GENETİK ŞİFRE
Biyokütle mahsulü Miscanthus lutarioriparius genomunun kromozom ölçekli montajı ve analizi
Nanogözenek dizilimi |Illumina |Merhaba-C |RNA dizilimi |Filogeni
Bu çalışmada Biomarker Technologies, Nanopore dizilimi, de novo genom derlemesi, Hi-C destekli birleştirme vb. konularda teknik destek sağlamıştır.
Soyut
MiscanthusÇok yıllık bir bitki olan rizomatoz, yüksek biyokütlesi ve stres toleransı nedeniyle biyoenerji üretimi için büyük bir potansiyele sahiptir.Kromozom ölçeğinde bir derleme rapor ediyoruzMiscanthus lutarioripariusOxford Nanopore dizilimi ve Hi-C teknolojilerini birleştirerek genom.2,07 Gb'lik düzenek, 1,71 Mb'lik bitişik N50 ile genomun %96,64'ünü kapsıyor.Sentromer ve telomer dizileri sırasıyla 19 kromozomun tamamı ve 10. kromozom için birleştirilir.M. lutarioriparius'un allotetraploid kökeni, sentromerik uydu tekrarları kullanılarak doğrulanmıştır.Sorguma göre tetraploid genom yapısı ve çeşitli kromozomal yeniden düzenlemeler açıkça gösterilmiştir.Tandem kopya genlerM. lutarioripariusSadece stres tepkisi açısından değil, aynı zamanda hücre duvarı biyosentezi açısından da işlevsel olarak zenginleştirilmiştir.Hastalık direnci, hücre duvarı biyosentezi ve metal iyon taşınmasıyla ilgili gen aileleri büyük ölçüde genişlemiş ve gelişmiştir.Bu ailelerin genişlemesi, dikkat çekici özelliklerin geliştirilmesi için önemli bir genomik temel olabilir.M. lutarioriparius.
Genom birleşiminin temel istatistikleri
Figür.M. lutarioriparius genom derlemesine genel bakış
Haberler ve Öne Çıkanlar Biomarker Technologies ile en son başarılı vakaları paylaşmayı, yeni bilimsel başarıların yanı sıra çalışma sırasında uygulanan öne çıkan teknikleri yakalamayı amaçlamaktadır.
Gönderim zamanı: Ocak-05-2022