Genгары үткәргеч генотиплау, аеруча зур масштаблы халыкта, генетик ассоциацияне өйрәнүдә төп адым булып тора, ул функциональ ген ачу, эволюцион анализ һ.б. өчен генетик нигез бирә, тирән геномны кабат эзләү урынына, геном эзлеклелеген киметте (RRGS) ) бер үрнәккә эзлекле бәяне киметү өчен кертелә, шул ук вакытта генетик маркер ачуда акыллы эффективлык саклый.Бу гадәттә чикләнгән фрагментны бирелгән зурлык диапазонында чыгару белән ирешелә, ул кыскартылган китапханә (RRL) дип атала.Конкрет-локус көчәйтелгән фрагмент эзлеклелеге (SLAF-Seq) - яңа SNP ачу һәм зур халыкның SNP генотипы өчен үз-үзен эшләгән стратегия.
Техник эш процессы
SLAF vs булган RRL ысуллары
SLAF өстенлекләре
Genгары генетик маркер ачу эффективлыгы- -гары үткәргеч эзләү технологиясе белән берлектә, SLAF-Seq төрле геном эчендә ачылган йөзләгән мең тэгларга ирешә ала, төрле тикшеренү проектлары соравын үтәү өчен, яки геном белән.
Custзенчәлекле һәм сыгылмалы эксперименталь дизайн- Төрле тикшеренү максаты яки төрләре өчен бер фермент, икеле-ферментлы һәм күп ферментлы ашказаны кертеп, төрле энзиматик ашкайнату стратегиясе бар.Ашкайнату стратегиясе оптималь фермент дизайнын ышандыру өчен силикода алдан бәяләнәчәк.
Энзиматик ашкайнатуда югары эффективлык- Алдан эшләнгән энзиматик ашкайнату хромосомада тигез бүленгән SLAFларны тәэмин итә.Фрагмент җыю эффективлыгы 95% тан артык.
Кабатлау эзлеклелегеннән сакланыгыз- SLAF-Seq мәгълүматларында кабатлау эзлеклелеге проценты 5% тан түбәнгә кадәр киметелә, аеруча бодай, кукуруз һ.б. кебек кабатлау элементлары булган төрләрдә.
Selfз-үзеңне үстергән биоинформатик эш процессы- BMK интеграль биоинформатик эш процессын эшләде, соңгы чыгарылышның ышанычлылыгын һәм төгәллеген тәэмин итү өчен SLAF-Seq технологиясенә кагыла.
SLAF куллану
Генетик бәйләнеш картасы
Highгары тыгызлыктагы генетик карта төзелеше һәм Хризантемдагы чәчәк тибындагы сыйфатларны контрольдә тотучы локияне ачыклау (Chrysanthemum x morifolium Ramat.)
Журнал: Бакчачылыкны тикшерү Басылган: 2020.7
GWAS
Геном киң ассоциация һәм бәйләнеш картасын кулланып соя орлыкларында изофавон эчтәлеге белән бәйләнгән кандидат генын ачыклау.
Журнал: Завод журналы бастырылган: 2020.08
Эволюцион генетика
Халыкның геном анализы һәм ново җыю чүп үләненең эволюцион уен буларак килеп чыгышын ачыклый
Журнал: Молекуляр үсемлек бастырылган: 2019.5
Күпчелек сегрегант анализы (BSA)
Сульфотрансферазны кодлаган GmST1, соя мозаикасы вирусы G2 һәм G3 штаммнарына каршы тора.
Журнал: antсемлек, күзәнәк һәм әйләнә-тирә басма: 2021.04
Сылтама
Кояш X, Лю Д, Чжан X һ.б.SLAF-Seq: зур масштаблы SNP ачу һәм генотип ясауның эффектив ысулы [J].Беренче участок, 2013, 8 (3): e58700
Xыр X, Сю Й, Гао К һ.б.Highгары тыгызлыктагы генетик карта төзелеше һәм Хризантемдагы чәчәк тибындагы сыйфатларны контрольдә тотучы локияне ачыклау (Хризантем × морифолий Рамат.).Hortic Res.2020; 7: 108.
Ву Д, Ли Д, Чжао X һ.б.Геном киң ассоциация һәм бәйләнеш картасын кулланып соя орлыкларында изофлавон эчтәлеге белән бәйләнгән кандидат генын ачыклау.Завод J. 2020;104 (4): 950-963.
Кояш J, Ma D, Tang L, һ.б.Халыкның геном анализы һәм Де Ново Ассамблеясе чүп үләненең килеп чыгышын эволюцион уен итеп күрсәтәләр.Мол заводы.2019; 12 (5): 632-647.Мол заводы.2018;11 (11): 1360-1376.
Чжао X, ingзинь Й, Луо З һ.б.Сульфотрансфераны кодлаган GmST1, соя мозаикасы вирусы G2 һәм G3 штаммнарына каршы тора.Cellсемлек күзәнәкләре мохите.2021; 10.1111 / pce.14066
Пост вакыты: 04-2022 гыйнвар