Maliit na RNA sequencing-Illumina
Mga tampok
● Pagpili ng laki ng RNA bago ang paghahanda sa library
● Bioinformatic analysis na nakasentro sa hula ng miRNA at sa kanilang mga target
Mga Kalamangan sa Serbisyo
●Komprehensibong pagsusuri ng bioinformatics:pagpapagana ng pagkakakilanlan ng parehong kilala at nobelang miRNA, pagkilala sa mga target ng miRNA at kaukulang functional annotation at pagpapayaman sa maraming database (KEGG, GO)
●Mahigpit na Kontrol sa Kalidad: nagpapatupad kami ng mga pangunahing control point sa lahat ng yugto, mula sa paghahanda ng sample at library hanggang sa sequencing at bioinformatics.Tinitiyak ng maselang pagsubaybay na ito ang paghahatid ng patuloy na mataas na kalidad na mga resulta.
●Suporta sa Post-Sales: Ang aming pangako ay umaabot nang lampas sa pagkumpleto ng proyekto na may 3-buwan na panahon ng serbisyo pagkatapos ng pagbebenta.Sa panahong ito, nag-aalok kami ng follow-up ng proyekto, tulong sa pag-troubleshoot, at mga sesyon ng Q&A upang matugunan ang anumang mga query na nauugnay sa mga resulta.
●Malawak na Dalubhasa: na may track record ng matagumpay na pagsasara sa maraming proyekto ng sRNA na sumasaklaw sa mahigit 100 species sa iba't ibang domain ng pananaliksik, ang aming koponan ay nagdadala ng maraming karanasan sa bawat proyekto.
Mga Sample na Kinakailangan at Paghahatid
| Aklatan | Platform | Inirerekomendang data | Data QC |
| Napili ang laki | Illumina SE50 | 10M-20M na pagbabasa | Q30≥85% |
Mga Sample na Kinakailangan:
Nucleotides:
| Conc.(ng/μl) | Halaga (μg) | Kadalisayan | Integridad |
| ≥ 80 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Limitado o walang protina o kontaminasyon ng DNA na ipinapakita sa gel. | RIN≥6.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitado o walang baseline elevation |
● Mga halaman:
Root, Stem o Petal: 450 mg
Dahon o Binhi: 300 mg
Prutas: 1.2 g
● Hayop:
Puso o Bituka: 450 mg
Viscera o Utak: 240 mg
Kalamnan: 600 mg
Mga buto, Buhok o Balat: 1.5g
● Mga Arthropod:
Mga Insekto: 9g
Crustacea: 450 mg
● Buong dugo: 2 tubo
● Mga cell: 106 mga selula
● Serum at Plasma:6 mL
Inirerekomendang Paghahatid ng Sample
Lalagyan:
2 ml centrifuge tube (Hindi inirerekomenda ang tin foil)
Sample na pag-label: Pangkat+kopya hal. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Pagpapadala:
1. Dry-ice: Ang mga sample ay kailangang ilagay sa mga bag at ibaon sa dry-ice.
2.RNAstable tubes: Ang mga sample ng RNA ay maaaring patuyuin sa RNA stabilization tube(eg RNAstable®) at ipadala sa room temperature.
Daloy ng Trabaho ng Serbisyo
Eksperimento na disenyo
Paghahatid ng sample
Pagkuha ng RNA
Paggawa ng aklatan
Pagsusunod-sunod
Pagsusuri sa datos
Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta
Bioinformatics
Pagkilala sa miRNA: istraktura at lalim
Differential expression ng miRNA - hiearchical clustering
Functional na annotation ng target ng differentially expressed miRNAs
Galugarin ang mga pagsulong sa pananaliksik na pinadali ng mga serbisyo ng sRNA sequencing ng BMKGene sa pamamagitan ng isang na-curate na koleksyon ng mga publikasyon.
Chen, H. et al.(2023) 'Ang mga impeksyon sa viral ay pumipigil sa saponin biosynthesis at photosynthesis sa Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) ' Ang halaman na FYVE domain-containing protein FREE1 ay iniuugnay sa mga bahagi ng microprocessor upang pigilan ang miRNA biogenesis ', mga ulat ng EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) 'The MicroRNA Ame-Bantam-3p Controls Larval Pupal Development by Targeting the Multiple Epidermal Growth Factor-like Domains 8 Gene (megf8) in the Honeybee, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Integrated na Pagsusuri ng MiRNA at Mga Gene na Kaugnay ng Meat Quality ay Nagpapakita na ang Gga-MiR-140-5p ay Nakakaapekto sa Intramuscular Fat Deposition sa Mga Manok', Cellular Physiology at Biochemistry, 46(6), pp. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.
