● Yüksek Deneyimli: BMK'de hücre kültürü, doku, vücut sıvısı vb. dahil olmak üzere çeşitli örnek türlerini kapsayan 200.000'den fazla örnek işlenmiştir ve çeşitli araştırma alanlarını kapsayan 7.000'den fazla mRNA-Seq projesi kapatılmıştır.
● Sıkı kalite kontrol sistemi: Numune hazırlama, kütüphane hazırlama, sıralama ve biyoinformatik dahil tüm aşamalarda temel kalite kontrol noktaları, yüksek kaliteli sonuçlar sağlamak amacıyla yakın izleme altındadır.
● Çeşitli araştırma hedeflerini gerçekleştirmek amacıyla işlev açıklamaları ve zenginleştirme çalışmaları için birden fazla veri tabanı mevcuttur.
● Satış sonrası hizmetler: Proje takibi, sorun giderme, sonuçlarla ilgili Soru-Cevap vb. dahil olmak üzere, projenin tamamlanmasından sonra 3 ay süreyle geçerli olan satış sonrası hizmetler.
Kütüphane | Sıralama stratejisi | Önerilen veriler | Kalite kontrol |
Poli A zenginleştirilmiş | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nükleotidler:
Kons.(ng/μl) | Miktar (μg) | Saflık | Bütünlük |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Jel üzerinde sınırlı miktarda protein veya DNA kontaminasyonu gösteriliyor veya hiç gösterilmiyor. | Bitkiler için: RIN≥6,5; Hayvanlar için: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; sınırlı veya taban çizgisi yüksekliği yok |
Doku: Ağırlık(kuru):≥1 gr
*5 mg'dan küçük dokular için flaş dondurulmuş (sıvı nitrojen içinde) doku örneğinin gönderilmesini öneririz.
Hücre süspansiyonu:Hücre sayısı = 3×106- 1×107
*Dondurulmuş hücre lizatını göndermenizi öneririz.Hücre sayımının 5×105'ten küçük olması durumunda.
Kan örnekleri:Hacim≥1 ml
Mikroorganizma:Kütle ≥ 1 g
Kap: 2 ml santrifüj tüpü (Kalay folyo tavsiye edilmez)
Örnek etiketleme: Grup+kopya örneğin A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Gönderi:
Biyoenformatik
Ökaryotik mRNA sıralama analizi iş akışı
Biyoenformatik
ØHam veri kalite kontrolü
ØReferans genom hizalaması
ØTranskript yapı analizi
Øİfade niceliği
ØDiferansiyel ifade analizi
Øİşlev açıklaması ve zenginleştirme
1.mRNA Veri Doygunluğu eğrisi
2.Diferansiyel ifade analizi-Volkan grafiği
3.DEG'lere ilişkin KEGG açıklaması
4.DEG'lerde GO sınıflandırması