MİKROBİYAL
Biyokömür ile bakteriyel uyumluluk ve immobilizasyon, tebukonazol bozunmasını, toprağın mikrobiyom bileşimini ve işleyişini iyileştirdi
Tam uzunlukta 16S amplikon dizilimi |PacBio HiFi |Alfa çeşitliliği |Beta çeşitliliği
Bu çalışmada PacBio ile tam uzunlukta 16S amplikon dizilimi ve Biomarker Technologies tarafından biyoinformatik analiz sağlandı.
Öne Çıkanlar
Biochar hareketsizleştirilmiş tebukonazol parçalayıcı bakteri Alcaligenes faecalis WZ-2, serbest parçalayıcı tür WZ-2 ile karşılaştırıldığında biyolojik parçalanma verimliliği ve tebukonazolle kirlenmiş toprak üzerindeki etkileri açısından incelenmiştir.
1. Biyokömürle hareketsizleştirilmiş WZ-2, topraktaki tebukonazol yarı ömrünü 18,7 günden 13,3 güne düşürerek serbest WZ-2'ye kıyasla tebukonazolde daha etkili bir bozunma göstermiştir.
2. Biochar ile immobilize edilmiş WZ-2, üreaz, dehidrojenaz ve invertaz vb. dahil olmak üzere doğal toprak mikrobiyal enzim aktivitelerini geri kazanabildi.
3. Biyokömürle hareketsizleştirilmiş WZ-2 ile işlenmiş topraktaki tam uzunlukta 16S dizilimi ile belirlenen mikrobiyal profil, bu sistemin tebukonazol kontaminasyonu altında bakteriyel topluluk yapısını iyileştirerek toprak sağlığını iyileştirebileceğini güçlü bir şekilde destekledi.
Deney (Sıralamayla ilgili)
Gruplandırma: CK: Doğal toprak;T: Tebukonazol eklenmiş toprak;S: Tebuconazole, serbest WZ-2 türüne sahip toprak içeriyordu;BC: Tebuconazole, biyokömür içeren toprak;BCS: Tebuconazole, biyokömürle immobilize edilmiş WZ-2 içeren toprak içeriyordu.
Örnekleme: 16S rDNA primerleri ile güçlendirilmiş toplam toprak DNA ekstraksiyonu
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') ve 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA),tam uzunlukta 16S rDNA'yı temsil eden
Sıralama platformu: PacBio RS II
Sıralama stratejisi: CCS HIFI okumaları
Veri analizi:BMKCloudBiyoinformatik Platform Oluşturma, Japon balıklarını balık fizyolojisi ve evrimi için mükemmel bir genetik model sistemi haline getiriyor.
Sonuç
Toprak mikrobiyal topluluk yapısı 16S rDNA dizilimi ile belirlendi.Her sistemdeki tür çeşitliliğini ortaya çıkarmak için Chao1, Ace, Shannon ve Simpson endekslerini içeren OTU zenginlik ve alfa çeşitlilik indeksi değerlendirildi.60 günlük inkübasyonun ardından tüm endeksler benzer eğilim gösterdi; yani tebukonazol, topraktaki tür zenginliği ve çeşitliliğinde azalmaya neden olabilir.Ancak WZ-2 suşunun eklenmesiyle toprak bakteri topluluğu hem zenginlik hem de çeşitlilik açısından kısmen kurtarılmıştır.BC, BCS ve CK arasında sınırlı bir fark gözlendi; bu, biyokömür ve biyokömürle hareketsizleştirilmiş WZ-2'nin toprağın biyolojik sağlığını etkili bir şekilde iyileştirebileceğini gösteriyor.
Bu çalışmada gruplar arasındaki beta çeşitliliğini göstermek amacıyla Aritmetik Ortalamalı Ağırlıksız Çift Grup Yöntemi (UPGMA) uygulanmıştır.Aşağıdaki şekilde gösterildiği gibi, BC, BSC ve CK, grup T ve S'ye kıyasla daha benzer mikrobiyal bileşim modelini paylaştı; bu, ayrıca tebukonazol ile kirlenmiş toprak biyoremediasyonuna biyokömürün eklenmesinin topraktaki mikrobiyal topluluğun geri kazanılmasını büyük ölçüde kolaylaştırabileceğini gösterdi.
Figür.Farklı tedavi altında bakteri topluluğunun filum düzeyinde UPGMA kümelenmesi
Referans
Sun, Tong ve ark."Biyokömür ile bakteriyel uyumluluk ve immobilizasyon, tebukonazol bozunmasını, toprak mikrobiyom bileşimini ve işleyişini iyileştirdi."Tehlikeli Maddeler Dergisi398 (2020): 122941.
Haberler ve Öne Çıkanlar Biomarker Technologies ile en son başarılı vakaları paylaşmayı, yeni bilimsel başarıların yanı sıra çalışma sırasında uygulanan öne çıkan teknikleri yakalamayı amaçlamaktadır.
Gönderim zamanı: Ocak-08-2022