Azaltılmış Temsil Bisülfit Sıralaması (RRBS)
Hizmet Özellikleri
Platform: NovaSeq platformu, PE150
Kütüphane tipi: 200-400bp insert bisülfitle işlenmiş DNA kütüphanesi
Sıralama stratejisi: Eşleştirilmiş Uç 150 bp
Önerilen veri çıkışı: 10 Gb ham veri/örnek
Örnek Gereksinimler
DNA miktarı: ≥ 2ug
DNA konsantrasyonu:≥ 20ng/μl.
Saflık: OD260/280 = 1,8 ila 2,0, bozulma veya RNA kontaminasyonu olmadan
Biyoinformatik analiz
Hizmet İş Akışı
Numune teslimatı
Kütüphane inşaatı
Sıralama
Veri analizi
Satış sonrası hizmetler
a.Referans genom hizalama istatistikleri
Haritalama okumalarının istatistikleri
SC bölgesinin sıralama derinliği ve kapsamının istatistikleri
Abirikmiş kapsam
Dher numunenin sindirim verimliliği
b.Metilasyon bölgesi tespiti
C bölgesindeki metilasyon seviyelerinin listesi
BS dönüşümü
Metillenmiş sitozin
Metilasyon seviyesi dağılımı
c.Metilasyon haritası
Genom çapında
Genom elemanı
d.Numuneler arasındaki metilasyon seviyelerinin karşılaştırılması
PCG metilasyonunun hava yoluyla korelasyonu
PCA-CG metilasyonu
CCG metilasyonunun parlatılması
d.Diferansiyel metilasyon analizi
SDMR istatistikleri
DMR uzunluk dağılımı
Hharita yemek
DHedeflenen bölgedeki MR dağılımı
