Mantar Genomu
Hizmet Avantajları
● Farklı araştırma hedefleri için birden fazla sıralama stratejisi mevcuttur
● 10.000'den fazla pene-komple genomun bir araya getirilmesiyle mantar genomu birleştirme konusunda oldukça deneyimli.
● Daha spesifik araştırma ihtiyaçlarını karşılayan profesyonel satış sonrası teknik destek ekibi.
Hizmet Özellikleri
| Hizmet | Sıralama Stratejisi | Kalite garantilidir | Tahmini dönüş süresi |
| Mantar ince haritası | Illumina 50X+Nanogözenek 100X | Devamlı N50≥2 Mb | 35 iş günü |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Mantar pene-tam haritası | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Kromozom sabitleme oranı >%90 | 45 iş günü |
Biyoinformatik analizler
● Ham veri kalite kontrolü
● Genom birleşimi
● Genom bileşen analizi
● Gen işlevi açıklaması
● Karşılaştırmalı genomik analiz
Numune Gereksinimleri ve Teslimat
Örnek Gereksinimler:
İçinDNA ekstraktları:
| Örnek tip | Miktar | Konsantrasyon | Saflık |
| DNA ekstraktları | > 1,2 µg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Doku örnekleri için:
| Örnek tip | Önerilen numune tedavisi | Numune saklama ve sevkiyat |
| Tek Hücreli Mantar | Mayayı mikroskop altında gözlemleyin ve üstel evrelerinde toplayın Kültürü (yaklaşık 3-4.5e9 hücre içeren) 1.5 veya 2 ml'lik bir eppendorfa aktarın.(Buza devam edin) Bakterileri toplamak ve süpernatantı dikkatlice çıkarmak için tüpü 14000 g'de 1 dakika boyunca santrifüjleyin. Tüpü kapatın ve bakterileri sıvı nitrojende en az 1-3 saat dondurun.Tüpü -80°C buzdolabında saklayın. | Numuneleri 3-4 saat boyunca sıvı nitrojende dondurun ve uzun süreli rezervasyon için sıvı nitrojende veya -80 derecede saklayın.Kuru buzla numune gönderimi gereklidir. |
| Makro Mantar | Aktif büyüme aşamasındaki doku tavsiye edilir. Dokuyu endotoksin içermeyen suyla, ardından %70 ethonal ile durulayın. Numuneyi kriyo tüplere kaydedin. |
Hizmet İş Akışı
Numune teslimatı
Kütüphane inşaatı
Sıralama
Veri analizi
Satış sonrası hizmetler
1. Mantar genomik bileşenlerine ilişkin sirk diyagramı
2. Karşılaştırmalı genomik analiz: Filogenetik ağaç
