Isı haritası çekmecesi, matris verilerini filtreleyebilen, normalleştirebilen ve kümeleyebilen ısı haritası çizimi için kullanılır. Çoğunlukla farklı örnekler arasındaki gen ekspresyon seviyesinin küme analizi için kullanılır.
NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam dahil olmak üzere dizileri veritabanına hizalayarak FASTA dosyasındaki dizilere biyolojik fonksiyonların eklenmesi.
BLAST (Temel Yerel Hizalama Arama Aracı), benzer biyolojik dizilere sahip bölgeleri bulmaya yönelik bir algoritma ve programdır.Bu dizileri dizi veritabanlarıyla karşılaştırır ve istatistiksel önemi hesaplar.BLAST, dizi türüne bağlı olarak dört tür araçtan oluşur: blastn, lastp, blastx ve tblastn.