ГЕНОМ ЭВОЛUTIONИЯСЫ, ПАНГЕНОМ
Пан-геном нәрсә ул?
.Ыелган дәлилләр шуны күрсәтә: төрнең төрле төрләре арасында аерма зур булырга мөмкин.Бер геном бер төрнең генетик мәгълүматын тулысынча сурәтләү өчен җитәрлек түгел.Пан-геномны өйрәнүнең максаты - төрләрнең тулырак геномик графигын алу һәм вариацияләрне тирәнрәк һәм киңрәк казырга мөмкинлек бирүче күп санлы штаммнарның геном де-ново җыелышын үткәреп, төрләр һәм генетик кодлар арасындагы бәйләнешне декодлау.
Пан-геномны өйрәнү тенденцияләре
Рәсем 1 Пан-геномның бастырылган тикшеренү эшләренең тенденцияләре.
Искәрмә: Рәсемдә "пан-геном" алу нәтиҗәсе күрсәтелә, табигать, күзәнәк һәм фән серияләре журналларында басылган мәкаләләрнең исемнәрен эзләү өчен төп сүз.
а.Берничә үрнәкләрдән укулар белешмәлеккә тигезләнгән һәм берләштерелмәгәннәр роман контигларына җыелган.Бу роман контигларын оригиналь белешмә эзлеклелегенә өстәп, пангеном белешмәсе төзелергә мөмкин.Тапшырыла торган регионнар барлык укуларны пангеномага күчерү нигезендә билгеләнәләр.
б.Күп санлы геномнарның де-ново җыелмасы бөтен геномны тигезләү ысулларын таратыла торган геном өлкәләрен ачыкларга мөмкинлек бирә.
в.Пан-геном графигы бөтен геном тигезләүләреннән яки де-ново график җыю ярдәмендә төзелергә мөмкин, бу диспансер өлкәләренең вариант мәгълүматларын график аша уникаль юл итеп саклый.
Пан-геномны ничек төзергә?
Рәсем 2 Пан-геном карашларын чагыштыру1
а.Берничә үрнәкләрдән укулар белешмәлеккә тигезләнгән һәм берләштерелмәгәннәр роман контигларына җыелган.Бу роман контигларын оригиналь белешмә эзлеклелегенә өстәп, пангеном белешмәсе төзелергә мөмкин.Тапшырыла торган регионнар барлык укуларны пангеномага күчерү нигезендә билгеләнәләр.
б.Күп санлы геномнарның де-ново җыелмасы бөтен геномны тигезләү ысулларын таратыла торган геном өлкәләрен ачыкларга мөмкинлек бирә.
в.Пан-геном графигы бөтен геном тигезләүләреннән яки де-ново график җыю ярдәмендә төзелергә мөмкин, бу диспансер өлкәләренең вариант мәгълүматларын график аша уникаль юл итеп саклый.
Күптән түгел бастырылган пан-геномнар
Pan Пан-геномнарны көчләү2
● Помидор пан-геномнары 3
● Райс пан4
● Көнбагыш Пан-геном5
● Соя пан-геномы 6
● Райс пан-геном7
● Арпа пан-геномы8
● Бодай пан-геномы9
● Сорга Пан-геномы10
● Фитопланктон Пан-геном11
Сылтама
1. Bayer PE, Golicz AA, Scheben A, Batley J, Edwards D. antсемлек пан-геномнары яңа сылтама.Нат үсемлекләр.2020; 6 (8): 914-920.doi: 10.1038 / s41477-020-0733-0
2. JM җыры, Гуан З, Ху Дж, һ.б.Сигез югары сыйфатлы геном пан-геном архитектурасын һәм Брассика напусының экотип дифференциациясен күрсәтә.Нат үсемлекләр.2020; 6 (1): 34-45.doi: 10.1038 / s41477-019-0577-7
3. Гао Л, Гонда I, Кояш Н һ.б.Помидор пан-геномы яңа геннарны һәм җимеш тәмен көйләүче сирәк аллеяны ачып бирә.Нат Генет.2019; 51 (6): 1044-1051.doi: 10.1038 / s41588-019-0410-2
4. Чжао С, Фэнг Q, Лу Н һ.б.Пан-геном анализы эшкәртелгән һәм кыргый дөгедә геномик үзгәрешнең күләмен күрсәтә [бастырылган коррекция Нат Генетта күренә.2018 Авг; 50 (8): 1196].Нат Генет.2018; 50 (2): 278-284.doi: 10.1038 / s41588-018-0041-z
5. Хюбнер С, Беркович Н, Тодеско М һ.б.Көнбагыш пан-геном анализы шуны күрсәтә: гибридизация ген эчтәлеген һәм авыруларга каршы торуны үзгәртте.Нат үсемлекләр.2019; 5 (1): 54-62.doi: 10.1038 / s41477-018-0329-0
6. Лю Й, Дю Н, Ли П һ.б.Кыргый һәм эшкәртелгән сояның пан-геномы.Күзәнәк.2020; 182 (1): 162-176.e13.doi: 10.1016 / j.cell.2020.05.023
7. inинь П, Лу Н, Дю Н һ.б.33 генетик төрле дөге кушылмаларына пан-геном анализы яшерен геномик үзгәрешләрне ачыклый [2021 елның 25 маенда онлайн режимда бастырылган].Күзәнәк.2021; S0092-8674 (21) 00581-X.doi: 10.1016 / j.cell.2021.04.046
8. Джаякоди М, Падмарасу С, Хаберер Г, һ.б.Арпа пан-геномы мутация үрчетүнең яшерен мирасын ачып бирә.Табигать.2020; 588 (7837): 284-289.doi: 10.1038 / s41586-020-2947-8
9. Walkowiak S, Gao L, Monat C һ.б.Берничә бодай геномы хәзерге үрчетүдә глобаль үзгәрүне күрсәтә.Табигать.2020; 588 (7837): 277-283.doi: 10.1038 / s41586-020-2961-x
10. Тао Й, Луо Н, Сю Дж, һ.б.Чәчелгән һәм кыргый сорга пан-геномы эчендә киң үзгәрү [2021 елның 20 маенда онлайн режимда бастырылган].Нат үсемлекләр.2021; 10.1038 / s41477-021-00925-x.doi: 10.1038 / s41477-021-00925-x
11. Фан X, iиу Х, Хан В һ.б.Фитопланктон пангеномасы төрле функцияләрнең прокариотик горизонталь ген тапшыруын күрсәтә.Sci Adv.2020; 6 (18): eaba0111.2020-нче елның 29 апрелендә бастырылды. Doi: 10.1126 / sciadv.aba0111
Пост вакыты: 04-2022 гыйнвар