-
Tam uzunlukta mRNA dizilimi-Nanopore
RNA dizilimi, kapsamlı transkriptome analizi için paha biçilmez bir araç olmuştur.Kuşkusuz, geleneksel kısa okuma dizilimi burada sayısız önemli gelişme sağladı.Bununla birlikte, genellikle tam uzunluktaki izoform tanımlamalarında, nicelemede, PCR yanlılığında sınırlamalarla karşılaşır.
Nanopor dizileme, nükleotidlerin doğrudan DNA sentezi olmadan okunması ve onlarca kilobazda uzun okuma üretmesi bakımından kendisini diğer dizileme platformlarından ayırır.Bu, tam uzunluktaki transkriptlerin doğrudan okunmasını ve izoform düzeyindeki çalışmalarda zorlukların üstesinden gelinmesini sağlar.
platformu：Nanopor PrometİYON
Kütüphane:cDNA-PCR
-
De novo Tam uzunlukta Transkriptome dizilimi -PacBio
De novoolarak da bilinen tam uzunlukta transkriptome dizilimiDe novoIso-Seq, tam uzunluktaki cDNA moleküllerinin herhangi bir kesinti olmadan dizilenmesini sağlayan okuma uzunluğunda PacBio sıralayıcının avantajlarını kullanır.Bu, transkript derleme adımlarında oluşturulan hataları tamamen önler ve izoform düzeyinde çözünürlükle unigene kümeleri oluşturur.Bu unigene kümeleri, transkriptome düzeyinde "referans genom" olarak güçlü genetik bilgi sağlar.Ek olarak, yeni nesil sıralama verileriyle birleşerek bu hizmet, izoform düzeyinde ifadenin doğru bir şekilde ölçülmesini sağlar.
Platform: PacBio Devam IIKitaplık: SMRT zil kitaplığı -
Ökaryotik mRNA dizileme-Illumina
mRNA dizilimi, belirli koşullar altında hücrelerden kopyalanan tüm mRNA'ların profilinin çıkarılmasını sağlar.Bazı biyolojik süreçlerin gen ekspresyon profilini, gen yapılarını ve moleküler mekanizmalarını ortaya çıkarmak için güçlü bir teknolojidir.Bugüne kadar, mRNA dizilimi temel araştırma, klinik teşhis, ilaç geliştirme vb. alanlarda yaygın olarak kullanılmıştır.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Referans tabanlı olmayan mRNA dizilimi-Illumina
mRNA dizileme, haberci RNA'yı (mRNA) ökaryottan bazı özel işlevlerin aktive ettiği belirli bir dönemde yakalamak için yeni nesil dizileme tekniğini (NGS) benimser.Birleştirilen en uzun transkript, 'Unigene' olarak adlandırıldı ve sonraki analizler için referans sekans olarak kullanıldı; bu, türlerin moleküler mekanizmasını ve düzenleyici ağını referans olmaksızın incelemek için etkili bir araçtır.
Transkriptome veri montajından ve unigene fonksiyonel açıklamalarından sonra
(1)SNP analizi, SSR analizi, CDS tahmini ve gen yapısı önceden oluşturulacaktır.
(2) Her numunede unigene ekspresyonunun miktar tayini yapılacaktır.
(3) Numuneler (veya gruplar) arasında farklı şekilde ifade edilen unigenler, unigene ifadesine dayalı olarak keşfedilecektir.
(4) Diferansiyel olarak ifade edilen unigenlerin kümeleme, işlevsel açıklama ve zenginleştirme analizi yapılacaktır.
-
Uzun kodlamayan dizileme-Illumina
Uzun kodlamayan RNA'lar (lncRNA'lar), son derece düşük kodlama potansiyeli ile karakterize edilen, uzunluğu 200 nt'yi geçen bir RNA molekülü türüdür.Kodlamayan RNA'larda anahtar üye olarak LncRNA, esas olarak çekirdek ve plazmada bulunur.Sıralama teknolojisindeki ve biyoinformtikteki gelişme, çok sayıda yeni lncRNA'nın tanımlanmasını ve bunları biyolojik işlevlerle ilişkilendirmesini sağlar.Biriken kanıtlar, lncRNA'nın epigenetik düzenleme, transkripsiyon düzenlemesi ve transkripsiyon sonrası düzenlemede yaygın olarak yer aldığını göstermektedir.
-
Küçük RNA dizilimi-Illumina
Küçük RNA, mikro RNA (miRNA), küçük enterferans RNA (siRNA) ve piwi etkileşimli RNA (piRNA) dahil olmak üzere genellikle 200nt'den daha kısa olan kodlamayan RNA molekülleri sınıfını ifade eder.
MikroRNA (miRNA), hücrelerde çeşitli önemli düzenleyici roller oynayan, yaklaşık 20-24nt uzunluğunda bir endojen küçük RNA sınıfıdır.miRNA, dokuya özgü ve evreye özgü ifadeyi ortaya çıkaran birçok yaşam sürecinde yer alır ve farklı türlerde yüksek oranda korunur.
-
circRNA dizileme-Illumina
Tüm transkriptom dizilimi, belirli bir zamanda belirli hücreler tarafından kopyalanan kodlayıcı (mRNA) ve kodlayıcı olmayan RNA'lar (lncRNA, circRNA ve miRNA dahil) dahil olmak üzere her tür RNA molekülünün profilini çıkarmak için tasarlanmıştır."Toplam RNA dizilimi" olarak da bilinen tüm transkriptom dizilimi, transkriptome düzeyinde kapsamlı düzenleyici ağları ortaya çıkarmayı amaçlar.NGS teknolojisinden yararlanarak, fonksiyonel karakterizasyona yönelik ilk adımı sağlayan ceRNA analizi ve ortak RNA analizi için tüm transkriptom ürünlerinin dizileri mevcuttur.circRNA-miRNA-mRNA tabanlı ceRNA'nın düzenleyici ağını ortaya çıkarmak.
-
Tüm transkriptome dizilimi – Illumina
Tüm transkriptom dizilimi, belirli bir zamanda belirli hücreler tarafından kopyalanan kodlayıcı (mRNA) ve kodlayıcı olmayan RNA'lar (lncRNA, circRNA ve miRNA dahil) dahil olmak üzere her tür RNA molekülünün profilini çıkarmak için tasarlanmıştır."Toplam RNA dizilimi" olarak da bilinen tüm transkriptom dizilimi, transkriptome düzeyinde kapsamlı düzenleyici ağları ortaya çıkarmayı amaçlar.NGS teknolojisinden yararlanarak, fonksiyonel karakterizasyona yönelik ilk adımı sağlayan ceRNA analizi ve ortak RNA analizi için tüm transkriptom ürünlerinin dizileri mevcuttur.circRNA-miRNA-mRNA tabanlı ceRNA'nın düzenleyici ağını ortaya çıkarmak.
-
Prokaryotik RNA dizilimi
Prokaryotik RNA dizilimi, değişen hücresel transkriptomları analiz ederek belirli bir anda RNA'nın varlığını ve miktarını ortaya çıkarmak için yeni nesil dizilemeyi (NGS) kullanır.Şirketimizin prokaryotik RNA dizilimi, özellikle referans genomlu prokaryotları hedefler, size transkriptome profil oluşturma, gen yapısı analizi vb. sağlar. Temel bilim araştırmaları, ilaç araştırma ve geliştirme ve daha pek çok alanda yaygın olarak uygulanmıştır.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranskriptom Sıralaması
Metatranskriptome dizilimi, mikropların (hem ökaryotlar hem de prokaryotlar) doğal ortamlarda (yani toprak, su, deniz, dışkı ve bağırsak) gen ekspresyonunu belirler. Özellikle, bu hizmetler, karmaşık mikrobiyal toplulukların tüm gen ekspresyon profilini, taksonomik analizleri elde etmenizi sağlar. türler, farklı şekilde ifade edilen genlerin fonksiyonel zenginleştirme analizi ve daha fazlası.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
