page_head_bg

مەھسۇلاتلار

circRNA تەرتىپى-ئىللۇمىنا

پۈتۈن ترانسكرىپسىيە تەرتىپى مەلۇم بىر ۋاقىتتا ئالاھىدە ھۈجەيرىلەر تەرىپىدىن كۆچۈرۈلگەن كودلاش (mRNA) ۋە كودلاشتۇرمايدىغان RNA (lncRNA ، circRNA ۋە miRNA نى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ) نى ئۆز ئىچىگە ئالغان بارلىق RNA مولېكۇلالىرىنى ئارخىپلاشتۇرۇش ئۈچۈن لايىھەلەنگەن.پۈتۈن ترانسكرىپسىيە تەرتىپى ، «ئومۇمىي RNA تەرتىپى» دەپمۇ ئاتىلىدۇ ، خاتىرىلەش سەۋىيىسىدە ئەتراپلىق نازارەت قىلىپ باشقۇرۇش تورىنى ئاشكارىلاشنى مەقسەت قىلىدۇ.NGS تېخنىكىسىدىن پايدىلىنىپ ، بارلىق ترانسكرىپسىيەلىك مەھسۇلاتلارنىڭ رەت تەرتىپىنى ceRNA ئانالىزى ۋە بىرلەشمە RNA ئانالىزىغا ئىشلىتىشكە بولىدۇ ، بۇ ئىقتىدار ئالاھىدىلىكى ئۈچۈن بىرىنچى قەدەم بىلەن تەمىنلەيدۇ.CircRNA-miRNA-mRNA نى ئاساس قىلغان ceRNA نىڭ نازارەت قىلىپ باشقۇرۇش تورىنى ئاشكارىلاش.


مۇلازىمەت تەپسىلاتلىرى

Bioinformatics

Demo Results

Case Study

مۇلازىمەت ئەۋزەللىكى

ØCircRNA mRNA ئىپادىسىنى تەڭشەش بىلەن ناھايىتى زىچ مۇناسىۋەتلىك

ØCircRNA - miRNA - mRNA نى تەڭشەش سىستېمىسىغا قاتناشتى

Øمەشھۇر ئايلانما RNA ۋە رومان circRNA نى ئېنىقلاش ۋە ئىستاتىستىكا قىلىش

ØBMKCloud نى ئاساس قىلغان نەتىجىنى يەتكۈزۈش: سۇپادا خاسلاشتۇرۇلغان سانلىق مەلۇمات قېزىش.

Øسېتىلغاندىن كېيىنكى مۇلازىمەت تۈر تاماملانغاندىن كېيىن 3 ئاي كۈچكە ئىگە

ئۈلگە تەلەپ ۋە يەتكۈزۈش

ئەۋرىشكە تەلەپلىرى:

Nucleotides:

ساپلىق سەمىمىيەت بۇلغىنىش سومما
OD260 / 280≥1.7-2.5;OD260 / 230≥0.5-2.5; ئۆسۈملۈكلەر ئۈچۈن: RIN≥6.5;ھايۋانلار ئۈچۈن: RIN≥7;28S / 18S≥1.0;ئاساسىي ئېگىزلىكى چەكلىك ياكى يوق گېلىدا كۆرسىتىلگەن ئاقسىل ياكى DNA نىڭ بۇلغىنىشى چەكلىك ياكى يوق. Conc.≥100ng / μl;توم ≥ 10 μl;ئومۇمىي ≥2μg

توقۇلما: ئېغىرلىقى (قۇرۇق): ≥1 g
* 5 مىللىگىرامدىن كىچىك توقۇلمىلارغا چاقماق توڭلىتىلغان (سۇيۇق ئازوتتا) توقۇلما ئەۋرىشكىسىنى ئەۋەتىشنى تەۋسىيە قىلىمىز.

كاتەكچە ئاسما: ھۈجەيرە سانى = 3 × 107
* توڭلىتىلغان ھۈجەيرە لەيلىسىنى ئەۋەتىشنى تەۋسىيە قىلىمىز.بۇ كاتەكچىنىڭ سانى 5 × 10 دىن كىچىك بولسا5، سۇيۇق ئازوتتا توڭلىتىلغان چاقماق لامپىسى تەۋسىيە قىلىنىدۇ.

قان ئەۋرىشكىسى:
PA×geneBloodRNATube;
6mLTRIzol ۋە 2mL قان (TRIzol:قېنى= 3: 1)

تەۋسىيە قىلىنغان ئەۋرىشكە يەتكۈزۈش
كونتېينېر: 2 مىللىمېتىر مەركەزدىن قاچۇرۇش نەيچىسى (قەلەي ياپقۇچ تەۋسىيە قىلىنمايدۇ)
ئۈلگە بەلگە: گۇرۇپپا + كۆپەيتىش مەسىلەن A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...

مال ئەۋەتىش:
قۇرۇق مۇز: ئەۋرىشكەلەرنى خالتىغا قاچىلاش ۋە قۇرۇق مۇزغا كۆتۈرۈش كېرەك.
RNA تۇراقلىق تۇرۇبا: RNA ئەۋرىشكىسىنى RNA تۇراقلاشتۇرۇش تۇرۇبىسىدا قۇرۇتقىلى بولىدۇ (مەسىلەن RNAstable®) ھەمدە ئۆي تېمپېراتۇرىسىدا توشۇشقا بولىدۇ.

مۇلازىمەت خىزمىتى ئېقىمى

logo_01

تەجرىبە لايىھىسى

logo_02

ئۈلگە يەتكۈزۈش

logo_03

RNA ئېلىش

logo_04

كۈتۈپخانا قۇرۇلۇشى

logo_05

تەرتىپلەش

logo_06

سانلىق مەلۇمات ئانالىزى

logo_07

سېتىشتىن كېيىنكى مۇلازىمەتلەر


  • ئالدىنقى:
  • كېيىنكى:

  • Bioinformatics

    CircRNA-sequencing-analysis-workflow

    1.CircRNA رىياسەتچىسى

    ئىگىلىنىشچە ، ئايلانما RNA نىڭ كۆپىنچىسى ئىچكى ئەزالار ياكى رايونلار ئارا ئەمەس ، بەلكى تاشقى مۇھىتتىن كەلگەن.ئۇنىڭ ئۈستىگە ، خىروموسوم ئارىسىدا circRNA نىڭ تارقىلىشى كۆرۈنەرلىك پەرقلىنىدۇ.شۇڭلاشقا ، ئوخشىمىغان ئەۋرىشكەلەر ئارىسىدىكى ئايلانما RNA ساھىبجاماللىرىنىڭ ئوخشىمىغان گېن رايونلىرىغا ۋە ئوخشىمىغان خروموسوملارغا تارقىلىشىنى ئۆز ئىچىگە ئالغان ئوخشىمىغان تەقسىماتلارنى باھالاش ئىنتايىن مۇھىم.

     

    Distribution-of-circRNA-host

     

    CircRNA رىياسەتچىسىنىڭ تارقىتىلىشى

    2. DE-circRNA دىكى توپلاش ئانالىزى
    Hierarchical-clustering-of-differentially-expressed-circRNAs

    ئوخشىمىغان ئىپادىلەنگەن ئايلانما RNA نىڭ قاتلاملىق توپلىنىشى

    3. DE-circRNA ساھىبجامال گېنىدىكى GO ئىزاھاتى

    C01_vs_C02

    DE-circRNA ساھىبجامال گېنلىرىنى تۈرگە ئايرىش

    BMK دېلوسى

    CPSF4 جىگەر قان تومۇر ئۆسمىسىدە ئايلانما RNA نىڭ شەكىللىنىشى ۋە مىكرو RNA ۋاسىتىلىك گېننىڭ سۈكۈت قىلىشىنى تەڭشەيدۇ

    ئېلان قىلىنغان: Oncogene, 2021

    ئاچقۇچلۇق نەتىجىلەر

    1.CPSF4 ئىپادىسى HCC دا تەڭشەلگەن بولۇپ ، CPSF4 نىڭ يۇقىرى ئىپادىلىنىشى HCC بىمارلىرىدىكى ئالدىن پەرەز قىلىش بىلەن مۇناسىۋەتلىك.
    2. CPSF4 كۆپ قۇتۇپلۇق سىگنال تەرتىپىگە ئىگە ئايلانما RNA نىڭ سەۋىيىسىنى تۆۋەنلىتىدۇ ۋە ئايلانما RNA نىڭ بۇ تۆۋەنلىشى miRNA نىڭ يىغىلىشىنى ئازايتىدۇ ۋە HCC دىكى miRNA ۋاسىتىچى گېننىڭ سۈكۈت قىلىشىنى بۇزىدۇ.
    3. ھۈجەيرە مەدەنىيىتى ۋە xenograft مائۇس مودېلىدىكى تەجرىبە شۇنى ئىسپاتلىدىكى ، CPSF4 HCC ھۈجەيرىسىنىڭ كۆپىيىشىنى ئىلگىرى سۈرۈپ ، ئۆسمىنىڭ ئۆسۈشىنى ئىلگىرى سۈرىدۇ.ئۇنىڭ ئۈستىگە ، CPSF4 HCC دىكى تۆۋەنكى ئېقىندىكى RNA نىڭ ئۆسمىنى بېسىش رولىغا قارشى تۇرىدۇ

    PB-full-length-RNA-Sequencing-case-study

    miRNA سەۋىيىسى ۋە ئاقسىل مىقدارى

    پايدىلانما

    ۋاڭ X ، دوڭ ج ، لى X قاتارلىقلار.CPSF4 جىگەر قان تومۇر ئۆسمىسىدە ئايلانما RNA نىڭ شەكىللىنىشى ۋە مىكرو RNA ۋاسىتىلىك گېننىڭ سۈكۈت قىلىشىنى تەڭشەيدۇ.Oncogene.DOI : 10.1038 / s41388-021-01867-6

    باھاغا ئېرىشىش

    ئۇچۇرىڭىزنى بۇ يەرگە يېزىڭ ۋە بىزگە ئەۋەتىڭ

    ئۇچۇرىڭىزنى بىزگە ئەۋەتىڭ: