MICROBIAL ECOLOGY
دېھقانچىلىقنىڭ كۈچىيىشى مىكروب تورىنىڭ مۇرەككەپلىكىنى ۋە يىلتىزدىكى ئاچقۇچلۇق تاكسىنىڭ كۆپلۈكىنى ئازايتىدۇ
تولۇق ئۇزۇنلۇقتىكى ئامپىكون تەرتىپى (ITS) |PacBio HIFI
يارقىن نۇقتىلار
Aئوزۇقلۇقنىڭ ئىشلىتىلىش ئۈنۈمى تۆۋەن بولۇش ، يەر ئاستى سۈيىنىڭ ئېتروففىزىيىسى ، تۇپراق سۈپىتىنىڭ ناچارلىشىشى قاتارلىق ناچار مۇھىت تەسىرى تۈپەيلىدىن ، دېھقانچىلىقنىڭ زىچلىقى كۈنسېرى ئېغىرلىشىۋاتىدۇ.مىكروب توپلىمى دېھقانچىلىق سىستېمىسىنىڭ ئىشلەپچىقىرىش كۈچى ۋە سىجىللىقىدا كەم بولسا بولمايدىغان رول ئوينايدۇ.قانداقلا بولمىسۇن ، ئوخشىمىغان دېھقانچىلىق سىستېمىسىنىڭ يىلتىز مىكروبوتاغا قانداق تەسىر كۆرسىتىدىغانلىقى ئېنىق ئەمەس.
تەجرىبە لايىھىسى
تەجرىبە
Sماي ۋە يىلتىز (DNA) ئەۋرىشكىسى 60 دېھقانچىلىق ئېتىزىدىكى بۇغداي ئېتىزىدىن (ھەر بىرى 20)
Gرەتلەش: 1. ئەھدىنامە (يەر ھەيدەش بىلەن)2. ئەھدىنامە (يەر تېرىش)3. ئورگانىك تېرىلغۇ يەر
Sتەڭپۇڭلاشتۇرۇش ئىستراتېگىيىسى: تولۇق ئۇزۇنلۇقتىكى ئامپلون تەرتىپى (ITS)
Primers: ITS1F-ITS4 (پۈتكۈل ITS رايونىنى نىشانلىغان ~ 630 bp)
Sتەڭپۇڭلاشتۇرۇش سۇپىسى: PacBio RS II
Bioinformatic Analysis
نەتىجە
On ھەر بىر بېكەتتە ئوتتۇرا ھېساب بىلەن 357 OTU ۋە 60 بېكەتنىڭ جەمئىي 837 OTU ئېنىقلانغان.يىلتىز زەمبۇرۇغ مەھەللىسىنىڭ ئالفا كۆپ خىللىقى ئۈچ دېھقانچىلىق سىستېمىسىدا كۆرۈنەرلىك پەرقنى كۆرسەتمەيتتى.قانداقلا بولمىسۇن ، سىناقنىڭ كۆپ خىللىقىنى ئانالىز قىلىشتا ئۈچ خىل ئالاھىدە گۇرۇپپا شەكىللەنگەن بولۇپ ، دېھقانچىلىق سىستېمىسىنىڭ يىلتىز زەمبۇرۇغ قۇرۇلمىسىغا كۈچلۈك تەسىر كۆرسىتىدىغانلىقىنى كۆرسىتىپ بېرىدۇ.
رەسىم 1. يىلتىز زەمبۇرۇغ مەھەللىسىدىكى ئالفا كۆپ خىللىقى (شاننون كۆرسەتكۈچى ۋە مەھەللە تەركىبى) ۋە سىناقنىڭ كۆپ خىللىقىنى ئانالىز قىلىش (ئاساسلىق كوئوردېناتنىڭ كانون ئانالىزى)
Ten ئاچقۇچلۇق تاكسى ئۈچ دېھقانچىلىق سىستېمىسىدىكى زەمبۇرۇغ مەھەللىسىنىڭ ئومۇمىي تورىغا ئاساسەن بېكىتىلدى: دەرىجىسى ئەڭ يۇقىرى ، يېقىنلىق دەرىجىسى ئەڭ يۇقىرى ، ئوتتۇرىدىكى ئەڭ تۆۋەن 10 تۈگۈن تاللاندى.ئۇلارنىڭ يەتتىسى مىجەزى زاكازغا تەۋە ئىدى.
رەسىم 2. ئۈچ دېھقانچىلىق سىستېمىسىنىڭ يىلتىز زەمبۇرۇغ مەھەللىسىدىكى ئومۇمىي تور
Fقورال-ياراغ سىستېمىسىغا خاس تورلار ئورگانىك تورنىڭ ئۇلىنىشى بىر قەدەر يۇقىرى بولۇپ ، ئۇلىنىش ۋە مۇنتىزىم تورغا قارىغاندا ئىككى ھەسسە ئارتۇق.ئۇنىڭ ئۈستىگە ، ئورگانىك دېھقانچىلىق تورى باشقالارغا سېلىشتۇرغاندا تېخىمۇ كۆپ ئاچقۇچلۇق تاكسى (ئالماس) نى ساقلىدى ، بۇ ئۇنىڭ مۇرەككەپلىكى ۋە ئۇلىنىشىنى قوللىدى.
رەسىم 3. دېھقانچىلىق سىستېمىسىغا خاس يىلتىز زەمبۇرۇغ تورى
Aدېھقانچىلىقنىڭ كۈچلۈكلۈكى بىلەن يىلتىز زەمبۇرۇغ تورىنىڭ ئۇلىنىشى ئوتتۇرىسىدا كۈچلۈك سەلبىي باغلىنىش كۆرۈلگەن.تاسادىپىي ئورمان تەھلىلى ئاچقۇچلۇق تاش تاكسىنىڭ ئاساسلىق قوزغاتقۇچىلىرىنى ئاشكارىلىدى: تۇپراق فوسفور ، كۆپ مىقداردىكى زىچلىق ، pH ۋە مىكرو ئورگانىزم.
رەسىم 4. دېھقانچىلىقنىڭ كۈچلۈكلۈك دەرىجىسى ۋە ئۈچ دېھقانچىلىق سىستېمىسى (A ۋە B) دىكى تورنىڭ ئۇلىنىشىئىختىيارى ئورمان ئانالىزى (C) ۋە دېھقانچىلىقنىڭ كۈچلۈكلۈكى بىلەن AMF مۇستەملىكىسىنىڭ مۇناسىۋىتى (D)
تېخنىكا
تولۇق ئۇزۇنلۇقتىكى ئامپلون تەرتىپى
As «ئۈچىنچى ئەۋلاد تەرتىپ» سەھنىگە چىقىۋاتىدۇ ، نىشانلىق رايونلاردىكى چەكلىمىلەر ۋە نوۋو يىغىلىشىدىكى ئاۋارىچىلىقلار يەڭدى.تېنچ ئوكيان بىئولوگىيىسى (PacBio) تەرتىپلىك ئوقۇشنى مۇۋەپپەقىيەتلىك ھالدا نەچچە ئون كىلوبوزاغا ئۇزارتتى ، بۇ بىزنىڭ باكتېرىيەدىكى 16s rRNA (1000 bp-1500 bp) ياكى 18S rRNA (1500 bp-2000 bp) ۋە ITS لارنى تولۇق ئوقۇيالايدۇ. رايونلار (400 bp-900 bp) eukaryotics.ئىرسىيەت مەيدانىنىڭ كېڭىيىشى جانلىقلارنىڭ ئىزاھلىنىشى ۋە ئىقتىدار گېنىنىڭ ئېنىقلىق دەرىجىسىنى زور دەرىجىدە يۇقىرى كۆتۈردى.ئاساسى توغرىلىق مەسىلىسىگە ئۇزۇندىن بۇيان كۆڭۈل بۆلىدىغان مەسىلە PacBio CCS ئۆز-ئۆزىنى تۈزىتىش ئارقىلىق ھەل قىلىنغان بولۇپ ، HIFI ئوقۇش نىسبىتىنى 99% تىن يۇقىرى بولغان.
OTU ئىزاھاتىدىكى ئىقتىدار
Tئۇزۇن ئوقۇش ۋە يۇقىرى ئۈنۈملۈك بولۇشنىڭ ئەۋزەللىكى ، ئىزاھنىڭ توغرىلىق دەرىجىسىنى زور دەرىجىدە ئاشۇرغىلى ۋە مىكروب پەرقلەندۈرۈشتە «تۈر دەرىجىلىك» ئېنىقلىقنى ئەمەلگە ئاشۇرغىلى بولىدۇ.
پايدىلانما
بانېرجى ، سامىران قاتارلىقلار.«دېھقانچىلىقنىڭ كۈچىيىشى مىكروب تورىنىڭ مۇرەككەپلىكىنى ۋە يىلتىزدىكى ئاچقۇچلۇق تاكسىنىڭ موللىقىنى تۆۋەنلىتىدۇ».ISME Journal ۇرنىلى (2019).
تېخنىكا ۋە يارقىن نۇقتىلار ئوخشىمىغان يۇقىرى سۈرئەتلىك تەرتىپلەش تېخنىكىسىنىڭ ھەرخىل رېشاتكىلار سەھنىسىدىكى ئەڭ يېڭى مۇۋەپپەقىيەتلىك قوللىنىلىشىنى شۇنداقلا تەجرىبە لايىھىلەش ۋە سانلىق مەلۇمات قېزىشتىكى پارلاق ئىدىيىلەرنى ئورتاقلىشىشنى مەقسەت قىلىدۇ.
يوللانغان ۋاقتى: 1-ئاينىڭ 08-كۈنىدىن 22-كۈنىگىچە