Ürünler

Illumina ve BGI

Sentezle Sıralamaya (SBS) dayanan Illumina sıralama teknolojisi, dünya çapındaki sıralama verilerinin %90'ından fazlasının üretilmesinden sorumlu, küresel olarak benimsenen bir NGS yeniliğidir.SBS'nin prensibi, her dNTP eklendikçe floresan etiketli tersinir sonlandırıcıların görüntülenmesini ve ardından bir sonraki bazın dahil edilmesine izin vermek için bölünmesini içerir.Her sıralama döngüsünde geri döndürülebilir sonlandırıcıya bağlı dNTP'lerin dördü de mevcut olduğundan, doğal rekabet, birleştirme yanlılığını en aza indirir.Bu çok yönlü teknoloji, çeşitli genomik uygulamaların ihtiyaçlarını karşılayan hem tek okumalı hem de çift uçlu kitaplıkları destekler.Illumina dizilemenin yüksek verimli yetenekleri ve hassasiyeti, onu genom araştırmalarında bir mihenk taşı olarak konumlandırıyor ve bilim adamlarına, genomların karmaşıklıklarını eşsiz ayrıntı ve verimlilikle çözme gücü veriyor.

BGI tarafından geliştirilen DNBSEQ, sıralama maliyetlerini daha da azaltmayı ve verimi artırmayı başaran bir başka yenilikçi NGS teknolojisidir.DNBSEQ kitaplıklarının hazırlanması, DNA nanotoplarını (DNB) elde etmek için DNA parçalanmasını, ssDNA'nın hazırlanmasını ve yuvarlanan daire amplifikasyonunu içerir.Bunlar daha sonra katı bir yüzeye yüklenir ve ardından kombinatoryal Prob-Ankor Sentezi (cPAS) ile sıralanır.

Önceden hazırlanmış kütüphane sıralama hizmetimiz, müşterilerin sıralama kütüphanelerini çeşitli kaynaklardan (mRNA, tüm genom, amplikon ve diğerleri) hazırlamasını kolaylaştırır.Daha sonra bu kütüphaneler, Illumina veya BGI platformlarında kalite kontrol ve sıralama için sıralama merkezlerimize gönderilebilir.

Bize Ulaşın

Hizmet Detayları

Demo Sonucu

Özellikler

●Platformlar:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten ve BGI-DNB-T7

●Sıralama modları:PE50, PE100, PE150, PE250

●Sıralamadan önce kitaplıkların kalite kontrolü

●Veri dağıtımını ve QC'yi sıralama:Q30 okumalarının çoğullaması ve filtrelenmesinden sonra QC raporunun ve ham verilerin fastq formatında teslimi.

Hizmet Avantajları

●Sıralama hizmetlerinin çok yönlülüğü:müşteri şerit, akış hücresi veya veri miktarına göre sıralama yapmayı seçebilir.

●Platformların çok yönlülüğü:DNB kütüphaneleri Illumina platformlarına aktarılabilir

●Illumina sıralama platformunda kapsamlı deneyim:çeşitli türlerle binlerce kapalı projeyle.

●Sıralama QC raporunun teslimi:sıralama projesinin kalite ölçümleri, veri doğruluğu ve genel performansı ile.

●Olgun sıralama süreci:kısa dönüş süresi ile.

●Titiz Kalite Kontrolü: Sürekli olarak yüksek kaliteli sonuçların teslimini garanti etmek için sıkı kalite kontrol gereklilikleri uyguluyoruz.

Örnek Gereksinimler*

Kısmi Şerit Sıralaması

Veri Miktarı (X)	Konsantrasyon (qPCR/nM)	Hacim
X ≤ 50 Gb	≥ 2 nm	≥ 20 ul
50 Gb ≤ X < 100 Gb	≥ 3 nM	≥ 20 ul
X ≥ 100 Gb	≥ 4 nM	≥ 20 ul

Tek Şeritli (Illumina)

platformu	Konsantrasyon (qPCR/nM)	Hacim
HiSeq X On	≥ 2 nm	≥ 20 ul
NovaSeq 6000 SP	≥ 1 nm	≥ 25 ul
NovaSeq 6000 S4	≥ 1,5 nM	≥ 25 ul
NovaSeq X	≥ 1,5 nM	≥ 25 ul
BGI-DNBSEQ-T7	≥ 1,5 nM	≥ 25 ul

Konsantrasyon ve toplam miktarın yanı sıra uygun bir pik paterni de gereklidir.

Numuneleriniz başlangıç malzemesi gereksinimlerini karşılamıyorsa lütfen bizimle iletişime geçin.

Bize Ulaşın

Hizmet İş Akışı

Kütüphane kalite kontrolü

Sıralama

Veri kalitesi kontrolü

Proje teslimi

Öncesi: DNA/RNA dizilimi -PacBio Sıralayıcı

Sonraki: DNA/RNA Sıralaması – Nanopore Sıralayıcı

Kütüphane Kalite Kontrol raporu

Sıralama, kütüphane miktarının değerlendirilmesi ve parçalanma öncesinde kütüphanenin kalitesine ilişkin bir rapor sunulur.

QC raporunun sıralanması

Tablo 1. Verilerin sıralamasına ilişkin istatistikler.

Örnek kimliği	BMKID	Ham okumalar	Ham Veri (bp)	Temiz okumalar (%)	Ç20(%)	Q30(%)	GC(%)
C_01	BMK_01	22.870.120	6.861.036.000	96.48	99.14	94.85	36.67
C_02	BMK_02	14.717.867	4.415.360.100	96.00	98.95	93.89	37.08