-
PacBio-Tam uzunlukta 16S/18S/ITS Amplikon Sıralaması
Amplicon (16S/18S/ITS) platformu, standartlaştırılmış temel analiz ve kişiselleştirilmiş analiz içeren mikrobiyal çeşitlilik proje analizinde uzun yıllara dayanan deneyimle geliştirilmiştir: temel analiz, mevcut mikrobiyal araştırmaların ana akım analiz içeriğini kapsar, analiz içeriği zengin ve kapsamlıdır, ve analiz sonuçları proje raporları halinde sunulur;Kişiselleştirilmiş analizin içeriği çeşitlidir.Kişiselleştirilmiş gereksinimleri gerçekleştirmek için numuneler seçilebilir ve parametreler temel analiz raporuna ve araştırma amacına göre esnek bir şekilde ayarlanabilir.Windows işletim sistemi, basit ve hızlı.
-
PacBio-Tam uzunlukta Transkriptom (Referans Olmayan)
Pacific Biosciences (PacBio) İzoform sıralama verilerini girdi olarak alan bu Uygulama, tam uzunluktaki transkript dizilerini (derleme olmadan) tanımlayabilir.Tam uzunluktaki dizilerin referans genoma göre haritalanmasıyla, transkriptler bilinen genler, transkriptler, kodlama bölgeleri vb. ile optimize edilebilir. Bu durumda, alternatif birleştirme vb. gibi mRNA yapılarının daha doğru tanımlanması elde edilebilir.NGS transkriptom dizileme verileriyle ortak analiz, transkript düzeyinde ifadede daha kapsamlı açıklama ve daha doğru nicelik belirlemeye olanak tanır; bu, aşağı yöndeki diferansiyel ifadeye ve fonksiyonel analize büyük ölçüde fayda sağlar.
-
Araç kitleri
BMKCloud, tıp, tarım, çevre vb. dahil olmak üzere çeşitli alanlardaki araştırmacıların geniş çapta güvendiği, genomik programlar için tek elden çözüm sağlayan lider bir biyoenformatik platformdur. BMKCloud, biyoenformatik analiz platformları ve araçları dahil olmak üzere entegre, güvenilir ve verimli hizmetler sunmaya kendini adamıştır. , bilgi işlem kaynakları, kamu veri tabanı, biyoenfortik çevrimiçi kurslar vb. BMKCloud, gen açıklaması, evrimsel genetik araçlar, ncRNA, veri kalite kontrolü, birleştirme, hizalama, veri çıkarma, mutasyonlar, istatistikler, şekil oluşturucu, dizi dahil olmak üzere sıklıkla kullanılan çeşitli biyoenformatik araçlara sahiptir. analiz vb.
-
küçük RNA
Küçük RNA'lar, miRNA, siRNA ve piRNA dahil olmak üzere ortalama 18-30 nt uzunluğa sahip kısa kodlayıcı olmayan RNA türüdür.Bu küçük RNA'ların, mRNA bozunması, translasyon inhibisyonu, heterokromatin oluşumu vb. gibi çeşitli biyolojik süreçlere dahil olduğu büyük ölçüde rapor edilmiştir. Küçük RNA dizileme analizi, hayvan/bitki gelişimi, hastalık, virüs vb. üzerine yapılan çalışmalarda yaygın olarak uygulanmıştır. Küçük RNA sıralama analizi platformu standart analiz ve ileri veri madenciliğinden oluşur.Standart analiz, RNA-seq verilerine dayanarak miRNA tanımlama ve tahminini, miRNA hedef gen tahminini, açıklama ve ekspresyon analizini gerçekleştirebilir.Gelişmiş analiz, özelleştirilmiş miRNA arama ve çıkarma, Venn diyagramı oluşturma, miRNA ve hedef gen ağı oluşturma olanağı sağlar.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS, Biyobelirteç Teknolojilerindeki zengin deneyime dayanarak geliştirilen, tam bir genom yeniden dizileme analiz platformudur.Bu kullanımı kolay platform, hem Illumina platformundan hem de BGI dizileme platformundan oluşturulan DNA dizileme verilerine uyan birkaç temel parametreyi basitçe ayarlayarak entegre bir analiz iş akışının hızlı bir şekilde sunulmasına olanak tanır.Bu platform, çok sınırlı bir sürede yüksek verimli veri analizine olanak tanıyan yüksek performanslı bilgi işlem sunucusu üzerinde konuşlandırılmıştır.Kişiselleştirilmiş veri madenciliği, mutasyona uğramış gen sorgulaması, PCR primer tasarımı vb. dahil olmak üzere standart analiz temelinde mevcuttur.
-
mRNA(Referans)
Transkriptom, genomik genetik bilgi ile biyolojik fonksiyonun proteomu arasındaki bağlantıdır.Transkripsiyonel seviye düzenlemesi, organizmaların en önemli ve en çok çalışılan düzenleme modudur.Transkriptom dizilimi, transkriptomu herhangi bir zamanda veya herhangi bir koşul altında, tek bir nükleotide kadar doğru bir çözünürlükle sıralayabilir. Gen transkripsiyonunun seviyesini dinamik olarak yansıtabilir, nadir ve normal transkriptleri eş zamanlı olarak tanımlayıp ölçebilir ve transkripsiyonun yapısal bilgisini sağlayabilir. spesifik transkriptleri örnekleyin.
Şu anda, transkriptom dizileme teknolojisi tarım bilimi, tıp ve hayvan ve bitki gelişimi düzenlemesi, çevresel adaptasyon, bağışıklık etkileşimi, gen lokalizasyonu, türlerin genetik evrimi ve tümör ve genetik hastalık tespiti dahil olmak üzere diğer araştırma alanlarında yaygın olarak kullanılmaktadır.
-
Metagenomik (NGS)
Bu analiz platformu, yılların deneyimine dayanarak av tüfeği metagenomik veri analizi için tasarlanmıştır.Veri işleme, tür düzeyindeki çalışmalar, gen işlevi düzeyindeki çalışmalar, metagenom gruplaması vb. dahil olmak üzere yaygın olarak ihtiyaç duyulan çeşitli metagenomik analizleri içeren entegre iş akışından oluşur. Ayrıca, gen ve tür sorgusu da dahil olmak üzere standart analiz iş akışında özelleştirilmiş veri madenciliği araçları mevcuttur. , parametre ayarı, kişiselleştirilmiş şekil oluşturma vb.
-
LncRNA
Uzun kodlamayan RNA'lar (lncRNA), uzunluğu 200 nt'den uzun olan ve proteinleri kodlayamayan bir transkript türüdür.Birikmiş kanıtlar, lncRNA'ların çoğunun işlevsel olma ihtimalinin çok yüksek olduğunu gösteriyor.Yüksek verimli sıralama teknolojileri ve biyoinformatik analiz araçları, lncRNA dizilerini ve konumlandırma bilgilerini daha verimli bir şekilde ortaya çıkarmamıza olanak tanır ve önemli düzenleyici işlevlere sahip lncRNA'ları keşfetmemize yol açar.BMKCloud, hızlı, güvenilir ve esnek lncRNA analizi elde etmek için müşterilerimize lncRNA dizileme analizi platformunu sunmaktan gurur duyar.
-
GWAS
Genom çapında ilişkilendirme çalışması (GWAS), belirli özelliklerle (fenotip) ilişkili genetik varyantları (genotip) tanımlamayı amaçlamaktadır.GWA çalışmaları, çok sayıda bireyin tüm genomunu çaprazlayan genetik belirteçleri araştırır ve popülasyon düzeyinde istatistiksel analiz yoluyla genotip-fenotip ilişkilerini tahmin eder.Tüm genomun yeniden dizilenmesi potansiyel olarak tüm genetik varyantları keşfedebilir.Fenotipik verilerle birleştirildiğinde GWAS, fenotiple ilgili SNP'leri, QTL'leri ve aday genleri tanımlamak için işlenebilir ve bu da modern hayvan/bitki ıslahını güçlü bir şekilde destekler.SLAF, genom çapında dağıtılmış belirteçleri (SNP) keşfeden, kendi geliştirdiği basitleştirilmiş bir genom sıralama stratejisidir.Bu SNP'ler moleküler genetik belirteçler olarak hedeflenen özelliklerle ilişkilendirme çalışmaları için işlenebilir.Genetik varyasyonlarla ilişkili karmaşık özelliklerin belirlenmesinde uygun maliyetli bir stratejidir.
-
Nanopore Tam uzunlukta transkriptomik
Organizmalardaki karmaşık ve değişken alternatif izoformlar, gen ekspresyonunu ve protein çeşitliliğini düzenleyen önemli genetik mekanizmalardır.Transkript yapılarının doğru tanımlanması, gen ekspresyonu düzenleme modellerinin derinlemesine incelenmesinin temelini oluşturur.Nanopore dizileme platformu, transkriptomik çalışmayı başarıyla izoform seviyesine getirdi.Bu analiz platformu, hem gen düzeyinde hem de transkript düzeyinde niteliksel ve niceliksel analizler gerçekleştiren Nanopore platformunda oluşturulan RNA-Seq verilerini referans genom bazında analiz etmek için tasarlanmıştır.
-
circ-RNA
Dairesel RNA (circRNA), yakın zamanda geliştirme, çevresel direnç vb. ile ilgili düzenleyici ağlarda hayati bir rol oynadığı keşfedilen, kodlayıcı olmayan bir RNA türüdür. Doğrusal RNA moleküllerinden, örneğin mRNA, lncRNA, 3' ve 5'den farklıdır. circRNA'nın uçları, onları eksonükleazın sindiriminden koruyan ve çoğu doğrusal RNA'dan daha stabil olan dairesel bir yapı oluşturacak şekilde birleştirilir.CircRNA'nın gen ifadesinin düzenlenmesinde çeşitli işlevlere sahip olduğu bulunmuştur.CircRNA, miRNA süngeri olarak bilinen, miRNA'yı rekabetçi bir şekilde bağlayan ceRNA olarak performans gösterebilir.CircRNA dizileme analizi platformu, circRNA yapısını ve ekspresyon analizini, hedef tahminini ve diğer RNA molekülü türleri ile ortak analizi güçlendirir
-
BSA
Toplu Segregant Analizi platformu, tek adımlı standart analiz ve özelleştirilmiş parametre ayarıyla gelişmiş analizden oluşur.BSA, fenotiple ilişkili genetik belirteçleri hızlı bir şekilde tanımlamak için kullanılan bir tekniktir.BSA'nın ana iş akışı şunları içerir: 1. son derece zıt fenotiplere sahip iki grup bireyin seçilmesi;2. iki DNA yığını oluşturmak için tüm bireylerin DNA, RNA veya SLAF-seq'inin (Biomarker tarafından geliştirilmiştir) havuzda toplanması;3. referans genoma karşı veya aradaki diferansiyel dizilerin tanımlanması; 4. aday bağlı bölgelerin ED ve SNP indeks algoritması ile tahmin edilmesi;5. Aday bölgelerdeki genlerin fonksiyonel analizi ve zenginleştirilmesi vb. Genetik işaretleyici taraması ve primer tasarımı dahil olmak üzere verilerde daha gelişmiş madencilik de mevcuttur.
