-
Metagenomik Dizileme -NGS
Metagenom, çevresel metagenom, insan metagenomu vb. gibi karışık bir organizma topluluğunun toplam genetik materyalinin bir koleksiyonunu ifade eder. Hem yetiştirilebilen hem de yetiştirilemeyen mikroorganizmaların genomlarını içerir.Metagenomik dizileme, çevresel örneklerden elde edilen karışık genomik materyalleri analiz etmek için kullanılan, tür çeşitliliği ve bolluğu, popülasyon yapısı, filogenetik ilişki, fonksiyonel genler ve çevresel faktörlerle korelasyon ağı hakkında ayrıntılı bilgi sağlayan moleküler bir araçtır.
Platform:Illumina NovaSeq Platformu
-
Metagenomik Sıralama-Nanopor
Metagenomik, çevresel örneklerden elde edilen karışık genomik materyalleri analiz etmek için kullanılan ve tür çeşitliliği ve bolluğu, popülasyon yapısı, filogenetik ilişki, fonksiyonel genler ve çevresel faktörlerle korelasyon ağı vb. konularda ayrıntılı bilgi sağlayan moleküler bir araçtır. Nanopore dizileme platformları yakın zamanda piyasaya sürülmüştür. metagenomik çalışmalaraOkuma uzunluğundaki olağanüstü performansı, özellikle metagenom derlemesi olmak üzere aşağı akış metagenomik analizini büyük ölçüde geliştirdi.Okuma uzunluğunun avantajlarından yararlanan Nanopore tabanlı metagenomik çalışma, av tüfeği metagenomiklerine kıyasla daha sürekli bir birleştirme elde edebiliyor.Nanopore bazlı metagenomiklerin mikrobiyomlardan tam ve kapalı bakteri genomlarını başarıyla ürettiği yayınlanmıştır (Moss, EL, ve diğerleri,Doğa Biyoteknolojisi, 2020)
Platform:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplikon Sıralaması-PacBio
16S ve 18S rRNA'daki hem yüksek düzeyde korunmuş hem de aşırı değişken bölgeleri içeren alt birim, prokaryotik ve ökaryotik organizmaların tanımlanması için mükemmel bir moleküler parmak izidir.Sıralamanın avantajından yararlanılarak bu amplikonlar, korunan kısımlara dayalı olarak hedeflenebilir ve hiper-değişken bölgeler, mikrobiyal çeşitlilik analizi, taksonomi, filogeni vb. kapsayan çalışmalara katkıda bulunarak mikrobiyal tanımlama için tamamen karakterize edilebilir. Tek moleküllü gerçek zamanlı (SMRT) PacBio platformunun ) dizilimi, tam uzunluktaki amplikonları (yaklaşık 1,5 Kb) kapsayabilen yüksek doğrulukta uzun okumaların elde edilmesini sağlar.Genetik alanın genişleyen görünümü, bakteri veya mantar topluluğundaki tür açıklamalarındaki çözünürlüğü büyük ölçüde arttırdı.
Platform:PacBio Devam II
-
16S/18S/ITS Amplikon Sıralaması-NGS
16S/18S/ITS amplikon dizilimi, hem yüksek derecede karşılıklı hem de aşırı değişken parçalar içeren temizlik genetik belirteçlerinin PCR ürünlerini araştırarak bir mikrobiyal topluluktaki filogeniyi, taksonomiyi ve tür bolluğunu ortaya çıkarmayı amaçlamaktadır.Bu mükemmel moleküler parmak izinin Woeses ve diğerleri (1977) tarafından tanıtılması, izolasyon gerektirmeyen mikrobiyom profillemeyi güçlendirir.16S (bakteri), 18S (mantar) ve Dahili kopyalanmış aralayıcının (ITS, mantarlar) sekanslanması, hem bol bulunan türlerin hem de nadir ve tanımlanamayan türlerin tanımlanmasına olanak tanır.Bu teknoloji, insan ağzı, bağırsaklar, dışkı vb. gibi çeşitli ortamlardaki farklı mikrobiyal kompozisyonun tanımlanmasında yaygın olarak uygulanan ve önemli bir araç haline gelmiştir.
Platform:Illumina NovaSeq Platformu
-
Bakteriyel ve Mantarsal Tüm Genomun Yeniden Sıralanması
Bakteriyel ve fungal tüm genomun yeniden dizilenmesi, bilinen bakteri ve mantarların genomlarını tamamlamak, aynı zamanda birden fazla genomu karşılaştırmak veya yeni organizmaların genomlarını haritalamak için kritik bir araçtır.Doğru referans genomların oluşturulabilmesi, mikrobiyal tanımlama ve diğer karşılaştırmalı genom çalışmalarının yapılabilmesi için bakteri ve mantar genomlarının tamamının dizilenmesi büyük önem taşımaktadır.
Platform:Illumina NovaSeq Platformu
-
Metatranskriptom Sıralaması
Metatranscriptome dizilimi, doğal ortamlardaki (yani toprak, su, deniz, dışkı ve bağırsak) mikropların (hem ökaryotlar hem de prokaryotlar) gen ekspresyonunu tanımlar. Özellikle, bu hizmetler karmaşık mikrobiyal toplulukların tam gen ekspresyon profilini, taksonomik analizi elde etmenize olanak tanır. türlerin çeşitliliği, farklı şekilde ifade edilen genlerin fonksiyonel zenginleştirme analizi ve daha fazlası.
Platform: Illumina NovaSeq Platformu
-
Mantar Genomu
Biyobelirteç Teknolojileri, spesifik araştırma hedefine bağlı olarak mantarın genom araştırması, ince genomu ve tam pene genomunu sağlar.Genom dizileme, birleştirme ve işlevsel açıklama, yüksek düzeyde genom birleşimi elde etmek için Yeni nesil dizileme + Üçüncü nesil dizilemenin birleştirilmesiyle elde edilebilir.Hi-C teknolojisi, kromozom seviyesinde genom birleşimini kolaylaştırmak için de kullanılabilir.
Platform:PacBio Devam II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq Platformu
-
Bakteri Tam Genomu
Biomarker Technologies, sıfır boşlukla bakteri genomunun tamamının oluşturulması konusunda sıralama hizmeti sunmaktadır.Bakterilerin tam genom yapısının ana iş akışı, üçüncü nesil sıralamayı, birleştirmeyi, işlevsel açıklamayı ve belirli araştırma hedeflerini karşılayan gelişmiş biyoinformatik analizi içerir.Bakteri genomunun daha kapsamlı bir profilinin çıkarılması, biyolojik süreçlerinin altında yatan temel mekanizmaların ortaya çıkarılmasını güçlendirir ve bu aynı zamanda yüksek ökaryotik türlerdeki genomik araştırmalar için değerli bir referans da sağlayabilir.
Platform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platformu
PacBio Devam II
