Ginagamit ang Heatmap drawer para sa pagguhit ng heat map, na maaaring mag-filter, mag-normalize at cluster matrix data. Ito ay kadalasang ginagamit para sa cluster analysis ng antas ng expression ng gene sa pagitan ng iba't ibang sample.
Pag-attach ng mga biological function sa mga sequence sa FASTA file sa pamamagitan ng pag-align ng mga sequence sa database, kabilang ang NR, KEGG, COG, SwissProt, TrMBL, KOG, Pfam.
Ang BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) ay isang algorithm at program para maghanap ng mga rehiyon na may katulad na biological sequence.Inihahambing nito ang mga sequence na ito sa sequence datbases at kinakalkula ang statistical significance.Ang BLAST ay binubuo ng apat na uri ng mga tool batay sa uri ng pagkakasunud-sunod: blastn, lastp, blastx at tblastn.