Геном
Хромосома масштаблы җыю һәм биомассалы культураны анализлау Miscanthus lutarioriparius геномы
Нанопор эзлеклелеге |Иллумина |Сәлам-С |РНК-эзләү |Филогения
Бу тикшеренүдә, Biomarker Technologies Nanopore эзлеклелеге, де-ново геном җыю, Hi-C ярдәмендә җыю һ.б. техник ярдәм күрсәтте.
Аннотация
Мискантус, ризоматоз күпьеллык үсемлек, биомэнергия җитештерү өчен зур биомассасы һәм стресска чыдамлыгы өчен зур потенциалга ия.Без хромосома масштаблы җыю турында хәбәр итәбезMiscanthus lutarioripariusОксфорд Нанопор эзлеклелеге һәм Hi-C технологияләрен берләштереп геном.2.07-Gb җыю геномның 96,64% тәшкил итә, N50 контигы 1,71 Мб.Centентромер һәм теломер эзлеклелеге барлык 19 хромосома һәм 10 хромосома өчен җыелган.M. lutarioriparius-ның аллотетраплоид чыгышы центромерик спутник кабатлаулары ярдәмендә расланган.Тетраплоид геном структурасы һәм сорга караганда берничә хромосомаль үзгәрешләр ачык күрсәтелгән.Тандемның кабатланган геннарыM. lutarioripariusстресска җавап белән генә түгел, ә күзәнәк стенасы биосинтезы белән функциональ яктан баетылган.Авыруларга каршы тору, күзәнәк стенасы биосинтезы һәм металл ион транспорты белән бәйле ген гаиләләре зурайган һәм үсеш алган.Бу гаиләләрнең киңәюе искиткеч сыйфатларны арттыру өчен мөһим геномик нигез булырга мөмкинM. lutarioriparius.
Геном җыюның төп статистикасы
Рәсем.M. lutarioriparius геном җыю турында гомуми күзәтү
Яңалыклар һәм моментлар Biomarker Technologies белән соңгы уңышлы очракларны уртаклашу, яңа фәнни казанышлар, өйрәнү вакытында кулланылган күренекле техника.
Пост вакыты: гыйнвар-05-2022