Эукариотик mRNA эзлеклелеге-Иллумина
Уңай яклары
ØExperienceгары тәҗрибәле: БМКда 200 000 нән артык үрнәк эшкәртелде, төрле үрнәк төрләрен, шул исәптән күзәнәк культурасы, тукымалар, тән сыеклыгы һ.б. һәм 7000 дән артык mRNA-Seq проектлары төрле тикшеренү өлкәләрен үз эченә ала.
ØСыйфатны катгый контрольдә тоту системасы: югары сыйфатлы нәтиҗәләр бирү өчен үрнәк әзерләү, китапханә әзерләү, эзләү һәм биоинформатика кебек барлык адымнар аша төп сыйфат контроль пунктлары тыгыз контрольдә.
ØТөрле тикшеренү максатларын тормышка ашыру өчен функцияне аннотацияләү һәм баету өчен берничә мәгълүмат базасы бар.
ØСатудан соң хезмәтләр: Сатудан соң хезмәтләр проект тәмамланганнан соң 3 ай дәвамында гамәлдә, шул исәптән проектларны күзәтү, проблемалар төшерү, Сораулар нәтиҗәләре һ.б.
Requрнәк таләпләр һәм тапшыру
| Китапханә | Эзләү стратегиясе | Мәгълүмат тәкъдим ителә | Сыйфат белән идарә итү |
| Поли А баетылган | Illumina PE150 | 6 Гб | Q30≥85% |
Requirрнәк таләпләр:
Нуклеотидлар:
| Чисталык | Сафлык | Күләм |
| OD260 / 280≥1.7-2.5 OD260 / 230≥0.5-2.5Гелдә протеин яки ДНК пычрануы чикләнгән яки юк. | Plantsсемлекләр өчен: RIN≥6.5; Хайваннар өчен: RIN≥7; 28S / 18S≥1.0; чикләнгән яки төп биеклек юк; | Конц.≥30 ng / μl;Том ≥ 10 μл;Барлыгы ≥ 1,5 μг |
Кисем: Авырлык (коры):≥1 г.
* 5 мг-дан кечерәк тукымалар өчен без флэш туңдырылган (сыек азотта) тукымалар үрнәген җибәрергә киңәш итәбез.
Күзәнәкне туктату:Күзәнәкләр саны = 3 × 106- 1 × 107
* Без туңдырылган күзәнәк лизатын җибәрергә киңәш итәбез.Күзәнәк 5 × 105тән кечерәк саналган очракта, сыек азотта туңдырылган флеш тәкъдим ителә, бу микро чыгару өчен өстен.
Кан үрнәкләре:Том күләме 1 мл
Микроорганизм:Масса ≥ 1 г.
Тәкъдим ителгән үрнәк китерү
Контейнер: 2 мл центрифуга трубасы (Калай фольгасы тәкъдим ителми)
Labрнәк маркировкасы: Төркем + кабатлау, мәсәлән, A1, A2, A3;В1, В2, В3 ... ...
Җибәрү:
- Коры боз: plesрнәкләрне капчыкларга тутырырга һәм коры бозга күмергә кирәк.
- РНК тотрыклы трубалар: РНК үрнәкләре РНКны тотрыклыландыру трубасында киптерелергә мөмкин (мәсәлән, RNAstable®) һәм бүлмә температурасында җибәрелергә мөмкин.
Хезмәт эше
Эксперимент дизайны
Ampleрнәк китерү
РНК чыгару
Китапханә төзелеше
Эзләү
Мәгълүмат анализы
Сатудан соң хезмәтләр
Биоинформатика
Эукариотик mRNA эзләү анализы
Биоинформатика
ØЧимал мәгълүматларының сыйфатын контрольдә тоту
ØГеном тигезләнеше
ØТранскрипция структурасы анализы
ØЭкспрессия күләме
ØДифференциаль белдерү анализы
ØФункция аннотациясе һәм баету
1.mRNA Мәгълүмат туендыру сызыгы
2.Дифференциаль экспресс-анализ Вулкан сюжеты
3.DEG'ларда KEGG аннотациясе
4.DEG'ларда классификациягә бар
