Genom çapında birliktelik analizi
1.Hizmet Avantajları
● Çok Sayıda Proje Vakası: 2009 yılındaki kuruluşundan bu yana BMKGENE, popülasyon GWAS araştırmalarında yüzlerce tür projesini tamamlamış, araştırmacılara 100'den fazla makale yayınlamalarında yardımcı olmuş ve kümülatif etki faktörü 500'e ulaşmıştır.
● Profesyonel analistler.
● Kısa analiz döngüsü.
● Doğru veri madenciliği.
2. Hizmet Özellikleri
| Tip | Nüfus Ölçeği | Sıralama stratejisi ve derinliği |
| SLAF-GWAS | Örnek sayısı ≥200 | Genom boyutu < 400M, ref genomlu, WGS önerilir |
| Genom boyutu ≤ 1G, 100K Etiketler ve 10X | ||
| 1G ≤ Genom boyutu ≤ 2G, 200K Etiketler ve 10X | ||
| Genom boyutu > 2G, 300K Etiketler ve 10X | ||
| WGS-GWAS | Örnek sayısı ≥200 | Her numune için 10X |
3. Malzeme Seçimi
Farklı çeşitler, alt türler, yerel türler/gen bankaları/karışık aileler/vahşi kaynaklar
Farklı çeşitler, alt türler, yerel çeşitler
Üvey kardeş ailesi/öz kardeş ailesi/vahşi kaynaklar
4. Biyobilgi Analizi
● Genom çapında ilişkilendirme analizi
● Önemli SNP'nin analizi ve taranması
● Aday genin işlevsel açıklaması
5. Hizmet İş Akışı
Deney tasarımı
Numune teslimatı
RNA ekstraksiyonu
Kütüphane inşaatı
Sıralama
Veri analizi
Satış sonrası hizmetler
A.Fenotip QC
Frekans dağılımı histogramı
Fenotip istatistikleri
B.Birliktelik analizi (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ Grafiği
Manhattan Arsa
| Yıl | Günlük | IF | Başlık |
| 2022 | NC | 17.69 | Ağaç şakayık Paeonia ostii'nin giga kromozomları ve giga genomunun genomik temeli |
| 2015 | NP | 7.43 | Evcilleştirme ayak izleri, soya fasulyesinde tarımsal öneme sahip genomik bölgelerin temelini oluşturur |
| 2018 | MP | 9.32 | Dünya çapındaki kolza tohumu koleksiyonunun tüm genom yeniden dizilenmesi, ekotip farklılıklarının genetik temelini ortaya koyuyor |
| 2022 | HR | 7.29 | Genom çapında ilişkilendirme analizi, karpuz çekirdeği boyutunun doğal çeşitliliğine ilişkin moleküler bilgiler sağlar |
