Nanopore Tabanlı Tam Uzunlukta Transkriptom Sıralaması
Nanopore dizileme, nükleotidlerin DNA sentezi olmadan doğrudan okunması ve onlarca kilobazda uzun okumalar üretmesi açısından kendisini diğer dizileme platformlarından ayırır.Bu, tam uzunluktaki transkriptlerin doğrudan okunmasını ve transkriptomik çalışmalardaki zorlukların üstesinden gelinmesini sağlar.
√ Düşük diziye özgü önyargı
√ Gen yapısı çalışmaları için cDNA'nın tam uzunlukta okunması
√ Aynı sayıda transkripti kapsamak için daha az veri gerekir
√ Gen başına çoklu izoformların tanımlanması
√ İzoform düzeyinde ifade niceliği
Tipik Biyoenformatik Boru Hattı
Biyobelirteç Teknolojileri ile Son Başarılı Vakalar
1. Tam uzunluktaki transkriptomların karşılaştırmalı analizleri Gnetum luofuense kök gelişim dinamiklerini ortaya koyuyor
Dergi: Genetikte Sınırlar
Yayınlanma: Mart 2021
Anahtar Kelimeler: Minion |Alternatif birleştirme |APA |lncRNA |Diferansiyel olarak ifade edilen transkriptler
Tam metni oku
2. Türler arası heterogreftlerde küçük RNA'ların sürgünlerden köklere tek yönlü hareketi
Dergi: Doğa Bitkileri
Yayınlanma: Ocak 2021
Anahtar kelimeler: Nanogözenek |Illumina |tam uzunlukta mobil mRNA tespiti
3. Kuşkonmaz köklerinin tam uzunlukta transkriptom analizi, arbüsküler mikorizal mantarların neden olduğu tuz toleransının moleküler mekanizmasını ortaya koymaktadır.
Dergi: Çevresel ve Deneysel Botanik
Yayınlanma: Ocak 2021
Anahtar Kelimeler: Minion |Diferansiyel olarak ifade edilen transkriptler |Transkripsiyon faktörleri |Alternatif ekleme
4. Kuraklık Stresine Yanıt Olarak Gül (Rosa chinensis) Köklerinin ve Yapraklarının Fizyolojik Karakteristik Değişiklikleri ve Tam Uzunlukta Transkriptomu
Dergi: Bitki ve Hücre Fizyolojisi
Yayınlanma: Ekim 2020
Anahtar Kelimeler: PromethION |Diferansiyel olarak ifade edilen transkriptler |Fonksiyonel tahmin |Eklenmiş izoformlar |TF ve lncRNA
5. Arabidopsis transkriptomunun PacBio ve nanopore bazlı RNA diziliminin analizi ve kapsamlı karşılaştırması
Dergi: Bitki Yöntemi
Yayınlanma: Nisan 2020
Anahtar Kelimeler: GridION |Promethion |PacBio'nun devamı |Illumina NovaSeq |Genom hizalaması |Transkript tanımlama |Alternatif birleştirme |SSR |LncRNA |İzoform ölçümü
Haberler ve Öne Çıkanlar Biomarker Technologies ile en son başarılı vakaları paylaşmayı, yeni bilimsel başarıların yanı sıra çalışma sırasında uygulanan öne çıkan teknikleri yakalamayı amaçlamaktadır.
Gönderim zamanı: Ocak-08-2022