Öne Çıkanlar
Bu iki saatlik web seminerine, mahsul genomiği alanında altı uzmanı davet etmiş olmak bizim için büyük bir onurdur.Konuşmacılarımız yakın zamanda yayınlanan iki Rye genomik çalışması hakkında derinlemesine yorum yapacaklar.Doğa Genetiği:
1. Kromozom ölçeğinde genom birleşimi, çavdar biyolojisi, evrimi ve tarımsal potansiyeli hakkında bilgi sağlar
2. Yüksek kaliteli bir genom derlemesi, çavdarın genomik özelliklerini ve tarımsal açıdan önemli genleri vurgular
Ayrıca, Biyobelirteç Teknolojileri Kıdemli Ar-Ge Bilim Adamının de novo genom derlemesindeki deneyimini paylaşacak olmasından mutluluk duyuyoruz.
Gündem
09:00 CET
Karşılama konuşması
Zheng Hong-kun
Kurucu ve CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Pekin Üniversitesi İleri Tarım Bilimleri Okulu Başkanı
09:15
Yüksek kaliteli referans genom dizisi kullanılarak çavdar, tritikale ve buğdayın iyileştirilmesinin arttırılması
Bu web seminerinde, Prof. Wang bize triticeae genom araştırmasının mevcut durumu hakkında genel bir güncelleme verdi ve kısa süre önce Nature Genetics'de yayınlanan ve tüm araştırmayı tanıtan, Çavdar genom çalışmaları üzerine yapılan iki olağanüstü çalışmanın başarısını ve çığır açan gelişmelerini gösterdi. çalışmalara liderlik eden ve katkıda bulunan gruplar.
09:25
Tahıl genomiği @ IPK Gatersleben
Triticeae kabilesinin tahıl otları, uzun süredir mahsul geliştirme ve yetiştirmede sıcak nokta olarak kabul edilen ılıman bölgelerde önemli bir besin kaynağı olmuştur.Yetiştirilen tüm türler arasında bu kabile, büyük genom boyutları, yüksek TE içeriği, poliploidi vb. gibi son derece karmaşık genomik özellikleriyle ünlüdür. Bu oturumda Prof. Nils Stein bize IPK Gatersleben ve tahılın mevcut durumu hakkında genel bir giriş yaptı. genomik araştırma@IPK Gatersleben.
09:35
Kromozom ölçeğinde genom birleşimi, çavdar biyolojisi, evrimi ve tarımsal potansiyeli hakkında bilgi sağlar
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Bitki Genetiği ve Mahsul Planı Araştırma Enstitüsü(IPK)Çavdar (Secale gravee L.), iklime son derece dayanıklı bir tahıl ürünüdür, introgresif hibridizasyon yoluyla geliştirilmiş buğday çeşitleri üretmek için yaygın olarak kullanılır ve hibrit yetiştirmeyi mümkün kılmak için gerekli gen repertuarının tamamına sahiptir.Çavdar allogamdır ve yakın zamanda evcilleştirilmiştir; bu da kültür çavdarlarının çeşitli ve sömürülebilir bir yabani gen havuzuna erişmesini sağlar.Çavdarın tarımsal potansiyelini daha da artırmak için, 7,9 Mbp çavdar genomunun kromozom ölçeğinde açıklamalı bir düzeneğini ürettik ve bir dizi moleküler genetik kaynak kullanarak kalitesini kapsamlı bir şekilde doğruladık.Bu kaynağın uygulamalarını geniş bir araştırma yelpazesiyle gösteriyoruz.Kültür çavdarının yabani akrabalardan eksik genetik izolasyonu, genom yapısal evrim mekanizmaları, patojen direnci, düşük sıcaklık toleransı, hibrit yetiştirme için doğurganlık kontrol sistemleri ve çavdar-buğday introgresyonlarının verim faydaları hakkındaki bulguları sunuyoruz.
10:05
Yüksek kaliteli bir genom derlemesi, çavdarın genomik özelliklerini ve tarımsal açıdan önemli genleri vurgular
Çavdar, değerli bir gıda ve yem bitkisi, buğday ve tritikale ıslahı için önemli bir genetik kaynak ve otlarda etkili karşılaştırmalı genomik çalışmalar için vazgeçilmez bir materyaldir.Burada seçkin bir Çin çavdar çeşidi olan Weining çavdarının genomunu sıraladık.Birleştirilmiş bitişikler (7,74 Gb), tahmini genom boyutunun (7,86 Gb) %98,47'sini oluştururken, bitişiklerin %93,67'si (7,25 Gb) yedi kromozoma atanmıştır.Tekrarlayan elementler, bir araya getirilen genomun %90,31'ini oluşturdu.Daha önce dizilenen Triticeae genomlarıyla karşılaştırıldığında Daniela, Sumaya ve Sumana retrotranspozonları çavdarda güçlü bir genişleme gösterdi.Weining topluluğunun daha ileri analizleri, genom çapında gen kopyaları ve bunların nişasta biyosentezi genleri üzerindeki etkileri, karmaşık prolamin lokuslarının fiziksel organizasyonları, erken yönelim özelliğinin altında yatan gen ekspresyon özellikleri ve çavdardaki varsayılan evcilleştirmeyle ilişkili kromozomal bölgeler ve lokuslar üzerindeki etkilerine yeni bir ışık tuttu.Bu genom dizisi, çavdar ve ilgili tahıl mahsullerinin genomik ve ıslah çalışmalarını hızlandırmayı vaat ediyor.
10:35
Genom de novo derlemesi için zorluklar, çözümler ve gelecek
Yüksek kaliteli genom, genomik çalışmanın temelidir.Dizileme ve algoritmadaki hızlı gelişme, çok daha basit ve daha verimli bir genom derlemesini güçlendirmiş olsa da, araştırma hedeflerinin derinleşmesiyle birlikte derlemenin doğruluğu ve bütünlüğüne yönelik gereksinimler de artıyor.Bu konuşmada genom birleştirmedeki mevcut popüler teknolojileri birkaç başarılı vakayla tartışacağım ve gelecekteki gelişmelere bir göz atacağım.
Gönderim zamanı: Ocak-08-2022