭىزنى بىزگە ئەۋەتىڭ:

ئىزدەش ئۈچۈن Enter نى بېسىڭ ياكى تاقاش ئۈچۈن ESC نى بېسىڭ