Кечкенә РНК эзлеклелеге-Иллумина
Хезмәтнең өстенлекләре
Ø5 'ахырында беренче база U өчен махсус РНК алу өчен көчле өстенлеккә ия
ØmiRNA максатлы ген фаразлау
ØМәгълүматлар mRNA белән уртак анализ ясау өчен кулланыла
ØmiRNA дифференциаль белдерү
ØmiRNA максатлы ген фаразлау
ØBMKCloud нигезендә нәтиҗәләр китерү: платформада махсуслаштырылган мәгълүмат казу.
ØСатудан соң хезмәтләр проект тәмамланганнан соң 3 ай дәвам итә
Requрнәк таләпләр һәм тапшыру
Requirрнәк таләпләр:
Нуклеотидлар:
| Чисталык | Сафлык | Пычрату | Күләм |
| OD260 / 280≥1.7-2.5 ； OD260 / 230≥0.5-2.5 ； | Plantsсемлекләр өчен: RIN≥6.5;Хайваннар өчен: RIN≥7;28S / 18S≥1.0;чикләнгән яки төп биеклек юк | Гелдә протеин яки ДНК пычрануы чикләнгән яки юк. | Конц.≥300 ng / μl;Том ≥ 10 μл;Барлыгы ≥ 3 μг |
Кисем: Авырлык (коры): ≥1 г.
* 5 мг-дан кечерәк тукымалар өчен без флэш туңдырылган (сыек азотта) тукымалар үрнәген җибәрергә киңәш итәбез.
Күзәнәкне туктату: Күзәнәкләр саны = 3 × 107
* Без туңдырылган күзәнәк лизатын җибәрергә киңәш итәбез.Бу күзәнәк 5 × 10 дан кечерәк саналган очракта5, сыек азотта туңдырылган флэш тәкъдим ителә.
Кан үрнәкләре:
PA × geneBloodRNATube;
6mLTRIzol һәм 2mL кан (TRIzol: Кан = 3: 1)
Тәкъдим ителгән үрнәк китерү
Контейнер:
2 мл центрифуга трубасы (Калай фольгасы тәкъдим ителми)
Labрнәк маркировкасы: Төркем + кабатлау, мәсәлән, A1, A2, A3;В1, В2, В3 ... ...
Җибәрү:
1. Коры боз: plesрнәкләрне капчыкларга тутырырга һәм коры бозга күмергә кирәк.
2.РНА тотрыклы трубалар: РНК үрнәкләрен РНК стабилизация трубасында киптерергә һәм бүлмә температурасында җибәрергә мөмкин.
Хезмәт эше
Эксперимент дизайны
Ampleрнәк китерү
РНК чыгару
Китапханә төзелеше
Эзләү
Мәгълүмат анализы
Сатудан соң хезмәтләр
Биоинформатика
 |
1.miRNA идентификация
MiRDeep2 белән алдан әйтелгән miRNA романнарының һәр кандидатының структурасы һәм эзлеклелеге тирәнлеген күрсәтүче pdf фигурасы бар.
miRNA прекурсор структурасы һәм эзлеклелек тирәнлеге
2.KEGG DE-miRNA Максатлы геннарны баету
Бу сессиядә Биомаркер башта DE-miRNA максатлы геннар белән юлларның артык презентацияләнүен тикшерде.Бәйләү дәрәҗәсе һәм юлның әһәмиятен билгеләүдә баету факторлары һәм балыкчы сынаулары кулланылды.Бәйләү исәпләү тигезләмәсе түбәндә күрсәтелгән.
DE-miRNA максатлы геннарда KEGG юлын баету
3. DE-miRNA Максатлы геннар буенча GO баету анализы
кластерПрофилер DE-miRNA максатлы геннарда GO баету анализында кулланылган.Терминнарның иерархик структурасын күрсәтү өчен баетылган терминнарның юнәлешле аклик графикасы ясалган.Рәсемдә, уклар юнәлеше терминнар арасындагы бәйләнешне күрсәтә, ягъни төеннәр өске төеннәргә караганда конкретрак.DE-miRNA максатлы геннарның юнәлтелгән акилик графигы түбәндәге рәсемдә күрсәтелде.
TopGO DE-miRNA максатлы геннарның аклик графикасына юнәлтелгән
BMK Case
МиРНА һәм итнең сыйфаты белән бәйләнгән геннарның комплекслы анализы Gga-MiR-140-5p тавыкларда күзәнәкләр эчендәге майга тәэсир итүен күрсәтә.
Басылган:Кәрәзле физиология һәм биохимия ，2018
Төп нәтиҗәләр
Соңгы тавык тавыклары балигъ булмаган тавыкларга караганда miRNA-ның түбән глобаль экспрессия дәрәҗәсен күрсәттеләр.
МирНА-мрнаның көйләү челтәре ит сыйфатына тәэсир итә ала
gga-miR-140-5p RXRG көйләү белән адипоцит дифференциациясенә ярдәм итә.
 gga-miR-140-5p RXRG 3'UTR-ны максат итеп тавык инструмускуляр предипоцит дифференциациясенә ярдәм итә. |
Сылтама
Чжан М, Ли Д, Ли Ф, һ.б.МиРНА һәм ит сыйфаты белән бәйләнгән геннарның комплекслы анализы Gga-MiR-140-5p тавыкларда күзәнәкләр эчендәге май чүплегенә йогынты ясавын күрсәтә [J].Кәрәзле физиология һәм биохимия, 2018: 2421-2433.DOI ： 10.1159 / 000489649
