-
Тулы озынлыктагы mRNA эзлеклелеге-Нанопор
РНК эзлеклелеге комплекслы транскриптом анализы өчен кыйммәтле корал булды.Traditionalичшиксез, традицион кыска укылган эзлеклелек монда бик күп мөһим үсешкә иреште.Шуңа да карамастан, ул еш кына тулы озынлыктагы изоформа идентификациясендә, чикләүдә, PCR тигезлегендә чикләүләргә очрый.
Н.Бу тулы озынлыктагы транскрипцияләрне турыдан-туры укырга һәм изоформ дәрәҗәсендәге тикшеренүләрдә проблемаларны чишәргә мөмкинлек бирә.
Платформа：Nanopore PromethION
Китапханә:cDNA-PCR
-
De-novo Тулы озынлыктагы транскрипт эзлеклелеге -PacBio
Яңатулы озынлыктагы транскриптом эзлеклелеге, шулай ук билгелеЯңаIso-Seq уку озынлыгында PacBio секенсерының өстенлекләрен ала, бу тулы озынлыктагы cDNA молекулаларын бернинди тәнәфессез эзләргә мөмкинлек бирә.Бу транскрипция җыю адымнарында барлыкка килгән хаталардан тулысынча саклана һәм изоформ дәрәҗәсендәге резолюция белән уникаль комплектлар төзи.Бу уникаль комплектлар транскриптом дәрәҗәсендә “белешмә геном” буларак көчле генетик мәгълүмат бирә.Моннан тыш, киләсе буын эзләү мәгълүматлары белән берләшеп, бу хезмәт изоформ дәрәҗәсендәге экспрессиянең төгәл күләмен бирә.
Платформа ： PacBio Sequel IIКитапханә: SMRT кыңгырау китапханәсе -
Эукариотик mRNA эзлеклелеге-Иллумина
mRNA эзлеклелеге билгеле шартларда күзәнәкләрдән транскрипцияләнгән барлык mRNA-ны профильләштерергә мөмкинлек бирә.Бу ген экспрессия профилен, ген структураларын һәм кайбер биологик процессларның молекуляр механизмнарын ачу өчен көчле технология.Бүгенге көнгә mRNA эзләнүләре фундаменталь тикшеренүләрдә, клиник диагностикада, наркомания үсешендә һ.б. киң кулланыла.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Белешмә булмаган mRNA эзлеклелеге-Иллумина
mRNA эзлеклелеге киләсе буын эзләү техникасын (NGS) кабул итә, кайбер махсус функцияләр активлашкан билгеле бер вакытта Екарьот хәбәрчесенең RNA (mRNA) формасын алу өчен.Иң озын транскрипция «Unigene» дип аталган һәм алдагы анализ өчен белешмә эзлеклелеге буларак кулланылган, бу төрләрнең молекуляр механизмын һәм көйләү челтәрен сылтамасыз өйрәнүнең эффектив чарасы.
Транскриптомлы мәгълүмат җыюдан һәм функциональ аннотациядән соң
(1) SNP анализы, SSR анализы, CDS фаразлау һәм ген структурасы алдан ясалачак.
(2) ampleәрбер үрнәктә бертөрле булмаган экспрессиянең күләме башкарылачак.
(3) Samрнәкләр (яки төркемнәр) арасында дифференциаль рәвештә күрсәтелгән унигеннар бертөрле булмаган сүзләр нигезендә табылачак
(4) Кластерлау, функциональ аннотация һәм дифференциаль рәвештә күрсәтелгән унигеннарны баету анализы ясалачак
-
Озын кодсыз эзләү - Иллумина
Озын кодсыз РНКлар (lncRNAs) - РНК молекулаларының озынлыгы 200 нттан арткан, алар бик түбән кодлаштыру потенциалы белән характерланалар.LncRNA, кодсыз РНКларның төп әгъзасы буларак, нигездә ядро һәм плазмада очрый.Эзләү технологиясе һәм биоинформатика үсеше күп санлы lncRNA романнарын ачыкларга һәм биологик функцияләр белән бәйләргә мөмкинлек бирә.Аккумулятив дәлилләр шуны күрсәтә: lncRNA эпигенетик көйләүдә, транскрипцияне көйләүдә һәм транскрипциядән соң көйләүдә киң катнаша.
-
Кечкенә РНК эзлеклелеге-Иллумина
Кечкенә РНК кодлаштырылмаган РНК молекулалары классын аңлата, алар озынлыгы 200нттан да азрак, шул исәптән микро РНК (miRNA), кечкенә интерфейс РНК (siRNA), һәм piwi-үзара тәэсир итүче РНК (piRNA).
МикроРНА (miRNA) - эндоген кечкенә РНК классы, озынлыгы 20-24нт, ул күзәнәкләрдә төрле мөһим көйләү ролен башкара.miRNA күп тормыш процессларында катнаша, тукыманы ачыклый - конкрет һәм этап - конкрет белдерү һәм төрле төрләрдә бик сакланган.
-
circRNA эзлеклелеге-Иллумина
Бөтен транскриптом эзлеклелеге барлык төр РНК молекулаларын профильләштерү өчен эшләнгән, шул исәптән кодлаштыру (mRNA) һәм кодсыз РНКлар (шул исәптән lncRNA, circRNA һәм miRNA), билгеле бер күзәнәкләр тарафыннан транскрипцияләнгән.Бөтен транскриптом эзлеклелеге, шулай ук "гомуми РНК эзлеклелеге" дип атала, транскриптом дәрәҗәсендә комплекслы көйләү челтәрләрен ачуны максат итеп куя.NGS технологиясеннән файдаланып, функциональ характеристикага беренче адым бирүче ceRNA анализы һәм уртак РНК анализы өчен бөтен транскриптом продуктларының эзлеклелеге бар.CirRNA-miRNA-mRNA нигезендәге ceRNA көйләү челтәрен ачу.
-
Бөтен транскриптом эзлеклелеге - Иллумина
Бөтен транскриптом эзлеклелеге барлык төр РНК молекулаларын профильләштерү өчен эшләнгән, шул исәптән кодлаштыру (mRNA) һәм кодсыз РНКлар (шул исәптән lncRNA, circRNA һәм miRNA), билгеле бер күзәнәкләр тарафыннан транскрипцияләнгән.Бөтен транскриптом эзлеклелеге, шулай ук "гомуми РНК эзлеклелеге" дип атала, транскриптом дәрәҗәсендә комплекслы көйләү челтәрләрен ачуны максат итеп куя.NGS технологиясеннән файдаланып, функциональ характеристикага беренче адым бирүче ceRNA анализы һәм уртак РНК анализы өчен бөтен транскриптом продуктларының эзлеклелеге бар.CirRNA-miRNA-mRNA нигезендәге ceRNA көйләү челтәрен ачу.
-
Хроматин иммунопрекипитация эзлеклелеге (ChIP-seq)
ChIP-Seq гистон модификациясе, транскрипция факторлары һәм башка ДНК белән бәйле протеиннар өчен ДНК максатларының геном киң профилен тәэмин итә.Бу хроматин иммуно-явым-төшемнең (ChIP) протеин-ДНК комплексларын торгызу өчен, киләсе буын эзләү көче (NGS) белән торгызылган ДНКның югары үткәрү эзлеклелеген берләштерә.Моннан тыш, протеин-ДНК комплекслары тере күзәнәкләрдән торгызылганга, бәйләүче урыннарны төрле күзәнәк төрләрендә һәм тукымаларда яки төрле шартларда чагыштырырга мөмкин.Кушымталар транскрипцияле көйләүдән үсеш юлларына кадәр, авыру механизмнарына кадәр.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Метагеномик эзләү (NGS)
Метагеном - организмнарның катнаш җәмгыятенең гомуми генетик материаллары җыелмасын аңлата, мәсәлән, экологик метагенома, кеше метагеномы һ.б. Анда эшкәртелә торган һәм эшкәртелмәгән микроорганизмнарның геномнары бар.Метагеномик эзлеклелек - экологик үрнәкләрдән алынган катнаш геномик материалларны анализлау өчен кулланылган молекуляр корал, ул төрләрнең күптөрлелеге һәм күплеге, халык структурасы, филогенетик бәйләнеш, функциональ геннар һәм корреляция челтәре турында экологик факторлар белән тулы мәгълүмат бирә.
Платформа ：Illumina NovaSeq6000
