-
BSA
Toplu Segregant Analizi platformu, tek adımlı standart analiz ve özelleştirilmiş parametre ayarıyla gelişmiş analizden oluşur.BSA, fenotiple ilişkili genetik belirteçleri hızlı bir şekilde tanımlamak için kullanılan bir tekniktir.BSA'nın ana iş akışı şunları içerir: 1. son derece zıt fenotiplere sahip iki grup bireyin seçilmesi;2. iki DNA yığını oluşturmak için tüm bireylerin DNA, RNA veya SLAF-seq'inin (Biomarker tarafından geliştirilmiştir) havuzda toplanması;3. referans genoma karşı veya aradaki diferansiyel dizilerin tanımlanması; 4. aday bağlı bölgelerin ED ve SNP indeks algoritması ile tahmin edilmesi;5. Aday bölgelerdeki genlerin fonksiyonel analizi ve zenginleştirilmesi vb. Genetik işaretleyici taraması ve primer tasarımı dahil olmak üzere verilerde daha gelişmiş madencilik de mevcuttur.
-
Amplikon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) platformu, standartlaştırılmış temel analiz ve kişiselleştirilmiş analiz içeren mikrobiyal çeşitlilik proje analizinde uzun yıllara dayanan deneyimle geliştirilmiştir: temel analiz, mevcut mikrobiyal araştırmaların ana akım analiz içeriğini kapsar, analiz içeriği zengin ve kapsamlıdır, ve analiz sonuçları proje raporları halinde sunulur;Kişiselleştirilmiş analizin içeriği çeşitlidir.Kişiselleştirilmiş gereksinimleri gerçekleştirmek için numuneler seçilebilir ve parametreler temel analiz raporuna ve araştırma amacına göre esnek bir şekilde ayarlanabilir.Windows işletim sistemi, basit ve hızlı.
-
Evrimsel Genetik
Evrimsel genetik, SNP'ler, InDels, SV'ler ve CNV'ler dahil olmak üzere genetik varyasyonlara dayalı olarak verilen materyallerin evrimsel bilgilerine ilişkin kapsamlı bir yorum sağlamak için tasarlanmış paketlenmiş bir sıralama hizmetidir.Popülasyon yapısı, genetik çeşitlilik, filogeni ilişkileri vb. gibi popülasyonların evrimsel değişimlerini ve genetik özelliklerini tanımlamak için gereken tüm temel analizleri sağlar. Ayrıca, etkili popülasyon büyüklüğü ve ayrışma süresinin tahminini güçlendiren gen akışına ilişkin çalışmaları da içerir.
-
Karşılaştırmalı Genomik
Karşılaştırmalı genomik, kelimenin tam anlamıyla, farklı türlerin tüm genom dizilerinin ve yapılarının karşılaştırılması anlamına gelir.Bu disiplin, farklı türler arasında korunan veya farklılaşan dizi yapılarını ve elemanlarını belirleyerek türün evrimini, gen fonksiyonunu, gen düzenleme mekanizmasını genom düzeyinde ortaya çıkarmayı amaçlamaktadır.Tipik karşılaştırmalı genomik çalışması, gen ailesi, evrimsel gelişim, tüm genom kopyalanması, seçici baskı vb. konulardaki analizleri içerir.
-
Evrimsel Genetik
Nüfus ve evrimsel genetik analiz platformu, BMK Ar-Ge ekibinin yıllardır biriktirdiği muazzam deneyime dayanarak kurulmuştur.Özellikle biyoenformatik alanında uzmanlaşmayan araştırmacılar için kullanıcı dostu bir araçtır.Bu platform, filogenetik ağaç yapısı, bağlantı dengesizliği analizi, genetik çeşitlilik değerlendirmesi, seçici tarama analizi, akrabalık analizi, PCA, popülasyon yapısı analizi vb. dahil olmak üzere temel evrimsel genetik ile ilgili temel analizlere olanak tanır.
-
Hi-C tabanlı Genom Düzeneği
Hi-C, yakınlığa dayalı etkileşimleri ve yüksek verimli sıralamayı birleştirerek kromozom konfigürasyonunu yakalamak için tasarlanmış bir yöntemdir.Bu etkileşimlerin yoğunluğunun kromozomlar üzerindeki fiziksel mesafeyle negatif ilişkili olduğuna inanılmaktadır.Bu nedenle Hi-C verileri, bir taslak genomda bir araya getirilmiş dizilerin kümelenmesine, sıralanmasına ve yönlendirilmesine ve bunların belirli sayıda kromozom üzerine sabitlenmesine rehberlik edebilir.Bu teknoloji, popülasyona dayalı genetik haritanın yokluğunda kromozom düzeyinde genom birleşimini güçlendirir.Her genomun bir Hi-C'ye ihtiyacı vardır.
Platform: Illumina NovaSeq Platformu / DNBSEQ
-
Bitki/Hayvan De Novo Genom Dizilemesi
De Novosıralama, bir referans genomun yokluğunda PacBio, Nanopore, NGS vb. gibi sıralama teknolojileri kullanılarak bir türün tüm genomunun oluşturulması anlamına gelir.Üçüncü nesil dizileme teknolojilerinin okuma uzunluğundaki dikkate değer gelişme, yüksek heterozigotluk, yüksek oranda tekrarlayan bölgeler, poliploidler vb. gibi karmaşık genomların bir araya getirilmesinde yeni fırsatlar getirmiştir. Onlarca kilobaz düzeyinde okuma uzunluğuyla bu dizileme okumaları, tekrarlayan elemanların, anormal GC içeriğine sahip bölgelerin ve diğer oldukça karmaşık bölgelerin çözülmesi.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq Platformu
-
İnsan Bütün Ekzom Sıralaması
Tam ekzom dizilimi (WES), hastalığa neden olan mutasyonları tanımlamak için uygun maliyetli bir dizileme stratejisi olarak kabul edilir.Eksonlar tüm genomun yalnızca yaklaşık %1,7'sini kaplamasına rağmen, toplam protein fonksiyonlarının profilini doğrudan temsil eder.İnsan genomunda hastalığa bağlı mutasyonların %85'inden fazlasının protein kodlayan bölgede meydana geldiği rapor edilmiştir.
BMKGENE, çeşitli araştırma hedeflerine ulaşmak için mevcut farklı ekson yakalama stratejileriyle kapsamlı ve esnek insan tüm ekzom dizileme hizmetleri sunmaktadır.
Platform: Illumina NovaSeq Platformu
-
Spesifik Lokus Güçlendirilmiş Parça Sıralaması (SLAF-Seq)
Özellikle büyük ölçekli popülasyonda yüksek verimli genotipleme, fonksiyonel gen keşfi, evrimsel analiz vb. için genetik temel sağlayan genetik ilişkilendirme çalışmalarında temel bir adımdır. Derin tüm genomun yeniden dizilenmesi yerine, azaltılmış temsilli genom dizilimi (RRGS) ), genetik işaretleyici keşfinde makul verimliliği korurken, numune başına sıralama maliyetini en aza indirmek için tanıtıldı.Bu genellikle, azaltılmış gösterim kitaplığı (RRL) olarak adlandırılan, belirli boyut aralığında kısıtlama parçasının çıkarılmasıyla elde edilir.Spesifik lokus güçlendirilmiş fragman dizilimi (SLAF-Seq), referans genomu olsun veya olmasın SNP genotiplemesi için kendi geliştirdiği bir stratejidir.
Platform: Illumina NovaSeq Platformu -
Illumina ve BGI
Sentezle Sıralamaya (SBS) dayanan Illumina sıralama teknolojisi, dünya çapındaki sıralama verilerinin %90'ından fazlasının üretilmesinden sorumlu, küresel olarak benimsenen bir NGS yeniliğidir.SBS'nin prensibi, her dNTP eklendikçe floresan etiketli tersinir sonlandırıcıların görüntülenmesini ve ardından bir sonraki bazın dahil edilmesine izin vermek için bölünmesini içerir.Her sıralama döngüsünde geri döndürülebilir sonlandırıcıya bağlı dNTP'lerin dördü de mevcut olduğundan, doğal rekabet, birleştirme yanlılığını en aza indirir.Bu çok yönlü teknoloji, çeşitli genomik uygulamaların ihtiyaçlarını karşılayan hem tek okumalı hem de çift uçlu kitaplıkları destekler.Illumina dizilemenin yüksek verimli yetenekleri ve hassasiyeti, onu genom araştırmalarında bir mihenk taşı olarak konumlandırıyor ve bilim adamlarına, genomların karmaşıklıklarını eşsiz ayrıntı ve verimlilikle çözme gücü veriyor.
BGI tarafından geliştirilen DNBSEQ, sıralama maliyetlerini daha da azaltmayı ve verimi artırmayı başaran bir başka yenilikçi NGS teknolojisidir.DNBSEQ kitaplıklarının hazırlanması, DNA nanotoplarını (DNB) elde etmek için DNA parçalanmasını, ssDNA'nın hazırlanmasını ve yuvarlanan daire amplifikasyonunu içerir.Bunlar daha sonra katı bir yüzeye yüklenir ve ardından kombinatoryal Prob-Ankor Sentezi (cPAS) ile sıralanır.
Önceden hazırlanmış kütüphane sıralama hizmetimiz, müşterilerin sıralama kütüphanelerini çeşitli kaynaklardan (mRNA, tüm genom, amplikon ve diğerleri) hazırlamasını kolaylaştırır.Daha sonra bu kütüphaneler, Illumina veya BGI platformlarında kalite kontrol ve sıralama için sıralama merkezlerimize gönderilebilir.
