-
ئۆسۈملۈك / ھايۋانات دې نوۋو گېن گۇرۇپپىسىنىڭ تەرتىپى
De novoتەرتىپلەش دېگىنىمىز تەرتىپلەش تېخنىكىسى ئارقىلىق بىر تۈرنىڭ پۈتكۈل گېن گۇرۇپپىسىنى كۆرسىتىدۇ ، مەسىلەن PacBio ، Nanopore ، NGS قاتارلىقلار.ئۈچىنچى ئەۋلاد تەرتىپلەش تېخنىكىسىنىڭ ئوقۇش ئۇزۇنلۇقىنىڭ كۆرۈنەرلىك ياخشىلىنىشى مۇرەككەپ گېنلارنى قۇراشتۇرۇشتا يېڭى پۇرسەت ئېلىپ كەلدى ، مەسىلەن گېنىروزوزوزلىق دەرىجىسى يۇقىرى ، تەكرارلانغان رايونلارنىڭ نىسبىتى يۇقىرى ، پولىپلوئىد قاتارلىقلار. تەكرارلانغان ئېلېمېنتلارنى ھەل قىلىش ، GC مەزمۇنى نورمال بولمىغان رايونلار ۋە باشقا مۇرەككەپ رايونلارنى ھەل قىلىش.
سۇپا ： PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C نى ئاساس قىلغان گېن گۇرۇپپىسى
Hi-C يېقىن ئارىلىقنى ئاساس قىلغان ئۆز-ئارا تەسىر كۆرسىتىش ۋە يۇقىرى سۈرئەتلىك تەرتىپنى بىرلەشتۈرۈش ئارقىلىق خىروموسوم سەپلىمىسىنى تۇتۇش ئۈچۈن لايىھەلەنگەن ئۇسۇل.بۇ ئۆز-ئارا تەسىرنىڭ كۈچلۈكلۈكى خىروموسومدىكى فىزىكىلىق ئارىلىق بىلەن سەلبىي باغلىنىشلىق دەپ قارىلىدۇ.شۇڭلاشقا ، Hi-C سانلىق مەلۇماتلىرى گېن گۇرۇپپىسىدىكى قۇراشتۇرۇلغان تەرتىپلەرنىڭ توپلىنىشى ، رەتلىنىشى ۋە يۆنىلىشىگە يېتەكچىلىك قىلالايدۇ ھەمدە مەلۇم ساندىكى خروموسومغا چاپلايدۇ.بۇ تېخنىكا نوپۇسنى ئاساس قىلغان گېن خەرىتىسى بولمىغان ئەھۋالدا خروموسوم دەرىجىلىك گېن گۇرۇپپىسىنى كۈچلەندۈرىدۇ.ھەر بىر گېنغا Hi-C لازىم بولىدۇ.
سۇپا ： Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
تەدرىجى تەرەققىيات گېنىتىكىسى
تەدرىجى تەرەققىيات گېنىتىكىسى SNPs ، InDels ، SVs ۋە CNV لارنى ئۆز ئىچىگە ئالغان گېن ئۆزگىرىشىنى ئاساس قىلغان بېرىلگەن ماتېرىياللارنىڭ تەدرىجىي تەرەققىيات ئۇچۇرلىرىنى ئەتراپلىق چۈشەندۈرۈش ئۈچۈن لايىھەلەنگەن يۈرۈشلۈك مۇلازىمەت.ئۇ نوپۇسنىڭ قۇرۇلمىسى ، گېننىڭ كۆپ خىللىقى ، فىلوگېنلىق مۇناسىۋىتى قاتارلىق كىشىلەرنىڭ تەدرىجىي ئۆزگىرىشى ۋە گېن ئالاھىدىلىكىنى تەسۋىرلەشكە ئېھتىياجلىق بولغان بارلىق ئاساسلىق ئانالىزلارنى تەمىنلەيدۇ.
-
سېلىشتۇرما گېنولوگىيىسى
سېلىشتۇرما گېنولوگىيە مەنىسى ئوخشىمىغان تۈرلەرنىڭ مۇكەممەل گېن تەرتىپى ۋە قۇرۇلمىسىنى سېلىشتۇرۇشنى كۆرسىتىدۇ.بۇ پەن ئوخشىمىغان تۈرلەردە ساقلانغان ياكى پەرقلىنىدىغان تەرتىپ قۇرۇلمىسى ۋە ئېلېمېنتلىرىنى پەرقلەندۈرۈش ئارقىلىق گېننىڭ سەۋىيىسىدىكى جانلىقلارنىڭ تەدرىجىي تەرەققىي قىلىشى ، گېن ئىقتىدارى ، گېننى تەڭشەش مېخانىزمىنى ئاشكارىلاشنى مەقسەت قىلىدۇ.تىپىك سېلىشتۇرما گېن تەتقىقاتى گېن جەمەتىدىكى ئانالىز ، تەدرىجىي تەرەققىيات ، پۈتكۈل گېن كۆپەيتىش ، تاللاش بېسىمى قاتارلىقلارنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ.
-
توپلانغان Segregant تەھلىلى
توپلانغان ئايرىش ئانالىزى (BSA) فېنوت تىپىغا مۇناسىۋەتلىك گېن بەلگىسىنى تېز پەرقلەندۈرۈش ئۈچۈن قوللىنىلىدىغان تېخنىكا.BSA نىڭ ئاساسلىق خىزمەت ئېقىمى ئىنتايىن قارشى تۇرىدىغان فېنوت تىپىغا ئىگە ئىككى گۇرۇپپىنى تاللاشنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ ، بارلىق شەخسلەرنىڭ DNA سىنى بىرلەشتۈرۈپ ، ئىككى تۈركۈم DNA ھاسىل قىلىدۇ ، ئىككى كۆلچەكنىڭ پەرقلىق تەرتىپىنى پەرقلەندۈرىدۇ.بۇ تېخنىكا ئۆسۈملۈك / ھايۋانات گېنلىرىدىكى نىشانلىق گېن بىلەن كۈچلۈك مۇناسىۋەتلىك گېن بەلگىسىنى پەرقلەندۈرۈشتە كەڭ قوللىنىلدى.
