BMKMANU S1000 Uzaysal Transkriptom
BMKMANU S1000 Uzamsal Transkriptom Teknik Şeması
BMKMANU S1000'in Avantajları
1) Hücre altı çözünürlük: Her bir yakalama alanı, 2,5 µm çapında ve nokta merkezleri arasında 5 µm aralıkta olan >2 milyondan fazla uzamsal Barkodlu Nokta içeriyordu; bu, hücre altı çözünürlükle (5 µm) uzamsal transkriptom analizine olanak sağlıyordu.
2) Çok seviyeli çözünürlük analizi: Çeşitli doku özelliklerini optimum çözünürlükte çözmek için 100 μm ila 5 μm arasında değişen esnek çok seviyeli analiz.
3) Kapsamlı transkriptom profili oluşturma: Tüm doku slaytından alınan transkriptler, hedef gen sayısı ve hedef alan sınırlaması olmaksızın analiz edilebilir.
Hizmet Özellikleri
| Kütüphane | Sıralama stratejisi | Veri Çıkışı önerilir |
| S1000 cDNA kütüphanesi | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb/örnek |
Örnek Gereksinimler
| Örnek | Sayı | Boyut | RNA Kalitesi |
| OCT gömülü doku bloğu | 2-3 blok/örnek | Yaklaşık.6,8x6,8x6,8 mm3 | RIN≥7 |
Numune hazırlama kılavuzu ve hizmet iş akışı hakkında daha fazla ayrıntı için lütfen bir uzmanla konuşmaktan çekinmeyin.BMKGENE uzmanı
Hizmet İş Akışı
Deney tasarımı
Numune teslimatı
Ön deney
Uzamsal barkodlama
Kütüphane inşaatı
Sıralama
Veri analizi
Satış sonrası hizmetler
BMKMANU S1000 tarafından oluşturulan veriler, BMKGENE tarafından bağımsız olarak tasarlanan ve aşağıdakileri içeren "BSTMatrix" yazılımı kullanılarak analiz edilir:
1) Gen ekspresyonu matrisi üretimi
2) HE görüntü işleme
3) Analiz için alt üçüncü taraf yazılımlarla uyumlu
4) Çevrimiçi “BSTViewer” farklı çözünürlüklerde görselleştirme sonuçları elde etmenize yardımcı olur.
1.Nokta kümeleme
2.Uzaysal dağılım
Nnot: Çözünürlükseviye=13 (100 µm, sol); 7 (50 µm, Sağ)
3.Marker ifadesi bolluğu kümeleme ısı haritası
4.Örnekler arası veri analizi
