ØCircRNA mRNA ئىپادىسىنى تەڭشەش بىلەن ناھايىتى زىچ مۇناسىۋەتلىك
ØCircRNA - miRNA - mRNA نى تەڭشەش سىستېمىسىغا قاتناشتى
Øمەشھۇر ئايلانما RNA ۋە رومان circRNA نى ئېنىقلاش ۋە ئىستاتىستىكا قىلىش
ØBMKCloud نى ئاساس قىلغان نەتىجىنى يەتكۈزۈش: سۇپادا خاسلاشتۇرۇلغان سانلىق مەلۇمات قېزىش.
Øسېتىلغاندىن كېيىنكى مۇلازىمەت تۈر تاماملانغاندىن كېيىن 3 ئاي كۈچكە ئىگە
Nucleotides:
ساپلىق | سەمىمىيەت | بۇلغىنىش | سومما |
OD260 / 280≥1.7-2.5;OD260 / 230≥0.5-2.5; | ئۆسۈملۈكلەر ئۈچۈن: RIN≥6.5;ھايۋانلار ئۈچۈن: RIN≥7;28S / 18S≥1.0;ئاساسىي ئېگىزلىكى چەكلىك ياكى يوق | گېلىدا كۆرسىتىلگەن ئاقسىل ياكى DNA نىڭ بۇلغىنىشى چەكلىك ياكى يوق. | Conc.≥100ng / μl;توم ≥ 10 μl;ئومۇمىي ≥2μg |
توقۇلما: ئېغىرلىقى (قۇرۇق): ≥1 g
* 5 مىللىگىرامدىن كىچىك توقۇلمىلارغا چاقماق توڭلىتىلغان (سۇيۇق ئازوتتا) توقۇلما ئەۋرىشكىسىنى ئەۋەتىشنى تەۋسىيە قىلىمىز.
كاتەكچە ئاسما: ھۈجەيرە سانى = 3 × 107
* توڭلىتىلغان ھۈجەيرە لەيلىسىنى ئەۋەتىشنى تەۋسىيە قىلىمىز.بۇ كاتەكچىنىڭ سانى 5 × 10 دىن كىچىك بولسا5، سۇيۇق ئازوتتا توڭلىتىلغان چاقماق لامپىسى تەۋسىيە قىلىنىدۇ.
قان ئەۋرىشكىسى:
PA×geneBloodRNATube;
6mLTRIzol ۋە 2mL قان (TRIzol:قېنى= 3: 1)
تەۋسىيە قىلىنغان ئەۋرىشكە يەتكۈزۈش
كونتېينېر: 2 مىللىمېتىر مەركەزدىن قاچۇرۇش نەيچىسى (قەلەي ياپقۇچ تەۋسىيە قىلىنمايدۇ)
ئۈلگە بەلگە: گۇرۇپپا + كۆپەيتىش مەسىلەن A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
مال ئەۋەتىش:
قۇرۇق مۇز: ئەۋرىشكەلەرنى خالتىغا قاچىلاش ۋە قۇرۇق مۇزغا كۆتۈرۈش كېرەك.
RNA تۇراقلىق تۇرۇبا: RNA ئەۋرىشكىسىنى RNA تۇراقلاشتۇرۇش تۇرۇبىسىدا قۇرۇتقىلى بولىدۇ (مەسىلەن RNAstable®) ھەمدە ئۆي تېمپېراتۇرىسىدا توشۇشقا بولىدۇ.
Bioinformatics
1.CircRNA رىياسەتچىسى
ئىگىلىنىشچە ، ئايلانما RNA نىڭ كۆپىنچىسى ئىچكى ئەزالار ياكى رايونلار ئارا ئەمەس ، بەلكى تاشقى مۇھىتتىن كەلگەن.ئۇنىڭ ئۈستىگە ، خىروموسوم ئارىسىدا circRNA نىڭ تارقىلىشى كۆرۈنەرلىك پەرقلىنىدۇ.شۇڭلاشقا ، ئوخشىمىغان ئەۋرىشكەلەر ئارىسىدىكى ئايلانما RNA ساھىبجاماللىرىنىڭ ئوخشىمىغان گېن رايونلىرىغا ۋە ئوخشىمىغان خروموسوملارغا تارقىلىشىنى ئۆز ئىچىگە ئالغان ئوخشىمىغان تەقسىماتلارنى باھالاش ئىنتايىن مۇھىم.
CircRNA رىياسەتچىسىنىڭ تارقىتىلىشى
2. DE-circRNA دىكى توپلاش ئانالىزى
ئوخشىمىغان ئىپادىلەنگەن ئايلانما RNA نىڭ قاتلاملىق توپلىنىشى
3. DE-circRNA ساھىبجامال گېنىدىكى GO ئىزاھاتى
DE-circRNA ساھىبجامال گېنلىرىنى تۈرگە ئايرىش
BMK دېلوسى
CPSF4 جىگەر قان تومۇر ئۆسمىسىدە ئايلانما RNA نىڭ شەكىللىنىشى ۋە مىكرو RNA ۋاسىتىلىك گېننىڭ سۈكۈت قىلىشىنى تەڭشەيدۇ
ئېلان قىلىنغان: Oncogene, 2021
ئاچقۇچلۇق نەتىجىلەر
1.CPSF4 ئىپادىسى HCC دا تەڭشەلگەن بولۇپ ، CPSF4 نىڭ يۇقىرى ئىپادىلىنىشى HCC بىمارلىرىدىكى ئالدىن پەرەز قىلىش بىلەن مۇناسىۋەتلىك.
2. CPSF4 كۆپ قۇتۇپلۇق سىگنال تەرتىپىگە ئىگە ئايلانما RNA نىڭ سەۋىيىسىنى تۆۋەنلىتىدۇ ۋە ئايلانما RNA نىڭ بۇ تۆۋەنلىشى miRNA نىڭ يىغىلىشىنى ئازايتىدۇ ۋە HCC دىكى miRNA ۋاسىتىچى گېننىڭ سۈكۈت قىلىشىنى بۇزىدۇ.
3. ھۈجەيرە مەدەنىيىتى ۋە xenograft مائۇس مودېلىدىكى تەجرىبە شۇنى ئىسپاتلىدىكى ، CPSF4 HCC ھۈجەيرىسىنىڭ كۆپىيىشىنى ئىلگىرى سۈرۈپ ، ئۆسمىنىڭ ئۆسۈشىنى ئىلگىرى سۈرىدۇ.ئۇنىڭ ئۈستىگە ، CPSF4 HCC دىكى تۆۋەنكى ئېقىندىكى RNA نىڭ ئۆسمىنى بېسىش رولىغا قارشى تۇرىدۇ
miRNA سەۋىيىسى ۋە ئاقسىل مىقدارى |
ۋاڭ X ، دوڭ ج ، لى X قاتارلىقلار.CPSF4 جىگەر قان تومۇر ئۆسمىسىدە ئايلانما RNA نىڭ شەكىللىنىشى ۋە مىكرو RNA ۋاسىتىلىك گېننىڭ سۈكۈت قىلىشىنى تەڭشەيدۇ.Oncogene.DOI : 10.1038 / s41388-021-01867-6