-
Genсемлек / Хайваннар Де Ново Геном эзлеклелеге
Яңаэзләү - технологияләр ярдәмендә төрнең бөтен геномын төзүне аңлата, мәсәлән, PacBio, Nanopore, NGS һ.б., белешмә геном булмаганда.Өченче буын эзләү технологияләренең уку озынлыгының искиткеч камилләшүе катлаулы геномнарны җыюда яңа мөмкинлекләр китерде, мәсәлән, югары гетерозигозияле, кабатланучы төбәкләрнең зур өлеше, полиплоидлар һ.б. кабатланучы элементларны, аномаль GC эчтәлеге булган төбәкләрне һәм башка бик катлаулы төбәкләрне чишү.
Платформа ： PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Сәлам-С нигезендә Геном Ассамблеясы
Hi-C - якынлыкка нигезләнгән үзара бәйләнешне һәм югары үткәргеч эзлеклелеген берләштереп хромосома конфигурациясен алу өчен эшләнгән ысул.Бу үзара бәйләнешнең интенсивлыгы хромосомалардагы физик дистанция белән тискәре бәйләнештә дип санала.Шуңа күрә, Hi-C мәгълүматлары кластерларга, заказларга һәм җыелган эзлеклелектә геном проектында юнәлеш бирергә һәм билгеле сандагы хромосомаларга якорь ясарга мөмкин.Бу технология халыкка нигезләнгән генетик карта булмаганда хромосома дәрәҗәсендәге геном җыюны көчәйтә.Everyәрбер геномга Hi-C кирәк.
Платформа ： Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Эволюцион генетика
Эволюцион генетика - SNPs, InDels, SVs һәм CNVларны кертеп, генетик вариацияләр нигезендә бирелгән материалларның эволюцион мәгълүматы турында тулы аңлатма бирү өчен эшләнгән пакетлы эзлекле хезмәт.Ул популяциянең эволюцион үзгәрешләрен һәм генетик үзенчәлекләрен тасвирлау өчен кирәк булган барлык төп анализларны бирә, мәсәлән, халык структурасы, генетик төрлелек, филогения мөнәсәбәтләре һ.б.
-
Чагыштырма геномика
Чагыштырма геномика туры мәгънәдә төрле геном эзлеклелеген һәм төрле төрләрнең структураларын чагыштыруны аңлата.Бу дисциплинаның максаты - төрләрнең эволюциясен, ген функциясен, геннар дәрәҗәсендә ген көйләү механизмын ачыклау, төрле төрләр буенча сакланган яки дифференциацияләнгән эзлеклелек структураларын ачыклау.Типик чагыштырма геномиканы өйрәнү геннар гаиләсендә анализлар, эволюцион үсеш, бөтен геномны кабатлау, сайлап алу басымы һ.б.
-
Күпчелек сегрегант анализ
Күпчелек сегрегант анализы (BSA) - фенотип белән бәйле генетик маркерларны тиз ачыклау өчен кулланылган техника.BSA-ның төп эш процессы бик каршылыклы фенотиплар булган ике төркемне сайлап алу, барлык кешеләрнең ДНКларын туплау, ике күп ДНК формалаштыру, ике бассейн арасында дифференциаль эзлеклелекне ачыклау.Бу ысул үсемлек / хайван геномнарындагы максатчан геннар белән нык бәйләнгән генетик маркерларны ачыклауда киң кулланылган.
