GENOME EVOLUTION
تەبىئەت
COMMUNICATIONS
گېن تەرتىپلىرى يەر شارىنىڭ تارقىلىش يوللىرىنى ئاشكارىلايدۇ ھەمدە دېڭىزنىڭ تەدرىجىي تەرەققىياتىدىكى گېن ئۆزگىرىشىنى ماسلاشتۇرىدۇ
PacBio |Illumina |Hi-C |WGS |ئىرسىيەتنىڭ كۆپ خىللىقى |نوپۇس تارىخى |Gene Flow
Pacbio تەرتىپلەش ، گېن گۇرۇپپىسىنى يېڭىلاش ۋە ئىزاھلاش مۇلازىمىتى Biomarker Technologies تەرىپىدىن تەمىنلەنگەن.
يارقىن نۇقتىلار
1. يۇقىرى سۈپەتلىك خروموسوم دەرىجىلىك دېڭىز قىرغىقى (Hippocampus erectus) گېنى 15.5 Mb بولغان N50 گە ئېرىشتى.
2. دۇنيا مىقياسىدىكى 21 دېڭىز ساھىلى تۈرىدىن جەمئىي 358 گېن ئەسلىگە كەلتۈرۈلدى.
3. دېڭىز ساھىلى ئولىگوسېننىڭ ئاخىرقى مەزگىللىرىدە تەدرىجىي تەرەققىي قىلدى ۋە ئۇنىڭدىن كېيىنكى يەر شارىنى مۇستەملىكە قىلىش لىنىيىسى ئېنىقلاندى ۋە ئوكيان ئېقىمى ۋە قەدىمكى دەۋردىكى دېڭىز يولىنى ئېچىشنىڭ ھەرىكەتلەندۈرگۈچ كۈچى بىلەن باغلاندى.
4. تەكرارلانغان «سۆڭەك ئومۇرتقىسى» ماسلىشىشچان فېنوت تىپىنىڭ گېن ئاساسى ئاچقۇچلۇق تەرەققىيات گېنىدىكى مۇستەقىل ئالماشتۇرۇش بىلەن مۇناسىۋەتلىك.
5. ئوكيان ئېقىمى ئارقىلىق ئۇلاش ناچار تارقاقلىشىشنىڭ ئورنىنى تولۇقلايدۇ ۋە تېز ماسلىشىش يېڭى ماكاننى مۇستەملىكە قىلىشقا قۇلايلىق يارىتىدۇ
مۇۋەپپەقىيەتلەر
358 دېڭىز ئەۋرىشكىسىنىڭ گېن كۆپ خىللىقى ۋە فىلوگېنتىك مۇناسىۋىتى
a22 خىل خىروموسومدىكى 21 دېڭىز ساھىلى تۈرىنىڭ يادروسى كۆپ خىللىقى (π) بىلەن ئەۋرىشكە ئېلىنغان دېڭىز قىرغاقلىرىنىڭ جۇغراپىيىلىك ئەۋرىشكە ئورنى.b 358 دېڭىز قىرغىقىدىكى گېن كەڭلىكى SNP بىلەن ياسالغان قوشنا دەرەخ.(A) دىكى ئورۇن بەلگىلەش بەلگىسى (b) دىكى شاخ تەگلىكى بىر-بىرىگە ماس كېلىدۇ.
2-رەسىم دېڭىز ساھىلىنىڭ مۇستەملىكە قىلىنىشى ۋە نوپۇس تارىخى
aفىلوگېنتىك دەرەخ ۋە ئوخشىماسلىق ۋاقتى 21 دېڭىز ساھىلى تۈرىنىڭ مۆلچەرى.شاخ لىنىيىسىنىڭ قېلىنلىقى نوپۇس كۆلىمىنىڭ مۆلچەرىگە ماس كېلىدۇ ، رەڭلەر ئوخشىمىغان سىزىقلارنى كۆرسىتىدۇ.بەلگە I - III بەلگىلەش نۇقتىسىنى كۆرسىتىدۇ.b - d ئوخشىمىغان ۋاقىت ، تارقىلىش ، ئۆزگىرىش ھادىسىلىرى ۋە ئوكيان ئېقىمى (ئاق ئوق) نى ئاساس قىلغان دېڭىز قىرغاقلىرىنىڭ ئالدىن پەرەز قىلىنغان مۇستەملىكە يولى (رەڭلىك ئوق).b ھىندى-ئاۋىستىرالىيە تاقىم ئارىلى Hippocampus تۈرىنىڭ پەيدا بولۇش مەركىزى (قىزىل بەلگە) بولۇپ ، دېڭىز قىرغاقلىرى كۆپ خىللاشقان ۋە 18-23 مايغىچە تارقالغان.c Seahorses دەسلەپتە ئېچىلغان تېتىيان دېڭىزى ئارقىلىق ئاتلانتىك ئوكياننى مۇستەملىكە قىلدى ، ئۇ تاقالغاندىن كېيىن (7 ~ 13 ماي ئارىلىقىدىكى تېرمىنال پائالىيىتى) بۇ تېتىيان نەسلىنى ھىندى ئوكياندىكى ئاچا-سىڭىللار توپىدىن ئايرىدى.كېيىنكىسى ، كېيىنچە ئەرەب دېڭىزىدا تېز سۈرئەتتە كۆپ خىللاشقان (سېرىق بەلگە) ، دېڭىز قىرغاقلىرىنى كۆپ خىللاشتۇرۇشنىڭ ئىككىنچى مەركىزىنى قۇردى.d ئاتلانتىك ئوكياننىڭ ئىككىنچى دېڭىز قىرغىقىنى مۇستەملىكە قىلىش ھادىسىسى ھىندى ئوكياندىن تەخمىنەن 5Ma ئەتراپىدا جەنۇبىي ئافرىقا ئۇچىدىن ئۆتۈپ ، ئاخىرىدا يەنىلا ئوچۇق بولغان پاناما دېڭىزى ئارقىلىق شەرقىي تىنچ ئوكيانغا يېتىپ كەلدى.
3-رەسىم ئۈنۈملۈك نوپۇس سانىدىكى گېن ئېقىمى ۋە داۋالغۇشى
aجەنۇبىي ئاتلانتىك ئوكياندا ياشايدىغان جانلىقلار ئارىسىدا گېن ئېقىمى بايقالدى.گېن ئېقىمى G-PhoCS تەرىپىدىن چىقىرىلغان كۆچۈش نىسبىتى سۈپىتىدە ئاق سىزىقنىڭ يېنىدا كۆرسىتىلدى.ئوقنىڭ قېلىنلىقى ۋە يۆنىلىشى ئايرىم-ئايرىم ھالدا گېن ئېقىمىنىڭ نىسبىتى ۋە يۆنىلىشىگە ماس كېلىدۇ.b PSMC نىڭ ئۈنۈملۈك نوپۇس كۆلىمىنىڭ داۋالغۇشى.X ئوقى ھازىرقى يىللاردىكى ۋاقىتقا ۋەكىللىك قىلىدۇ ، y ئوق بولسا ئۈنۈملۈك نوپۇس كۆلىمىگە ۋەكىللىك قىلىدۇ.بۇ دىئاگراممىلار ئاساسلىقى ئوخشىمىغان تارقىلىش رايونى بولغان ھەر بىر تۈرنىڭ جۇغراپىيىلىك تەقسىملىنىشىگە ئاساسەن تەشكىللەنگەن.c ئۆتكەن 1 مىليون يىل ئىچىدە دېڭىز يۈزىنىڭ ئۆزگىرىشى.سېرىق سىزىق يەرشارىدىكى ئەڭ ئاخىرقى چوققا چوققىنى كۆرسىتىدۇ ، سىيان سايىسى ئەڭ ئاخىرقى مۇزلۇقنىڭ ئەڭ چوڭ دەۋرىنى كۆرسىتىدۇ.
4-رەسىم ئومۇرتقىنىڭ ئۆزگىرىشى.
aسول تەرەپتە ، دېڭىز ساھىلىدىكى ئومۇرتقانىڭ مۇستەقىل ئۆزگىرىشىنى كۆرسىتىدىغان دەرەخلەر.شاخنىڭ ئۇزۇنلۇقى ھەر بىر بېكەتنىڭ ئورنىنى ئالىدىغان ئورۇننى كۆرسىتىدۇ.كۆك رەڭلىك تۆت خىل يۇمىلاق دېڭىز تۈرى گەۋدىلەندۈرۈلگەن.قېلىن شاخلار bmp3 گېنى ئۈچۈن نامسىز-ماس قەدەملىك ئالماشتۇرۇش (dN / dS) نىڭ تېخىمۇ يۇقىرى نىسبىتىگە ماس كېلىدۇ.Canonical ۋە ئومۇملاشتۇرۇلغان ماكدونالد ۋە Kreitman سىنىقى (MKT) bmp3 گېنى ئۈچۈن ئۈچ جۈپ قوشكېزەك ئاچا-سىڭىل تۈرى ئۈچۈن ئېلىپ بېرىلدى ، تەگلىك رەڭگىدە پەرقلىنىدىغان ئومۇرتقا ۋە ئومۇرتقا ئارىلاشماسلىق ئالاھىدىلىكى بار ، ئۇلارنىڭ مۇھىملىق دەرىجىسى ئايرىم-ئايرىم ھالدا كۆك ۋە قىزىل خەت بىلەن p قىممىتى بىلەن كۆرسىتىلدى.توغرا ، bmp3 ئاقسىلىدىكى ئامىنو كىسلاتانىڭ ئورنىنى ئېلىش ، كۆپ قۇتۇپلۇق ۋە ئومۇرتقا دېڭىز قىرغىقىدىكى مۇقىم ئورۇننى سېلىشتۇرۇش ئايرىم-ئايرىم ھالدا قىزىل ۋە كۆك چەمبەر بىلەن كۆرسىتىلدى.b ئومۇرتقا تۈرىدىكى جانلىقلارغا سېلىشتۇرغاندا ، bmp3 دىكى dN / dS قىممىتىنىڭ تارقىلىشى.c فىلوگېنتىك دەرەختىكى مۇستەقىل تەدرىجى تەرەققىيات bmp3 كودلاشتۇرۇلغان ئاقسىل ئۈچۈن قايتا قۇرۇلدى.d Hippocampus erectus دىكى bmp3 نىڭ ئورنى بىرىكتۈرۈلگەن.
پايدىلانما
Li C قاتارلىقلار.گېن تەرتىپلىرى يەر شارىنىڭ تارقىلىش يوللىرىنى ئاشكارىلايدۇ ھەمدە دېڭىزنىڭ تەدرىجىي تەرەققىياتىدىكى گېن ئۆزگىرىشىنى ماسلاشتۇرىدۇ.Nat Commun.2021-يىلى 2-ئاينىڭ 17-كۈنى ؛ 12 (1): 1094.
خەۋەر ۋە يارقىن نۇقتىلار ئەڭ يېڭى مۇۋەپپەقىيەت قازانغان ئەھۋاللارنى Biomarker Technologies بىلەن ئورتاقلىشىشنى ، روماندىكى ئىلمىي مۇۋەپپەقىيەتلەرنى شۇنداقلا تەتقىقات جەريانىدا قوللىنىلغان كۆرۈنەرلىك تېخنىكىلارنى ئىگىلەشنى مەقسەت قىلىدۇ.
يوللانغان ۋاقتى: Jan-06-2022