Яңалыклар

Күчерелә торган элемент (TE) көчәйтү геном зурлыгын киңәйтү һәм эволюция арадаш итүче этәргеч көче булып танылды, ләкин 3D геном архитектурасын формалаштыру нәтиҗәләре үсемлекләрдә билгеле түгел.Монда без геномның өч катлы мамыкның өч төре өчен белешмә-класслы геном җыелышлары турында хәбәр итәбезGossypium rotundifolium(К2),Г. арборум(А2), һәмГ. Раймондии(D5), Оксфорд Нанопор Технологияләрен кулланып.Чагыштырма геном анализлары зур геном зурлыгына (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) өлеш кертә торган нәселгә хас TE көчәйтү детальләрен документлаштыралар, һәм геномнар арасында чагыштырмача сакланган ген эчтәлеген һәм синтения мөнәсәбәтләрен күрсәтәләр.Синтеник геннарның якынча 17% актив ("А") һәм актив булмаган ("В") бүлмәләре арасында хроматин статус үзгәрүен күрсәтә, һәм TE көчәйтү ген өлкәләрендәге бүлекнең өлеше арту белән бәйле (~ 7000 ген) ) K2 һәм A2 D5 белән чагыштырганда.Өч геном арасында топологик бәйләнешле домен (TAD) чикләренең 42% гына сакланган.Безнең мәгълүматлар нәсел-специфик TAD чикләрен формалаштырганнан соң TE-ның соңгы көчәйтүен күрсәтәләр.Бу тикшеренү транспосон-арадашлы геном киңәюенең үсемлекләрдә югары тәртипле хроматин структурасы эволюциясендә ролен яктырта.