-
Kromatin İmmünopresipitasyon Sıralaması (ChIP-seq)
ChIP-Seq, histon modifikasyonu, transkripsiyon faktörleri ve diğer DNA ile ilişkili proteinler için DNA hedeflerinin genom çapında profillenmesini sağlar.Spesifik protein-DNA komplekslerini kurtarmak için kromatin immüno-çökeltmesinin (ChIP) seçiciliğini, geri kazanılan DNA'nın yüksek verimli dizilimi için yeni nesil dizilemenin (NGS) gücüyle birleştirir.Ek olarak, protein-DNA kompleksleri canlı hücrelerden geri kazanıldığından, bağlanma bölgeleri farklı hücre tipleri ve dokularda veya farklı koşullar altında karşılaştırılabilir.Uygulamalar, transkripsiyonel düzenlemeden gelişim yollarına, hastalık mekanizmalarına ve ötesine kadar uzanır.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Tüm genom bisülfit dizilemesi
Sitozinde (5-mC) beşinci pozisyonda DNA metilasyonu, gen ekspresyonu ve hücresel aktivite üzerinde temel bir etkiye sahiptir.Anormal metilasyon kalıpları, kanser gibi çeşitli durumlar ve hastalıklarla ilişkilendirilmiştir.WGBS, tek baz çözünürlükte genom çapında metilasyonu incelemek için altın standart haline geldi.
Platform: Illumina NovaSeq6000
-
Yüksek Verimli Dizileme ile Transpozaz Erişimli Kromatin Testi (ATAC-seq)
ATAC-seq, gen ekspresyonunun global epigenetik kontrolü için önemli olan genom çapında kromatin erişilebilirliğinin analizi için yüksek verimli bir sıralama yöntemidir.Sıralama adaptörleri, hiperaktif Tn5 transpozazı ile açık kromatin bölgelerine yerleştirilir.PCR amplifikasyonundan sonra bir dizileme kitaplığı oluşturulur.Tüm açık kromatin bölgeleri, yalnızca bir transkripsiyon faktörünün bağlanma bölgeleriyle veya belirli bir histonla modifiye edilmiş bölgeyle sınırlı değil, belirli bir uzay-zaman koşulu altında elde edilebilir.
-
Azaltılmış Temsil Bisülfit Sıralaması (RRBS)
DNA metilasyon araştırması, hastalık araştırmalarında her zaman sıcak bir konu olmuştur ve gen ekspresyonu ve fenotipik özelliklerle yakından ilişkilidir.RRBS, DNA metilasyon araştırması için doğru, verimli ve ekonomik bir yöntemdir.Bisülfit dizilimi ile birlikte enzimatik bölünme (Msp I) ile promotör ve CpG ada bölgelerinin zenginleştirilmesi, yüksek çözünürlüklü DNA metilasyon tespiti sağlar.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
