page_head_bg

Яңалыклар

Геном эволюциясе

Геном Де Ново
Ассамблея | Sexенесне билгеләү Бөтен эзлекле эшләр һәм өлешчә биоинформатик хезмәтләр Biomarker Techonologies тарафыннан күрсәтелде.

Аннотация

"Диңгез диңгезләренең иконик фенотибы яфрак сыман кушымчаларны, тешсез торба авызын һәм ашлама йомыркаларын ачык "токымлы пачта" инкубацияләүне үз эченә алган ир-ат йөклелеген үз эченә ала.Без гомуми диңгез диңгезенең ир-ат һәм хатын-кыз геномнарын (Phyllopteryx taeniolatus) һәм аның тыгыз бәйләнешле төрләрен, аллигатор торба балыкларын (Syngnathoides biaculeatus) эзләдек.Эволюцион яңалыктан транскрипция профильләре, яфрак сыман кушымчалар шуны күрсәтә: гадәттә фин үсешендә катнашкан геннар җыелмасы шулай ук ​​потенциаль тукымаларны ремонтлау һәм иммун оборона геннары өчен транскрипцияләрне баету.Scpp5 өчен зебрафиш мутацияләр, барлык сингнатидларда югалган, фарингаль тешләр җитмәгән яки деформацияләнгән, scpp5 югалуы сингнатидларда тешләр югалуга китергән гипотезаны хуплый.Гомуми диңгез агачы һәм аллигатор торба балыклары белән уртак булган ир-атларга хас amhr2y ген кодлауны билгеләүче путатив секс ачыкланды. "

Материаллар һәм методлар:

Материаллар

Fбезнең уртак диңгез агачы (P. taeniolatus) һәм ике аллигатор торба балыклары (S. biaculeatus) үрнәкләр.Ике уртак диңгез диңгезе (бер ир-ат һәм бер хатын-кыз) һәм ике аллигатор торба балыклары (бер ир-ат һәм бер хатын-кыз) тулы геном эзлеклелеге өчен кулланылды, һәм геномны реквизенцияләү өчен тагын ике ир-ат уртак диңгез агачы кулланылды.

Геном эзләү стратегиясе

270/350 б.т.

Транскриптом эзлеклелеге

Fяки гомуми диңгез аждаһасы, баш мие, күз, гилл, бавыр, йөрәк, бөер, концентрация, эчәк, мускул, фин, тире, яфрак сыман кушымчалар, тест һәм аналык йомыркалары җыелган.

Геном де ново җыю стратегиясе

Cану (төзәтү) + WTDBG2 (Ассамблея) + Пилон (Поляк) + Лачез (Hi-C).

Төп нәтиҗәләр

Fig.-1.-Key-features-of-the-common-seadragon-P.-taeniolatus-and-the-alligator-pipefish-S

Гомуми диңгез диңгезенең төп үзенчәлекләре (P. taeniolatus) һәм аллигатор торба балыклары (S. biaculeatus) һәм аларның филогенетик позицияләре.

Fig.-2.-Morphology-and-genetic-makeup-of-the-leaf-like-appendages-in-the-common-seadragon-P

Гомуми диңгез диңгезендәге яфракка охшаган кушымчаларның морфологиясе һәм генетик макияжы (P. taeniolatus).

Fig.-3.-Putative-sex-determination-gene-in-the-common-seadragon-P.-taeniolatus-and-the-alligator-pipefish-S.-biaculeatus

Гомуми диңгез диңгезендә (P. taeniolatus) һәм аллигатор торба балыкында (S. biaculeatus) путатив җенесне билгеләү гены.

Fig.-4

4 нче рәсем.

Сылтама

Qu M, Liu Y, Zhang Y, һ.б.Seadragon геном анализы аның фенотибы һәм җенесне билгеләү урыны турында мәгълүмат бирә.Sci Adv.2021; 7 (34): eabg5196.2021 елның 18 августында бастырылган. Doi: 10.1126 / sciadv.abg5196
Пост вакыты: 08-2022 гыйнвар

Хәбәрегезне безгә җибәрегез:

Эзләү өчен керүне яисә ябу өчен ESC төймәсенә басыгыз