-
Метагеномик эзләү-Нанопор
Метагеномика - экологик үрнәкләрдән алынган катнаш геномик материалларны анализлау өчен кулланылган молекуляр корал, ул төрләрнең күптөрлелеге һәм муллыгы, халык структурасы, филогенетик бәйләнеш, функциональ геннар һәм экологик факторлар белән корреляция челтәре һ.б. турында тулы мәгълүмат бирә. Нанопор эзләү платформалары күптән түгел кертелгән. метагеномик тикшеренүләргә.Уку озынлыгында аның искиткеч эшләнеше метагеномик анализны, аеруча метагеном җыюны көчәйтте.Уку озынлыгының өстенлекләрен кулланып, Нанопорга нигезләнгән метагеномик өйрәнү мылтыклы метагеномика белән чагыштырганда өзлексез җыюга ирешә ала.Нанопорга нигезләнгән метагеномиканың микробиомалардан тулы һәм ябык бактерия геномнарын уңышлы барлыкка китерүе бастырылды (Moss, EL, һ.б.,Табигать биотехникасы, 2020)
Платформа ：Nanopore PromethION P48
-
Бөтен геном бисул эзлеклелеге
Osитосиндагы бишенче урында ДНК метиляциясе ген экспрессиясенә һәм кәрәзле эшчәнлеккә төп йогынты ясый.Аномаль метиляция үрнәкләре рак кебек берничә шарт һәм авырулар белән бәйле.WGBS бер база резолюциясендә геном киң метиляцияне өйрәнү өчен алтын стандартка әйләнде.
Платформа: Illumina NovaSeq6000
-
Transгары үткәрү эзлеклелеге белән транспозаза-хроматин өчен анализ (ATAC-seq)
ATAC-seq - ген экспрессиясен глобаль эпигенетик контрольдә тоту өчен мөһим булган геном киң хроматиның мөмкинлеген анализлау өчен югары үткәргеч эзләү ысулы.Эзләү адаптерлары гиперактив Tn5 транспозазасы белән ачык хроматин өлкәләренә кертелә.PCR көчәйтүдән соң эзлекле китапханә төзелә.Барлык ачык хроматин регионнары транскрипция факторының бәйләүче урыннары белән генә чикләнми, билгеле бер гистон үзгәртелгән өлкә белән билгеле бер вакыт-вакыт шартларында алына ала.
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S һәм 18S rRNAдагы субунит бик сакланган һәм гипер үзгәрүчән төбәкләрне үз эченә алган прокариотик һәм эукариотик организмнарны ачыклау өчен камил молекуляр бармак эзе.Эзләүдән файдаланып, бу ампликоннар сакланган өлешләргә нигезләнеп максатчан булырга мөмкин, һәм гипер-үзгәрүчән төбәкләр микробиаль идентификация өчен тулысынча характерланырга мөмкин, микробиаль төрлелекне анализлау, таксономия, филогения һ.б. ) PacBio платформасының эзлеклелеге тулы озынлыктагы ампликоннарны каплый алырлык югары төгәл озын укулар алырга мөмкинлек бирә (якынча 1,5 Кб).Генетик кырның киңәюе бактерияләрдә яки гөмбәләр җәмгыятендә төрләр аннотациясендә резолюцияне көчәйтте.
Платформа ：PacBio Sequel II
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S / 18S / ITS ампликон эзлеклелеге филогенияне, таксономияне һәм төрләрнең күплеген микробиаль җәмгыятьтә ачыклый, югары продуктлы һәм гипервариаль өлешләрне үз эченә алган генетик маркерларның PCR продуктларын тикшереп.Бу камил молекуляр бармак эзен Woeses et al (1977) кертү изоляциясез микробиом профилен көчәйтә.16S (бактерияләр), 18S (гөмбәләр) һәм эчке транскрипцияләнгән спасер (ITS, гөмбәләр) эзлеклелеге мул төрләрне дә, сирәк һәм билгесез төрләрне дә ачыкларга мөмкинлек бирә.Бу технология киң кулланылган һәм дифференциаль микробиаль составны ачыклау өчен төрле коралга әйләнде, мәсәлән, кеше авызы, эчәклек, зәвык һ.б.
Платформа ：Illumina NovaSeq6000
-
Бактерия һәм гөмбә тулы геномны кабат эзләү
Бактерия һәм гөмбә тулы геномны кабат эзләү - билгеле бактерия һәм гөмбәләрнең геномнарын тулыландыру, шулай ук берничә геномны чагыштыру яки яңа организмнарның геномнарын картина ясау өчен критик корал.Төгәл белешмә геномнар булдыру, микробиаль идентификация һәм башка чагыштырма геном тикшеренүләре ясау өчен, бактерия һәм гөмбәләрнең бөтен геномнарын эзләү бик мөһим.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
PacBio-Тулы озынлыктагы транскриптом (Белешмә булмаган)
Amplicon (16S / 18S / ITS) платформасы микробиаль күптөрлелек проектын анализлау буенча күп еллык тәҗрибәсе белән эшләнгән, анда стандартлаштырылган төп анализ һәм персональ анализ бар: төп анализ хәзерге микробиаль тикшеренүләрнең төп анализ эчтәлеген үз эченә ала, анализ эчтәлеге бай һәм комплекслы, һәм анализ нәтиҗәләре проект докладлары рәвешендә тәкъдим ителә;Персональләштерелгән анализның эчтәлеге төрле.Персональләштерелгән таләпләрне тормышка ашыру өчен, үрнәкләр сайланырга мөмкин, параметрлар төп анализ отчеты һәм тикшеренү максаты буенча сыгылмалы итеп куелырга мөмкин.Windows операцион системасы, гади һәм тиз.
-
PacBio-Тулы озынлыктагы транскриптом (Белешмә булмаган)
Тыныч океан биологиясен (PacBio) изоформ мәгълүматларын кертү рәвешендә алып, бу кушымта тулы озынлыктагы транскрипция эзлеклелеген ачыклый ала (монтажсыз).Белешмә геномга каршы тулы озынлык эзлеклелеген ясап, транскрипцияләр билгеле геннар, транскрипцияләр, кодлаштыру өлкәләре һ.б. белән оптимальләштерелергә мөмкин, бу очракта mRNA структураларын төгәл ачыклау, мәсәлән, альтернатив бүлү һ.б.NGS транскриптом эзлекле мәгълүматлары белән уртак анализ транскрипция дәрәҗәсендә тагын да тулырак аннотация ясарга һәм төгәл санлаштыруга мөмкинлек бирә, бу агымдагы дифференциаль экспрессиягә һәм функциональ анализга зур файда китерә.
-
Бисульфит эзлеклелеген киметү (RRBS)
ДНК метилизациясен тикшерү авыруларны тикшерүдә һәрвакыт кайнар тема булып тора, һәм ген экспрессиясе һәм фено-типик үзенчәлекләр белән тыгыз бәйләнгән.RRBS - ДНК метиляциясен тикшерү өчен төгәл, эффектив һәм экономияле ысул.Промоутер һәм CpG утрау өлкәләрен ферментик ярылу (Msp I) белән баету, Бисульфит эзлеклелеге белән берлектә, югары резолюцияле ДНК метилизациясен ачыклый.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Прокариотик РНК эзлеклелеге
Прокариотик РНК эзләнүләре киләсе буын эзлеклелеген куллана (NGS), кәрәзле транскриптомның үзгәрүен анализлап, билгеле бер мизгелдә РНКның булуын һәм күләмен ачыклау өчен.Безнең компаниянең прокариотик РНК эзләнеше, прокариотларга справкалы геномнар белән тәэмин итә, транскриптом профиле, ген структурасы анализы һ.б. тәэмин итә. Бу төп фән тикшеренүләренә, наркоманияне тикшерүгә һәм башкаларга киң кулланылган.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
