BMKGENE, araştırmacılara daha yüksek verim ve daha kaliteli uzun okuma sıralama hizmetleri sunmamıza yardımcı olan PacBio'nun gelişmiş sıralayıcısı Revio'nun kullanıma sunulduğunu duyurmaktan gurur duyar.
*Neden PacBio Revio'yu Seçmelisiniz?
*PacBio Revio uygulamaları
•Genom dizilimi
1.De Novogenom derlemesi- Revio, süper büyük ve karmaşık genomların yüksek kalitede dizilenmesine ve birleştirilmesine katkıda bulunarak genetik çeşitlilik, gen yapısı ve işlevi hakkında kritik bilgiler sağlar.
2.T2T genomu- Revio, Hi-C gibi tekniklerle birleştirildiğinde, geleneksel genomların kalitesini artırabilir ve daha fazla türün T2T düzeyinde referans genomu edinmesine yardımcı olabilir, böylece araştırmacıların popülasyonlar içindeki ve arasındaki genetik çeşitliliği daha iyi anlamalarını sağlar.
3.Tüm genom dizilimi- Revio, özellikle büyük ölçekli genetik popülasyonlar için SNP, Indel, SV, CNV vb. dahil olmak üzere tüm genomların yapısı ve işlevi hakkında kapsamlı bilgiler sağlayabilir.
4.Pan-genom dizilimi- Revio, bir pan-genom oluşturmak için bir türün birden fazla genomunun verimli ve ucuz bir şekilde dizilenmesi ve bir araya getirilmesi için idealdir ve genomik çeşitlilik ve evrim hakkında kritik bilgiler sağlar.
•Transkriptom dizilimi
1.Tam uzunlukta transkript sıralaması- Uzun okuma uzunluklarıyla Revio, yüksek kaliteli tam uzunlukta transkript sıralamasına olanak tanıyarak alternatif birleştirme, gen füzyonu ve izoform ifadesine ilişkin kapsamlı bilgiler sağlar.
2. Büyük ölçekli numunelerin tam uzunluktaki ifade profili- Revio, büyük ölçekli örneklerde gen ekspresyon seviyelerinin son derece doğru bir şekilde ölçülmesini sağlayabilir ve gen düzenlemesi ve hücre farklılaşmasına ilişkin önemli bilgiler sağlar.
3. Tek hücreli transkriptom dizilimi- Revio, yüksek çözünürlüklü tek hücreli transkriptomik verileri sağlayarak araştırmacıların hücresel heterojenliği incelemesine ve nadir hücre türlerini tanımlamasına olanak tanır.
•Mikrobiyal sıralama
1.16S tam uzunlukta sıralama- Revio, yüksek kaliteli 16S rRNA dizilimini mümkün kılarak mikrobiyal topluluk bileşimi ve işlevi hakkında ayrıntılı bilgiler sağlar.
2.Uzun okumalı amplikon sıralaması- Revio, araştırmacıların karmaşık ekosistemlerdeki mikrobiyal çeşitliliği incelemesine olanak tanıyan uzun süreli amplikon dizilimi için çok uygundur.