Ürünler

DNA/RNA Sıralaması – Nanopore Sıralayıcı

ONT dizilemesi, nanogözeneklere dayalı, tek moleküllü, gerçek zamanlı bir elektrik sinyali sıralama teknolojisidir; her platformun sıralama prensibi aynıdır.Çift sarmallı DNA/RNA, biyofilme gömülü nano gözenekli proteine bağlanacak ve biyofilmin her iki tarafındaki voltaj farkının etkisi altında motor proteinin önderliğinde çözülecek, DNA/RNA iplikçikleri nano gözenekli kanal proteininden belirli bir hızda geçecek oran.DNA/RNA zincirindeki farklı bazların kimyasal özelliklerinin farklılığından dolayı, tek bir baz veya DNA molekülü nanopore kanalından geçtiğinde farklı elektrik sinyallerinin değişmesine neden olacaktır.Bu sinyallerin tespit edilmesi ve bunlara karşılık getirilmesi yoluyla karşılık gelen baz türleri hesaplanabilir ve dizinin gerçek zamanlı tespiti tamamlanabilir.

Bize Ulaşın

Hizmet Detayları

Demo Sonucu

Hizmet Detayları Özellikler

platformu	Kütüphane Boyutu	Teorik Veri Verimi (Hücre Başına)	Tek Tabanlı Doğruluk	Uygulamalar
Nanogözenek	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/Hücre	%85-92	SV çağrısı, De novo, Tam uzunlukta sıralama, Iso-Seq, Gen açıklaması, DNA metilasyonunun tespiti

Hizmet Avantajları

● PacBio dizileme platformunda çeşitli türlerle binlerce kapalı projeyle 5 yıldan fazla deneyim.
● BMKGENE, çift platformlu RNA/DNA sertifikasına sahip Oxford Nanopore'un resmi ortağıdır.
● Tam ekipmana ve yeterli sıralama verimine sahip ana akım sıralayıcı modelleri mevcuttur.
● Nanopore platformunu temel alan 10'dan fazla hayvan ve bitki Denovo araştırması, uluslararası tanınmış dergilerde yayınlanmıştır.

Örnek Gereksinimler

Örnek tip

Miktar

Konsantrasyon(Qubit ®)

Hacim

Saflık

Diğerleri

genomik DNA

Veri Gereksinimine Bağlıdır

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

260 nm'de net zirve, kontaminasyon yok

Konsantrasyonun Qubit ve Qubit/Nanopore ≤ 2 ile ölçülmesi gerekir

Toplam RNA

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; kirlilik yok

RIN değeri ≥7,5

Hizmet İş Akışı

örnek hazırlama

Kütüphane inşaatı

Sıralama

Veri analizi

Proje teslimi

Öncesi: DNA/RNA Sıralaması – Illumina Sıralayıcı

Sonraki: Spesifik Lokus Güçlendirilmiş Parça Sıralaması (SLAF-Seq)

DNA Örneğinin Veri Kalitesi Değerlendirmesi

Tablo 1. Temiz verilere ilişkin istatistikler.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	temizN50Len	temizN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25.90	28.014	15.764	23.090	143.181	9